一,準備工作
1, 實驗器具與材料: (1)移液槍:200ul、10ul (2)吸頭:200ul、20ul (3)EP 管 1.5ml、100ul (4)水浴箱 2,實驗器具的處理與準備
逆轉錄(RT)
塑料制品:(包括吸頭、EP 管等)
將塑料制品逐個浸泡于 1‰DEPC 水中(必要時小槍頭需要用吸管打
入 DEPC 水)37°C過夜,然后送至高壓 3 次,后在 80°C烘烤箱中烘干(或置于
37°C中 8 小時左右烘干),試驗前將槍頭放入吸頭臺。 3,試劑配制和準備:
(1)DEPC 水:泡實驗器具的 DEPC 水的配制:1000ml 雙蒸水中加 1mlDEPC,放在 1000ml 容量瓶中靜置 4 小時后備用。逆轉錄中所用的 DEPC 水的配 制:100ml 鹽水瓶內裝 40ml 雙蒸水,加 40ulDEPC,37°C過夜,送至 高壓,后分裝到幾個 1.5mlEP 管中,-20°C中保存備用。
(2)RT 中所需要的各種試劑 (3)引物濃度計算方法: (新合成的引物的稀釋)
假如終濃度為X uM(pmol/ul)
加DEPC水體積(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X) 二,RT 時注意事項:
為避免 RNA 酶污染,在 RT 中仍要佩戴一次性手套和口罩。 三,RT 步驟
用 SSIII逆轉錄酶進行 RT(20ul 體積)
1, 準備0.65ml的EP管
2, 冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短 暫離心。
3, 65°C水浴5分鐘后,立刻0°C冰水浴至少1分鐘。
4, 短暫離心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAse Inhibitor,1ul SSIII逆轉錄酶。
5, 短暫離心
6, 50°C水浴60分鐘進行逆轉錄。
7, 70°C水浴15分鐘滅活逆轉錄酶
8, -20°C保存,或立即進行PCR。
用 AMV 逆轉錄酶進行 RT(10ul 體積)
1, 準備 0.65mlEP 管
2, 加入 4.5ul DEPC 水,1ul 引物,1ul 模板 RNA
3, 稍離心,100°C沸水裕 1min
4, 加入 0.5uldNTP,2ul 5×Buffer,1ul AMV 逆轉錄酶 5, 稍離心,封口膜封口,42°C水浴 90°C作 RT
6, 100°C沸水裕 3min 滅活 AMV
7, 立即 PCR 或-20°C保存。