綜述：代謝組學研究加快醫學生物標志物的發現
生物標志物(Biomarker)是指“一種可客觀檢測和評價的特性，可作為正常生物學過程、病理過程或治療干預藥理學反應的指示因子”，作為個體化醫療的“關鍵詞”之一，尋找和發現有價值的生物標志物已經成為當前醫學領域的研究熱點。 01研究現狀和發展趨勢 第一個腫瘤標志物可追溯到1846年由H Bence-Jones所證實的本周氏蛋白（Bence Jones Protein)，對多發性骨髓瘤有一定的診斷作用。170余年后的今天，隨著基因組學、蛋白質組學、肽組學、代謝組學等在內的組學平臺，以及包括納米技術、生物信息學、抗體芯片等前沿在內的手段與方法，都為快速獲得及篩選生物標志物帶來了極大的可能。 基因組學及轉錄組學描述的是機體可能發生改變的生理指標， 而代謝物則是存在于信號通路的終端產物，反映的是機體當時的生理狀態。與其他組學相比，代謝組學由于與表型更為接近，因此更適于疾病分型和標志物發現的研究。 2009年，美國密歇根大學霍......閱讀全文
肺癌生物標志物的概述
生物標志物一般是指可供客觀測定和評價的一個普通生理或病理或治療過程中的某種特征性的生化指標，通過對它的測定可以獲知機體當前所處的生物學過程中的進程。檢查一種疾病特異性的生物標志物，對于疾病的鑒定、早期診斷及預防、治療過程中的監控可能起到幫助作用。非小細胞肺癌(NSCLC)的生物標志物主要分為腫瘤
心衰生物標志物全面盤點
《中國心血管健康與疾病報告2019》發布，中國心血管病患病率處于持續上升階段，心血管疾病死亡率仍舊首位，每5例死亡中2例死于心血管病，推算心血管病現患人數3.30?億。心力衰竭(以下簡稱"心衰")作為心血管疾病的一種，其發病率正在隨著人口老齡化不斷增加；此外關于心力衰竭的流行病學新數據顯示，2012
新型生物標志物——KHKA
由休斯敦德克薩斯大學MD安德森癌癥中心領導完成的該項研究，發表在《自然細胞生物學》雜志上的結論如是說。研究表明，一種被稱為KHK（己酮糖磷酸激酶或果糖激酶）的基因在癌細胞與正常肝組織中的表達有所不同。MD安德森癌癥中心神經腫瘤學教授，資深作者Zhimin Lu說：正常肝細胞催化葡萄糖和果糖發生反應產
生物標志物：挑戰與希望
“Biomarker”這個詞在用于生物醫學領域之前，多見于地質學文獻，曾被翻譯成“生物標志化合物”，指的是地質材料中來自于活的生物體的一些有機化合物。上世紀六十年代，這一詞匯開始出現在醫學文獻中。上世紀八十年代，它被正式地引入到生物醫學領域。在生物醫學領域，對它也曾有過不同的描述。2001年，美
生物標志物：挑戰與希望
“Biomarker”這個詞在用于生物醫學領域之前，多見于地質學文獻，曾被翻譯成“生物標志化合物”，指的是地質材料中來自于活的生物體的一些有機化合物。上世紀六十年代，這一詞匯開始出現在醫學文獻中。上世紀八十年代，它被正式地引入到生物醫學領域。在生物醫學領域，對它也曾有過不同的描述。2001年，美
代謝組鑒定質控標準正式建立
蛋白質組和代謝組技術都基于質譜，但相比于蓬勃發展的蛋白質組學技術，代謝組雖然技術流程更簡單，但其應用卻一直十分緩慢。究其原因，是因為蛋白質組學卻很早就基于Target-Decoy策略建立了FDR（假發現率）質控策略，可以保證鑒定結果的可靠性；而代謝組全譜鑒定一直缺乏有效的質控手段對鑒定結果進行
做好代謝組學研究的關鍵
首先明確代謝組學的核心任務。對小分子代謝物的定性、定量分析并發現差異代謝物：（1）對生物體系中的內源性代謝物及其變化規律進行表征；（2）以差異代謝物作為核心對生命奧秘進行解析。而基于色譜/質譜聯用的分離分析技術具有靈敏度高、選擇性好、動態范圍寬、信息豐富等優點，已成為代謝組學研究的主流技術平臺。其次
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為：“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”，兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度
如何看待代謝組學的前景
是不錯的，但是代謝組本身還是一個發展中的新型學科，一些關鍵性技術還有待突破，如果你只想使用代謝組學而不去深入的研究它的話就應該沒問題，如果想要進一步研究代謝組學方法就需要有相當的分析化學知識。現在世界前十的藥廠都在使用代謝組學進行藥學研究，所以它在里面的前景肯定是不會差的。隨著技術的發展肯定會越來越
油菜代謝組研究方面取得進展
華中農大油菜團隊聯合小麥團隊在Genome Biology發表了題為“Characterization of novel loci controlling seed oil content in Brassica napus by marker metabolite-based multi-om
代謝組學：未來新方向
加拿大阿伯特大學生命科學與計算科學教授David Wishart說，我們自身其實就是一大組生化反應，“因此，基因組和蛋白質組不斷進化來支持代謝組，而不是相反的路徑。” Wishart說，有別于其他組學方法，代謝組學提供了一種更加直接的生理狀態檢測方式。代謝組反應營養、脅迫或者疾病狀態的速度比轉
代謝組學——腫瘤研究的利器
細胞內許多生命活動是發生在代謝物層面的，代謝物更多地反映了細胞所處的環境，比如細胞現在是不是健康？藥物是否起效？環境污染物是不是正在傷害細胞？等等。由此，20世紀90年代，衍生出了一門新學科：代謝組學。它回答了基因組學和蛋白質組學不能回答的問題：細胞到底發生了什么？ 1、腫瘤與代謝組學 腫瘤
如何看待代謝組學的前景
是不錯的，但是代謝組本身還是一個發展中的新型學科，一些關鍵性技術還有待突破，如果你只想使用代謝組學而不去深入的研究它的話就應該沒問題，如果想要進一步研究代謝組學方法就需要有相當的分析化學知識。現在世界前十的藥廠都在使用代謝組學進行藥學研究，所以它在里面的前景肯定是不會差的。隨著技術的發展肯定會越來越
進入前景光明的代謝組學
內容概要： 一、代謝組學在藥物研發中的應用 二、SiDMAP技術在疾病診斷中的應用 三、儀器公司的研究開發：ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研發分析代謝物的更為靈敏的檢測方法，而Bio-Rad公司正在發展用Holly Grail作
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為：“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”，兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度的穩定性、重現
代謝組學樣本收集答疑解惑
樣本收集是代謝組學研究的第一步，是保障代謝組學研究結果可靠性的最重要的環節之一。根據不同的研究目的該選取何種生物樣本？不同種類的生物樣本的規范收集流程是什么？有哪些注意事項（抗凝劑、凍融、抑菌劑等使用細節）？如何保存生物樣本？可保存多久等等？這些都是代謝組學實驗中小伙伴經常咨詢的問題，本文將針對
研究發現通過腸道細菌等繪制人類微生物組藥物代謝圖譜
2019年6月，美國耶魯大學醫學院微生物發病機理和微生物科學研究所Andrew L. Goodman教授團隊在國際頂尖雜志Nature上發表了題為“Mapping human microbiome drug metabolism by gut bacteria and their genes”
武漢物數所代謝組學評價納米金棒生物效應研究獲進展
近日，依托于中科院武漢物理與數學研究所的中國科學院生物磁共振分析重點實驗室的生物波譜及代謝組學研究組，在納米金棒暴露的細胞代謝應答方面取得新進展，相關研究結果發表在Biomaterials上(Biomaterials 34; (2013) 7117-7126)。 十六甲基溴化銨(cet
質譜儀在代謝組學和代謝研究中有著杰出表現
質譜儀以離子源、質量分析器和離子檢測器為核心。離子源是使試樣分子在高真空條件下離子化的裝置。電離后的分子因接受了過多的能量會進一步碎裂成較小質量的多種碎片離子和中性粒子。它們在加速電場作用下獲取具有相同能量的平均動能而進入質量分析器。質量分析器是將同時進入其中的不同質量的離子，按質荷比m/e大小分
代謝組學前沿與熱點——定性代謝流解決方案
作為代謝組學領域先進解決方案的一貫領導者，安捷倫近期隆重推出了全新的定性代謝流解決方案—— MassHunter VistaFlux 工作流程，旨在關注代謝組學的前沿和熱點，提供更快、更準、更完整的高效工作流程，助力科研工作者拓展組學研究的精度與深度。 下面將從五個方面助您了解定性代謝流及安捷
綜述－|AD的蛋白質組學格局發病機制和生物標志物新見解
導 讀 基于質譜的蛋白質組學使得對阿爾茨海默癥(AD)的蛋白質組和蛋白質翻譯后修飾(PTM)的深入剖析成為可能。在這里，我們回顧了AD蛋白質組學研究的歷史和近期的進展以及局限。作為遺傳圖譜的補充，蛋白質組學研究不僅驗證了典型的淀粉樣蛋白和tau通路，而且還發現了蛋白質網絡中的新組成部分，如RN
骨質疏松了嗎？請抽血檢測骨代謝標志物
? 眾所周知，骨質疏松對人體健康的危害很大，傳統觀點認為，骨質疏松癥與衰老有關。然而最新的研究證明，其潛在于人一生的各個年齡段，甚至20多歲的女性都有可能患有此病。我院檢驗科最新開展了體液中骨代謝標志物的全套檢測，相對于骨密度檢測（BMD），骨標志物分析對治療監測更具明顯的時間優勢，在治療3個月后即
微生物的代謝
微生物在生長發育和繁殖過程中，需要不斷地從外界環境中攝取營養物質，在體內經過一系列的生化反應，轉變成能量和構成細胞的物質，并排出不需要的產物。這一系列的生化過程稱為新陳代謝。 代謝作用是生物體維持生命活動過程中的一切生化反應的總稱。它是生命活動的最基本特征。代謝作用包括分解代謝(異化作用)和合成
3個新肺癌生物標志物
在本期出版的《Carcinogenesis》中，研究小組報道了三個新的容易使人患病的單核苷酸多態性（SNPs），其中2個SNPs可提高非小細胞肺癌（non-small-cell lung cancer，NSCLC），另一個對應肺鱗癌風險。三個新SNPs為肺癌風險篩查和干預提供了潛在候選生物標志物
腫瘤常見生物標志物之：胃癌
胃癌是發病率和死亡率較高的惡性腫瘤，中國每年胃癌死亡病例占全球同期胃癌總死亡數的40%以上。目前的研究顯示胃癌篩查是減少胃癌病死率有效的策略之一。利用胃癌生物標志物代替胃鏡篩查，可達到更高的普及率，能做到早發現、早診斷、早治療。本文介紹了胃癌常見的生物標志物及其研究概況。CA與CEA糖類抗原199（
腫瘤常見生物標志物之：肺癌
肺癌被認為是全球主要的惡性腫瘤之一，提高肺癌早期診斷率及治療有效率十分必要。發現高效肺癌生物標志物運用于臨床是其重要手段之一，本文將介紹幾種有研究前景的肺癌生物標記物。腫瘤標志物是指在惡性腫瘤的發生和增殖過程中，由腫瘤細胞的基因表達而合成分泌的或是由機體對腫瘤反應而異常產生的/或升高的、反映腫瘤存在
氧化應激的生物標志物
評價方法氧化應激的定量評價方法大致分做三類：1）測定由活性氧修飾的化合物；2）測定活性氧消除系統酶和抗氧化物質的量；3）測定含有轉錄因子的氧化應激指示物。進一步尚有：1）生物體內氧化應激的程度足以產生應答；2）活體內難以蓄積；3）在活體內不是被代謝，而是穩定存在，等等。理解這些要點對于臨床普及推廣都
代謝組學研究的影響因素與降低生物化學和化學...（二）
組分提取軟件的數據處理工作流程如圖 4 所示。該軟件能像分析人員一樣解析數據，批量處理各個數據文件，而不是單獨處理，并將每次運行得到的信息用于驗證下一次運行獲得的信息。按照這種方式，由于每種組分在數據集中的最大濃度點定義，從而大大減小了數據缺失值現象。同樣的組分在低濃度樣品中時，可以采用更靶標性
代謝組生物標記物與腎功能下降及高尿酸發病風險的關系
最近，國際臨床醫學研究期刊《美國腎臟病學會臨床雜志》（Clinical Journal of the American Society of Nephrology）和《關節炎護理與研究》（Arthritis Care & Research）先后發表了中國科學院上海營養與健康研究所林旭研究組和中科
代謝組學研究的影響因素與降低生物化學和化學...（一）
代謝組學研究的影響因素與降低生物化學和化學噪音的策略目的為代謝組學生物標記物的發現開發一套全新的自動化工作流程和儀器分析方法。?前言在制藥行業中，代謝組學用于研究潛在候選藥物的藥理學 響應所產生的生化變化，其識別毒性 / 藥效標記物的能力可以顯著加速藥物研發的進程并幫助制定合適的臨床計劃。來自于