項新的研究揭示了為一些RNA添加化學標簽的重要細胞修飾過程中的化學步驟。這一過程被干擾可能會導致人類患神經元疾病、糖尿病和癌癥。由美國賓夕法尼亞州立大學化學家領導的一個研究小組已經對一種促進細菌RNA修飾的蛋白質進行了成像,從而重建這一過程。相關論文15日發表在《自然》雜志上。
轉運RNA(tRNA)是“讀取”遺傳密碼并將其翻譯成氨基酸序列以合成蛋白質的RNA。在某些tRNA的特定位置添加一個化學標簽——甲基硫基團,可以提高它們將信使RNA翻譯成蛋白質的能力。當這種被稱為甲硫基化的修飾過程沒有正確發生時,錯誤可能會被合并到產生的蛋白質中,這會導致人類患神經元疾病、癌癥和2型糖尿病的風險增加。
“甲硫基化反應在細菌、植物和動物中普遍存在。”賓夕法尼亞州立大學生物化學家、領導該研究小組的霍華德·休斯醫學研究所研究員斯奎爾·布克說,“在這項研究中,我們確定了一種名為MiaB的蛋白質的結構,以更好地了解它在促進細菌這一重要修飾過程中的作用。”
來自細菌擬桿菌的MiaB蛋白是自由基SAM(S-腺苷甲硫氨酸)酶家族的成員。自由基SAM酶通常使用它們自己的鐵硫簇將SAM分子轉化為有助于推進反應的“自由基”。與大多數其他自由基SAM酶不同,MiaB包含兩個鐵硫簇:一個自由基SAM簇和一個輔助簇,大多數復雜的化學作用都發生在這里。
使用SAM分子和tRNA在甲基硫化反應過程中的幾個點對MiaB進行成像,使研究人員能夠推斷修飾過程中的化學步驟。
首先,SAM分子將其甲基“捐獻”給MiaB上的輔助鐵硫簇。研究顯示,來自SAM的一個甲基與MiaB輔助鐵硫簇上的一個硫原子相連。這個甲基和它附著在MiaB上的硫最終會轉移到tRNA,但在tRNA接受甲硫基之前會發生一些額外的步驟。
添加一個電子會將第二個SAM分子分裂成自由基。該自由基最終從tRNA中獲取一個氫原子,該氫原子被MiaB上的甲硫基取代。
研究人員表示,MiaB輔助簇上的甲硫基導致了tRNA在甲硫基化過程中該點的幾何形狀發生了變化,變成了更多的四面體形狀,氫在最佳位置被自由基拔出,而甲硫基在最佳位置進行后續轉移。
這些步驟的結果是添加了甲硫基和成功修飾的tRNA。
下一步,研究人員希望確定輔助簇在每次更替后是如何重建的。他們還研究了在人類的修飾過程中發揮類似作用的其他蛋白質。
近日,中國農業科學院作物科學研究所野生稻保護與利用創新研究組聯合國內外科研團隊系統解析了水稻長鏈非編碼RNA的多組學特征與表型效應,揭示了其驅動表型變異與育種潛力。相關研究成果發表在《細胞研究》(Ce......
中國科學院動物研究所研究員趙方慶團隊開發基于納米孔RNA直接測序技術與深度學習策略的RNA修飾圖譜解析算法ORCA。相關研究發表于《自然-通訊》。基于深度學習的RNA修飾系統識別與注釋模型 ......
現代生命離不開三樣東西:DNA、蛋白質和RNA。但問題是,它們不可能同時出現。蛋白質就像建筑工人和建筑材料,沒有蛋白質,DNA無法復制;DNA就像建筑藍圖,沒有DNA,蛋白質無法構建。為了解開這個“先......
據27日《自然》雜志報道,英國倫敦大學學院(UCL)化學家通過模擬早期地球的條件,首次實現了RNA與氨基酸的化學連接。這一難題自20世紀70年代以來一直困擾著科學家,如今,這一突破性成果為解答生命起源......
美國芝加哥大學團隊開發了一種更為靈敏的液體活檢技術,該方法利用RNA而不是傳統的DNA來檢測癌癥。這一創新方法在使用患者血液樣本進行測試時,識別出早期結直腸癌的準確率達到95%,顯著優于現有的非侵入性......
由新加坡科技研究局基因組研究所領導的科學家團隊,發布了迄今全球最大、最全面的長讀長RNA測序數據集之一——新加坡納米孔表達數據集(SG-NEx)。這一成果有望解決疾病研究中長期存在的技術瓶頸,使研究人......
4月15日,中國工程院院士、中國科學院亞熱帶農業生態研究所首席研究員印遇龍領銜的單胃動物營養研究團隊在科技合作和成果轉化上取得新進展。其團隊博士生王芳以“RNA技術研發與產業化應用”為主的項目,歷經初......
近日,中山大學生命科學學院教授張銳團隊首次提出名為MIRROR的全新內源性ADAR招募gRNA設計理念,顯著提高了RNA編輯效率,這一突破為RNA編輯技術走向臨床應用注入了強勁動力,同時也為相關疾病的......
中國科學院分子細胞科學卓越創新中心陳玲玲研究組揭示了雙鏈RNA依賴的蛋白激酶R(PKR)在阿爾茨海默病(AD)發生與進展過程中異常激活的分子病理特征,開發了基于具有分子內短雙鏈結構環形RNA(ds-c......
在癌癥治療領域,化療藥物耐藥性問題一直是阻礙治療效果提升的關鍵瓶頸。癌細胞擁有多種復雜的機制,能夠巧妙地逃避化療藥物的“攻擊”,其中,高活性的抗氧化系統可以有效減輕藥物誘導的活性氧(ROS)損傷,成為......