選擇合適的緩沖液對于維持一定pH值下蛋白質的穩定及保證實驗的重復性很重要。PBS的緩沖能力強于TBS,TBS在pH7.0以下緩沖能力較弱。一般根據實驗目的選用合適的緩沖液,如在蛋白純化中進行陰離子交換層析,陽離子緩沖液首選TBS;陽離子交換層析時,陰離子緩沖液首選PBS。Western blot中使用PBS和TBS均可,根據需要選擇合適的濃度。