*用RT陰性對照檢測是否被基因組DNA污染。如果RT陰性對照的PCR結果也顯示同樣條帶,則需要用DNase I重新處理樣品。
*在PCR反應中,非特異的起始擴增將導致產生非特異性結果。在低于引物Tm 2至5℃的溫度下進行退火,降低鎂離子或是目的DNA的量將減少非特異性結果的產生。
*由于mRNA剪切方式的不同,根據選擇引物的不同將導致產生不同的RT-PCR結果。