1.RNAi ：（RNA interference）RNA干擾
一些小的雙鏈RNA可以高效、特異的阻斷體內特定基因表達，促使mRNA降解，誘使細胞表現出特定基因缺失的表型，稱為RNA干擾（RNA interference，RNAi ，也譯作RNA干預或者干涉）。它也是體內抵御外在感染的一種重要保護機制。
2.siRNA：(small interfering RNAs)小干擾RNA
一種短片斷雙鏈RNA分子，能夠以同源互補序列的mRNA為靶目標降解特定的mRNA，這個過程就是RNA干擾途徑（RNA interference pathway）。
3.shRNAsRNA-Short hairpin RNAs)短發夾RNA
是設計為能夠形成發夾結構的非編碼小RNA分子，短發夾RNA能夠通過RNA干擾來抑制基因的表達。Thomas Rosenquist's group和Greg Hannon's group聯合研究了在哺乳動物種系細胞中shRNAs的轉移導致基因長時間穩定沉默的機制。
4.bpBase Pair)堿基對
兩個堿基（A和T，或者C和G）之間靠氫鍵結合在一起，形成一個堿基對。DNA的兩條鏈就是靠堿基對之間的氫鍵連接在一起，形成雙螺旋結構。
5.Base sequence:堿基序列
DNA分子中堿基的排列順序。
6.Base Sequence Analysis:堿基序列分析
分析出DNA分子中堿基序列的方法（這種方法有時能夠全自動化）
cDNA：參見互補DNA。
7.cDNA：互補DNA
以信使RNA為模板合成的DNA，常常采用互補DNA的一條鏈作為繪制物理圖譜時的探針。
8.Complementary sequence：互補序列
以一條核苷酸鏈為模板，根據堿基互補規則形成的互補鏈，稱為該模板的互補序列。
9.Genomic Library：基因組文庫
對某個染色體，制備隨機產生的、相互之間有重疊部分的片段的克隆。
10.RISC：（RNA-induced silencing complex）RNA誘導沉默復合物
在RNAi 效應階段，siRNA雙鏈結合一個核酶復合物從而形成所謂RNA誘導沉默復合物。激活RISC需要一個ATP依賴的將siRNA解雙鏈的過程。激活的RISC通過堿基配對定位到同源mRNA轉錄本上，并在距離siRNA3'端12個堿基的位置切割mRNA(3, 18, 27, 29)。盡管切割的精確機制現在還是未知，研究表明每個RISC都包含一個siRNA和一個不同于Dicer的RNA酶。
11.Dicer：Dicer酶
RNaseIII家族中特異識別雙鏈RNA的一員，能以一種ATP依賴的方式逐步（processive）切割由外源導入或者由轉基因、病毒感染等各種方式引入的雙鏈RNA，切割將RNA降解為19—21bp的雙鏈RNAs(siRNAs)，每個片斷的3'端都有2個堿基突出(27, 28)。
12.PTGS：(Post-transcriptional Gene Silencing ,PTGS)轉錄后基因沉默
部分的植物中的基因沉默是在轉錄后發生的。它是相對于部分植物中發生的轉錄階段的基因沉默（TGS）而言的。
13. TGS：（transcriptional gene silencing）轉錄階段基因沉默
14.gene silence:基因沉默
研究結果發現有大量的轉基因植株不能正常表達，通常這并不是由于轉基因的缺失或突變引起的，而是基因失活的結果.這種失活的現象稱為基因沉默。
15.RNA transfection：RNA轉染。
16.Sense RNA：正義鏈RNA
17.Antisense RNA：反義鏈RNA。
18.19 2 2 nt siRNA：
在細胞中雙鏈RNA一般都被切割成21-23小片段，這樣的RNA片段能達到更好的RNAi 作用。人工合成的siRNA也是依據這個原理，所合成的RNA就是19nt的堿基序列再加上兩端的識別序列如-GG，-TT等。
19.SECssiRNA expression cassettes)siRNA表達框架
一種由PCR得到的siRNA表達模版，能夠直接導入細胞進行表達而無需事前克隆到載體中。
20.Homologies：同源性
指同種類不同個體或者不同種類個體之間的，染色體或者蛋白質序列的相似性
21.Homologous Chromosome：同源染色體
一對染色體，分別來自父本和母本，染色體上有著相同的線性基因序列。
22.Recombinant Clone：重組克隆
將不同來源的DNA片段合成在一個DNA分子中，這種技術稱為重組，得到的分子為重組克隆。
23.Ribonucleic acid：核糖核酸RNA
從細胞的細胞核和細胞質部分分離出來的化學物質。在蛋白質合成和其他生化反應中起著重要作用，RNA的結構和DNA的結構類似，都是有核苷酸按照一定順序排列成的長鏈。RNA可以分為信使RNA、轉運RNA、核糖體RNA以及其他類型的RNA。
24.rRNA：（RNARibonsomal RNA，核糖體）
存在于核糖體中的RNA。
25.Ribonsome：核糖體
細胞質中含有rRNA和相關蛋白質的細胞器，是蛋白質的合成場所。
26.Transformation：轉化
將外源DNA整合到某一細胞基因組中的過程。
27.Entrez：
美國國家生物技術信息中心所提供的在線資源檢索器。該資源將GenBank序列與其原始文獻出處鏈接在一起。
28.NCBI：(National Center for Biotechnology Information)美國國立生物技術信息中心
為美國國家醫學圖書館（NLM）和國家健康協會（NIH）下屬部門之一，1988年設立。主要提供生物醫學領域的信息學服務，如世界三大核酸數據庫之一的GenBank數據庫，PubMed醫學文獻檢索數據庫等。
29.GenBank：NIH的基因序列數據庫
是所有公開的DNA序列的集合 ( Nucleic Acids Research 1998 Jan 1;26(1):1-7). 截至1998年12月，GenBank大約收集了 2,162,000,000 個堿基、3,044,000 個序列。
30.Ribosomal RNA：(核糖體RNA，簡寫為rRNA)
是一組存在于核糖體中的RNA分子。
31.UniGene：
美國國家生物技術信息中心提供的公用數據庫，該數據庫將GenBank中屬于同一條基因的所有片斷拼接成完整的基因進行收錄。
32.BLAST:(Basic Local Alignment Search Tool)基本的基于局部對準的搜索工具
一種快速查找與給定序列具有連續相同片斷的序列的技術。是一個序列比對Alignment應用程序。它可以在線選擇服務器上的數據庫進行序列比較包括DNA/DNARNA/DNA蛋白/蛋白序列比對序列比對的作用很多如同源核酸或蛋白序列的查找引物或探針特異性分析物種進化樹的構建等等目前多數網站和軟件均提供免費的BLAST的本地或在線檢索比較著名的提供序列比對服務有NCBI的BLAST檢索如果需要詳細了解這個程序可到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/去具體看一看幫助文件但是上NCBI需要國際代理國內的朋友可通過上海生科院的生物信息中心進行BLAST網址http://bioinfo.biosino.org:8888/blast/ 速度不錯
33.RT-PCR:逆轉錄PCR
RT-PCR是以RNA為起始材料經逆轉錄反應產生cDNA，再以cDNA為模板進行PCR擴增，而獲取目的基因或檢測基因表達。
34.DNA印跡雜交:（DNA blot hybridization）有兩種核酸印跡法：
· 將DNA或RNA溶液直接點樣于硝酸纖維素膜或尼農膜上（斑點或狹線印跡）
· 經瓊脂糖凝膠電泳將片段的DNA或RNA轉移到膜上（Southern和Northern印跡法）。DNA在電泳前先用限制性內切酶消化。
35.RNA印跡雜交:（RNA blot hybridization）
RNA印跡雜交是一種檢測已固定在濾膜上的總RNA或mRNA特定靶序列的技術。
36.RNA酶控制：
在實驗中前期的質粒的構建和提取是要用到RNAse A這種酶的存在會降解后期要轉錄生產的RNA 如果前期出現了這個酶的污染就會導致后期實驗的失敗，而后期轉錄是又要用到其他的RNA酶，如RNA 聚合酶3等，因此在實驗中嚴格控制好RNA酶是RNA實驗的關鍵，具體的做法是做到DNA，RNA移液器的專用，DNA實驗室和RNA實驗室的物品和器械分開使用，將實驗室中的任務污染源減少至最低。