摘 要:RFLP是隨著生物技術若干領域的發展而產生的一種分子標記技術, 用該技術可作出 植物的RFLP圖譜,并應用于植物遺傳和育種研究。本文簡單的對RFLP技術的基本原理、技術 步驟及其優缺點作了簡單的概況。
關鍵詞: RFLP;作物研究;應用
中圖分類號: S5.032 文獻標識碼:A 文章編號: 1008-7508( 2007)03-0105-03
一、基本原理
限制性核酸內切酶(restriction end nuclease)能夠識別DNA雙鏈上特異的堿基序列并能 將之切斷。不同的限制性核酸內切酶有各自特異的識別序列。在同源染色體相應的DNA區段 ,用一種限制性核酸內切酶消化,由于堿基組成不同,就會產生不同長度的酶切片段,然后 用標記好的相應的DNA探針與這些片段雜交,顯示出的圖譜就可以反映出基因組DNA堿基序列 組 成是否存在差異。這一技術的基礎是通過限制性核酸內切酶切片段長度多態性來揭示DNA堿 基序 列組成的異同,因而稱為限制性片段長度多態性(Restriction Fragment Length Polymorp hism,縮寫為RFLP)技術。
二、RFLP技術的基本步驟
這一技術主要包括三大步驟:
1、靶DNA的準備 先將基因組DNA抽提出來,選用合適的限制性核酸內切酶酶解基因組DNA, 將酶解出來的具有各種長度的DNA片段在瓊脂糖凝膠電泳分離,使其按片段的長短排列,將D NA片段變性后轉移至硝酸纖維膜或尼龍膜上,稱印跡(Southernb1ot)轉移,并在80℃烘烤 或用長波紫外線照射,將DNA固定在膜上。
2、核酸探針的標記 將準備作為探針的DNA片段純化(這些DNA片段可以是基因組DNA的 一個片段,或是cDNA,或是人工合成的寡核苷酸),用放射性元素(如α-32p)或非放射 性元素(如Dig-dUTP等)標記,經純化后再用。
3、雜交顯示 將標記好的探針與硝酸纖維膜或尼龍膜上的單鏈核酸雜交,洗膜去除未雜交 的標記探針后,進行放射自顯影或加入酶的底物進行顯色反應,再對顯示出來的譜帶進行分 析。
三、RFLP技術的優點及注意的問題
1、RFLP技術的優點
第一,標記數目可以是無限的:RFLP揭示的是DNA水平自然變異,其數目幾乎是無限的。
第二,大部分標記為共顯性:表現RFLP的位點一般是單一序列,每個位點通常有兩個等位基 因(其顯性)。遵循孟德爾式遺傳,因而RFLP標記圖也可用傳統的基因標圖方法來構建。
第三,任何生育期都可預測,不受環境影響:DNA分子水平標記沒有發育階段或器官的特異 性,不受環境條件及基因互作的影響。
第四,高度變異性:每一植株都會有大量的多態性。通常只要有一次有性雜交,一個作圖群 體就能構建一個較豐富的RFLP圖譜。
2、在做RFLP分析技術時,有幾個問題是需要引起密切注意:
第一,作為檢測對象的DNA分子必須保持大分子,在抽提DNA的過程中避免人為地將DNA分子 機械性切割成小片段的DNA,否則最終顯示的RFLP圖譜可能是一種假象;
第二,在用限制性內切酶消化大分子DNA時,要使DNA被完全消化,否則所得的結果也不可靠 ;
第三,被消化的DNA濃度不能太高;
第四,電泳時要用低壓電泳;
第五,雜交前探針必須充分變性;
第六,要根據探針標記的情況以及探針與靶DNA間序列互補的程度和G、C的含量來掌握雜交 和洗膜的條件;
第七,作放射自顯影時,要根據雜交后膜上的放射活性等因素決定曝光的時間。