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  • 發布時間:2019-11-03 18:50 原文鏈接: RNA的瓊脂糖凝膠電泳

    一、實驗目的

    掌握植物總RNA非變性膠電泳的原理和方法。

    二、實驗原理

    RNA電泳可以在變性及非變性兩種條件下進行。非變性電泳使用1.0%--1.4%的凝膠,不同的RNA條帶也能分開,但無法判斷其分子量。只有在完全變性的條件下,RNA的泳動率才與分子量的對數呈線性關系。因此要測定RNA分子量時,一定要用變性凝膠。在需快速檢測所提總RNA樣品完整性時,配制普通的1%瓊脂糖凝膠即可。

    三、實驗材料、器具及藥品

    蘑菇的總RNA溶液。 電泳儀,電泳槽,電子天平移液器,槍頭,微波爐,紫外透射檢測儀等。 瓊脂糖,1XTAE電泳緩沖液,0.5μg/ml溴化乙錠(EB)10X載樣緩沖液。

    四、實驗步驟

    (1)用1×TAE電泳緩沖液制作瓊脂糖凝膠,加1×TAE電泳緩沖液至液面覆蓋凝膠。

    (2)在超凈工作臺上,用移液器吸取總RNA樣品4μl于封口膜上。在實驗臺上再加入5μl 1×TAE電泳緩沖液及1μl 的10X載樣緩沖液,混勻后,小心加入點樣孔。

    (3)打開電源開關,調節電壓至100V,使RNA由負極向正極電泳,約30min后將凝膠放入EB染液中染色5min,用清水稍微漂洗。在紫外透射檢測儀上觀察RNA電泳結果。

    RNA的變性瓊脂糖凝膠檢測

    試劑

    (1)MOPS緩沖液(10*):0.4mol/L 嗎啉代丙烷磺酸(MOPS)(Ph7.0),0.1mol/L NaAc, 10mol/L EDTA

    (2)上樣染料:50%甘油,1mmol/L EDTA ,0.4%溴酚藍,0.4%二甲苯藍。

    (3)甲醛。

    (4)去離子甲酰胺。v電泳槽清洗:去污劑洗干凈(一般浸泡過夜)——水沖洗——乙醇干燥——3%H 2 O 2 灌滿——室溫放置10分鐘——0.1%DEPC水沖洗。

    操作:

    (1) 將制膠用具用70%乙醇沖冼一遍,晾干備用。

    (2) 配制瓊脂糖凝膠。

    ①稱取0.5g瓊脂糖,置干凈的100ml 錐形瓶中,加入40ml蒸餾水,微波爐內加熱使瓊脂糖徹底溶化均勻。

    ②待膠涼至60--70 ℃,依次向其中加入9ml甲醛、5ml 10X MOPS緩沖液和0.5μ|溴化乙錠,混合均勻。

    ③灌制瓊脂糖凝膠。

    (3) 樣品準備:

    ① 取DEPC處理過的500μ|小離心管,依次加入如下試劑: 10x MOPS緩沖液2ul,甲醛3.5μ|,甲酰胺(去離子)10μ|,RNA 樣品4.5μ|,混勻。

    ② 將離心管置于60℃水浴中保10分鐘,再置冰上2分鐘。

    ③ 向管中加入3μ| 上樣染料,混勻。

    (4)上樣。

    (5)電泳:電泳槽內加入1XMOPS緩沖液,于7.5V/ml 的電壓下電泳。

    (6)電泳結束后,在紫外燈下檢查結果


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