最近,發表在PNAS的一項研究檢查了南非地區爆發的廣泛耐藥結核病流行株LAM4 / KZN的進化和流行病學歷史。
該菌株首次報道于2005年在夸祖魯-納塔爾省的圖格拉渡輪,此后已在全省廣泛傳播。這項新研究確定了促進XDR-TB菌株疫情爆發的關鍵宿主,病原體和環境因素,以及可以采取的早期發現和遏制未來流行病的步驟。
由哥倫比亞大學領導的這項研究由來自南非,美國和挪威的多機構研究人員組成,他們使用基因組,空間和蛋白質模型來回答這種菌株何時何地出現以及如何進行廣泛傳播。
研究人員將該菌株的地理起源定位在與莫桑比克和eSwatini接壤的一個農村地區,耐藥結核病的高發病率位于距首次報告LAM4 / KZN爆發地點400公里處。結果還表明,該病毒株在1990年代初出現,并快速獲得了關鍵的有利突變。此外,研究表明,這種菌株的快速和廣泛傳播具有周期性的城鄉遷移現象。
文章作者,來自哥倫比亞大學梅爾曼公共衛生學院流行病學助理教授,首席研究員Barun Mathema博士說:“我們的結果表明,這種XDR-TB菌株的世紀出現時間比公共衛生學相關報告中記載的還要早大約12年出。我們的研究表明,必須結合多種環境以及病原體的因素,才能使這些病原體持續傳播并跨越地理屏障。”
Mathema觀察到:“將全基因組測序用于公共衛生監測可以使我們能夠更好地了解檢測疫情前期的流行病學狀況,并為早期識別和遏制病原體提供策略。”
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