PCR擴增無目的條帶或者非特異性擴增，影響因素是多方面的，需要耐心地分析，如模板結構與質量、反應條件、引物設計等等。
當今發展出各色各樣的PCR擴增技術，各色各樣的高溫聚合酶，就是來解決PCR擴增中遇到的擴不出，擴增效率低的問題。如巢式PCR就是擴增拷貝數很低的基因片段。通過提高模板質量、優化反應條件等方面找到對策，或者有必要時重新設計引物，最好在實驗時設置對照來判定原因。如果您懷疑引物的問題，請您首先測定您溶解的引物的OD值，看實驗時加入的引物量是否正確。如果量是正常的，請您告訴我司您的引物編號，我們會復查留存樣品。如不明原因，我們免費為您重新合成一次。如果仍然不能擴增，請您查找其它原因。多數情況下我們復檢引物質量都沒有問題，因為我們在引物出售前已經嚴格把好質量關。