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  • 發布時間:2020-06-15 15:38 原文鏈接: Neogen農業基因組學解決方案(三)

    豬的基因組學解決方案
    GeneSeek 的豬基因組學解決方案為窺探豬的遺傳結構打開了一個重要的窗口,包括是否易感染治療昂貴的疾病以及繁殖中對想要性狀的鎖定。

    GeneSeek豬全基因組低密度微珠芯片
    該微珠芯片提供約 10,000個 SNP,包括經常使用的 USDA血統和身份 SNP、用于識別品種的 SNP以及和結構穩定性相關的 SNP。其它性狀標記包括:

    ? 應激綜合癥基因(HAL)                                     ?  紅細胞生成素受體—和 子宮容量以及
    ?  酸肉基因(RN)*                                             同胎生仔數相關
    ?  大腸桿菌腹瀉抗性基因(F4 ab/ac)*                  ? 與生長和肉質性狀關聯的 6 個特定     
    ?  PRRS抵抗性/耐受性                                             SNP:采食量/飼料轉化率/增重/瘦肉
    ?  雌激素受體基因(ESR)*:對大白豬或長白              率/脂肪含量和肉質。
    豬的產仔數性狀有較大影響                                     基因:MC4R、HMGA、CCKAR、CAST、PRKAG

    *這些選配的、需要許可證的試驗需要額外的檢測費

    豬SNP60微珠芯片
    這一微珠芯片包括 64,000多個SNP,遍布豬的整個基因組,可以高效率且高通量檢測。

    SeekGain性能標記:GeneSeek的豬生產性狀測試程序
    GeneSeek提供經過驗證的豬生產性狀 DNA 標記測試,使用的是來自七個獨特基因的信息,這
    些基因的影響范圍如下:

    ?  攝食量和飼料轉化率           ?  同胎生仔數
    ?  增重                                (雌激素受體)
    ?  精肉增長                          ?  同胎生仔數
    ?  脂肪含量                           (紅細胞生成素)
    ?  肉質

    額外試驗
    GeneSeek還為豬提供眾多基因和疾病診斷法,包括:
    ?  應激綜合癥基因(PSS)
    ?  豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)和豬圓環病毒 2 型(PCV2)
    ?  SeekSire血統測試
    ?  SeekTrace 來源驗證程序
    ?  大腸桿菌 F4ab/ac 遺傳測試

    綿羊的基因組學解決方案
    綿羊的基因組學測試可以提醒生產商注意一些問題,而如果不進行測試的話,很可能再過幾年他們才能發現這些問題。也可用它來為畜群的繁殖做出正確的決定。GeneSeek的綿羊基因組學測試解決方案包括:

    ?  全基因組選擇
    ?  確定遺傳優勢
    ?  識別數量性狀基因座(QTL)
    ?  比較遺傳學研究

    可用的Illumina基因分型試驗
    ?  綿羊SNP50微珠芯片—54,000多個大信息量的 SNP標記
    ?  山羊 SNP50 微珠芯片—53,000多個 SNP標記
    ?  還有定制的微珠芯片

    綿羊遺傳試驗
    ?  綿羊進行性肺炎病毒            ?  羊蜘蛛腿綜合征
    (OPPV)易感性                   ?  肌生成抑制蛋白
    ?  癢病易感性                        ?  SNP 譜系

    馬和狗的基因組學解決方案
    這些遺傳檢測可以確定馬或狗是否具有想要的繁育特性,另外,如果對馬或者狗的血統有所懷疑的時候,經過這樣的檢測證明它們的血統。
    ?  馬 SNP70微珠芯片—70,000 個大信息量的 SNP標記
    ?  狗 HD微珠芯片—170,000 多個 SNP 標記
    ? 血統驗證—公畜確認

    針對研發的基因組學解決方案
    GeneSeek為研發提供眾多基因組學解決方案,從小鼠到植物基因分型。

    小鼠通用基因分型試驗

    MEGA小鼠通用基因分型試驗(MUGA)提供 76,000 個根據Illumina Infinium 平臺建立的SNP標記。
    這些SNP 標記分布于整個小鼠基因組。為了讓這些基因分型結果能夠得到最高效的應用,實驗設計讓每一個被測試的SNP都獨立的提供了最大量的標記信息。

    Mega MUGA的設計標準優化了雜合子區域的檢測以及純合子區域內單倍型之間的區分。該實驗的等位基因頻率和單倍型是從八個實驗室小鼠品系得出的,這些品系是基因交互協作的基礎。

    定制基因分型微珠芯片
    有了這些微珠芯片,便可查詢幾乎任何物種的任何SNP。Infinium微珠芯片化學技術的高度重復性和靈活性,是定制研究的理想選擇。

    植物基因分型
    GeneSeek可為任何規模的定制項目提供基因分型服務:種子質量控制、轉基因分析、全基因組掃描或標記輔助選擇。

    GeneSeek持續開發新方法和系統,用于從各類型植物中進行樣本收集、儲存、DNA提取和基因分型。從一個很小的葉片中,GeneSeek就能夠使用專用的分子應用技術來分析感興趣的目標。

    定制基因分型解決方案:標記輔助選擇(MAS)和管理(MAM)
    GeneSeek 也提供強大而精確的質譜法用于SNP分型。GeneSeek 用靈活的可定制方案來提供常規基因分型服務(從 1 個到1,000 個SNP),幫助一些項目使用遺傳信息來進行選擇和繁育,這之中沒有樣本數目的限制。不管樣本必須每天、每周還是每月進行基因分型,GeneSeek都可以提供靈活的周期和可用于任何應用的數據質量。
    GeneSeek MAS項目的關鍵特性包括:
    ?  以質譜分析法為基礎的檢測系統可提供靈敏、準確且快速的分析。
    ?  便于使用的多重試驗設計以及優化軟件節省研究時間,并將效率最大化。


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