近年來,肺部微生物組對呼吸道健康的重要性逐漸受到了科學家們的重視。The Scientist雜志特別撰文介紹了這一領域的最新進展。
如果將人類的消化系統看作是從口腔延伸至胃和腸道的一條河流,那么肺就是河流旁的湖泊,常常被湍急的水流波及,密歇根大學的Gary Huffnagle說。Huffnagle研究肺部菌群已經有十年了,“持續有來自于口腔的細菌流入肺部,”他說。但肺也可以通過纖毛活動和咳嗽將細菌向外排出,這使肺部的微生物組成為一個動態的社群。”
人們曾經認為肺部沒受到感染時是無菌的。然而近十年來越來越多的證據表明,盡管規模比口腔和腸道小得多,但健康肺部也存在著常駐菌群。許多研究將肺部微生物組的改變與慢性肺病的發展關聯起來,例如囊性纖維化CF或慢性阻塞性肺病COPD。不過,肺部微生物組與疾病的復雜關系還有待闡明。
健康肺部的表面是一個動態的環境。來自口鼻的殘渣和微生物不斷進入這一呼吸器官,而支氣管的纖毛細胞能通過有節奏的運動,去除這些殘渣和入侵的細菌,肺泡巨噬細胞也在時刻準備著摧毀不受歡迎的來客。
肺部微生物組研究一開始引起了諸多質疑,紐約大學的Leopoldo Segal說。最常見的質疑是,認為肺部很可能只是被口腔微生物污染了。后來,不同團隊一再證實有些細菌本身就生活在健康肺部,人們才逐漸接受肺部特異性微生物組的概念。
肺部微生物組比口腔微生物組的密度少大約一千倍,Huffnagle說。這主要是因為肺部缺少適宜細菌生活的粘膜。Huffnagle和同事今年三月在The Lancet Respiratory Medicine上發表綜述指出,肺部就像是南太平洋,細菌聚集而成的小島點綴其間。文章指出,肺部微生物組似乎源自于口腔微生物組,這些細菌能夠在肺部的特殊環境下生存。而健康肺部最常見的細菌為鏈球菌、Prevotella和Veillonella。
肺部微生物組與疾病
近來研究顯示,慢性肺病與肺部微生物組受到干擾有關。2012年密歇根大學的John LiPuma在PNAS雜志上發表文章,為人們展現了CF患者肺部樣本的培養結果。研究人員發現,隨著患者的疾病發展,他們肺部的微生物組多樣性降低,而微生物的總密度保持不變。研究認為這種改變是抗生素造成的,抗生素治療通常是CF患者所必須的。“我們并不是說抗生素有害,”LiPuma說。“這項研究提出的問題是,CF中的抗生素是否在某個臨界點背叛了人類。”
據Segal介紹,有一系列研究表明肺部感染往往伴隨著微生物組的改變,只是人們還不清楚這些變化的發生機制和后果。還有研究指出,肺部的微生物組改變與HIV或哮喘有關。
2013年肺部HIV微生物組計劃的成員在《美國呼吸與重癥醫學雜志》雜志上發表了一個出人意料的發現,與不吸煙的健康人相比,健康吸煙者的肺部微生物組并沒有出現顯著差異。肺部HIV微生物組計劃旨在研究健康肺部的微生物組,并在此基礎上分析HIV感染者肺部發生的改變。
目前,還很少有人研究肺炎、流感或肺結核對肺部微生物組的影響。這一領域的發展比腸道微生物組研究落后了10到15年,加州大學舊金山醫學中心的Yvonne Huang說。
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