六、需購置的Rt-PCR材料:
(生工. Tel. 2236106.)
Taq酶(含MgCl2 Buffer) 200u 70.00
dNTP: 1支
oligo(dT)15: 1 OD 40.00 promega
M-MLV: 1支 250.00 promega (Buffer)
RNasin: 1支 110
-- -20℃
DEPC 5g 110.00
Trizol 100ml/1瓶 Invitrogen Life technologies
-- 4℃
Marker: 10μg 0.2μg/ml 150.00 科威
(1543. 994. 697. 515. 377. 231)
七、引物合成
正義:5′-CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC-3′
反義:5′-TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT-3′
2、 par-4:
正義:5′-GGGACCTCGGAACTCAAC-3′
反義:5′-TGTATCTGCCTGGGACTG-3′
3、退火溫度計算
2(A+T)+4(G+C)
正反義平均數,再上下波動度(±4℃,或±5℃)
4、引物各合成5 OD,每OD一瓶分裝好
5、引物稀釋:
加DEPC水量為(μl)
= ? nmol / OD × 管上所標OD數×100
是為10p mol / μl 濃度的引物溶液
八、PCR產物電泳
先將1-10μl左右PCR產物,加已點在紙上的溴酸蘭,反復吸打混勻后進行電泳,一般電流為10mA,電源100V,電泳30分鐘,紫外燈下觀察,滿意的結果掃描打印。
九、幾個注意點:
1、逆轉錄的關鍵步驟是立即冰水浴?
2、Rt時,先打開PCR預熱30分鐘。
3、RNA抽提前,打開離心機預冷。
TRIzol法抽提總RNA
細胞1×107
組織100mg
↓
加1mlTRIzol
細胞用1ml加樣器吹至液體澄清且無細胞團塊
↓
勻漿(要徹底,后轉至EP管)
(組織勻漿量>100mg時分裝1ml/每EP管)
↓
顛倒混勻10下,室溫5分鐘
↓
加氯仿1/5體積(0.2ml)(必須按總體積的1/5)
↓
顛倒混勻10下,室溫5分鐘
↓
4℃,離心12000g,15分鐘
↓
轉上層水相(約400μl)于另一1.5mlEP管中
↓
加等體積異丙醇(約400μl),混勻室溫10分鐘
↓
4℃,離心12000g,10分鐘
↓
棄上清
↓
加冰預冷的75%乙醇(用DEPC水配)1ml
↓
4℃ 離心7500g,5分鐘
↓
棄上清,空氣干燥5-10分鐘(不能完全干燥)
↓
溶于DEPC水中至 20μl(10μl-20μl)
(可在55-60℃水中,<10分鐘助溶)