PCR的三個反應步驟反復進行，使DNA擴增量呈指數上升。反應最終的DNA擴增量可用y=(1+X)n計算。Y代表DNA片段擴增后的拷貝數，X表示平均每次的擴增效率，n代表循環次數。平均擴增效率的理論值為100%，實際反應初期，靶序列DNA片段的增加呈指數形式，隨著PCR產物的逐漸積累，被擴增的DNA片段不再呈指數增加，而進入線性增長期或靜止期，即出現“停滯效應”，使平均效率達不到理論值
