據估計,因抗體質量不佳,生命科學領域每年的損失達到8億美元。同時,這也造成了無數的實驗失敗,浪費了寶貴的樣本和科學家的青春。盡管科學界已經意識到這個問題,但目前仍然缺乏抗體驗證的整體框架。
為了刺激研究界實現更高標準的抗體重復性,國際抗體驗證工作組(IWGAV)近日出臺了一套指南。這些指南發表在9月5日的《Nature Methods》雜志上,強調了抗體驗證需要針對應用和背景來開展。
這篇題為“A Proposal for Validation of Antibodies”的文章是由IWGAV的數名成員發表的,包括工作組主席、瑞典皇家理工學院的微生物學教授Mathias Uhlén。文章提出了五點,以指導特定應用中的抗體驗證。
? 遺傳策略:測定對照細胞或組織中的相關信號,這些對照中的目標基因已利用CRISPR或RNAi等技術敲除或敲低。
? 正交策略:利用不依賴抗體的方法定量多個樣品,然后檢查依賴抗體和不依賴抗體這兩種定量之間的相關性。
? 獨立抗體策略:利用兩個或更多的獨立抗體來識別目標蛋白上的不同表位,再通過比較和定量分析來確認特異性。
? 表達標記蛋白:修飾內源的目標基因,增加親和標簽或熒光蛋白的序列。標記蛋白的信號可與基于抗體的檢測相關聯。
? 免疫捕獲加上質譜分析:將免疫捕獲與MS分析相結合,以確定與純化的抗體直接作用的蛋白質,以及可能與目標蛋白形成復合物的蛋白質。
這篇文章還對生產商和使用者提出建議,以確保長期的抗體重復性。作者們建議使用者在自己特定的應用或樣品中,至少運用上面的一種策略來開展驗證。同時,他們還建議使用者按照一定的形式報告,包含貨號、批號和RRID(研究資源標識符),以確保研究中使用的任何抗體可被明確識別。
同時,作者們也向生產商提出了類似的建議,至少運用一種策略來驗證,并提供盡可能多的抗體信息,如鑒定檢測中的抗體濃度、細胞提取物的濃度、抗體生產所用的免疫原、抗體-表位的親和力、緩沖液配方等。
“這篇文章邁出了重要的第一步,有望制定出廣泛接受的抗體驗證標準,確保生命醫學研究使用高質量且一致的抗體,”Uhlén博士表示。“我們期待抗體用戶、出版商、資助機構和生產商的反饋,以幫助加強這個初步建議,并確保這些基本工具的可靠性。”
在文章發布之后,抗體生產商之一 – 賽默飛世爾公司承諾,它將按照IWGAV的建議來驗證其抗體的特異性。賽默飛表示,它將很好地遵循這個指南,并借助其領先的質譜、CRISPR和siRNA平臺來開展驗證。此外,對于通過新標準的抗體,公司會在網站上標注,以表示它通過特異性檢測。
賽默飛世爾的生命科學部門總裁Peter Silvester表示:“賽默飛世爾很高興看到國際抗體驗證工作組的第一個建議。我們相信,這些標準將有助于對抗用戶在使用這些關鍵工具時面臨的挑戰。我們承諾按照IWGAV的標準來測試我們的抗體,這證明了我們對科學的承諾,以及我們提供特異抗體的使命。”
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