采用AgilentFemtoPulse系統對不同基因組DNA提取進...(二)
Femto Pulse 系統使用基因組 DNA 165 kb擴展法來分離大于 80 kb 的提取 gDNA(圖 1)。使用 Agilent ProSize 數據分析軟件上的 Smear Analysis 選項卡分析 gDNA 的分子量分布。彌散條帶分子量分布包含整個彌散條帶范圍內的濃度分布。酵母 gDNA 的彌散條帶分子量分布和完整性隨使用的提取方法不同而變化。使用提取方法 A、B、C、D、E 得到的基因組 DNA 樣品的彌散條帶分子量依次減小(表 1)。液相提取法 A 和 B 得到了分子量最大的完整 gDNA 彌散條帶。用傳統液體苯酚-氯仿提取法 (A) 提取的基因組 DNA 產生的完整 gDNA 較長,平均為163670 bp,而另一種液相提取方法 B 為103111 bp。方法 C 離心柱 gDNA 提取方法和方法 D 膜 gDNA 提取方法,在五種不同提取方法中表現出相似的彌散條帶分子量分布結果。在使......閱讀全文
采用Agilent-Femto-Pulse系統對不同基因組DNA提取進...(二)
Femto Pulse 系統使用基因組 DNA 165 kb擴展法來分離大于 80 kb 的提取 gDNA(圖 1)。使用 Agilent ProSize 數據分析軟件上的 Smear Analysis 選項卡分析 gDNA 的分子量分布。彌散條帶分子量分布包含整個彌散條帶范圍內的濃度分布。
采用Agilent-Femto-Pulse系統對不同基因組DNA提取進...(一)
采用Agilent Femto Pulse系統對不同基因組DNA提取進行質量評估作者Chava Pocernich,Jolita Uthe,Steve Siembieda 安捷倫科技有限公司摘要Agilent Femto Pulse 系統采用革命性設計,是唯一一款能夠自動進行高分子量 (HMW)
使用Agilent-Femto-Pulse系統對用于生物樣本庫樣品...(二)
基因組質量值 (GQN)GQN 用數值表示 gDNA 質量,代表了高于分子量閾值樣品的比例。高度完整的 gDNA 的分子量會隨包括物種在內的許多因素而變化。因此,在需要分析不同分子量的 gDNA 時,能設置 GQN 分子量閾值是一項巨大的優勢。用戶可以根據具體樣品確定分子量閾值,以便客觀判斷
使用Agilent-Femto-Pulse系統對用于生物樣本庫樣品...(一)
使用Agilent?Femto Pulse系統對用于生物樣本庫樣品的基因組DNA進行質量評估作者Chava Pocernich,Jolita Uthe,Steve Siembieda 摘要核酸樣品的質量保證和質量控制對于生物樣本庫和進行基因組相關操作的實驗室以及多種分子生物學應用必不可少。革命性的
海洋不同生境總基因組DNA的提取
實驗概要本實驗采用NaI/玻璃粉方法、溶菌酶與蛋白酶K/離心吸附柱方法以及試劑盒PowerSoil ?DNA Isolation Kit (MO BIO ?Laboratories,Inc.)三種方法對海洋岸邊土壤、海水以及沉積物三種樣品進行DNA抽提。為比較不同方法的抽提效果,采用分光光度計對DN
核酸提取-基因組DNA的提取
?? DNA是遺傳信息的載體,是最重要的生物信息分子,是分子生物學研究的主要對象,因此DNA的提取也應是分子生物學實驗技術中的最重要、最基本的操作,如不能有效的完成DNA提取方面的工作,那就根本談不上進行分子生物學方面的實驗。在DNA提取過程中應做到1,根據不同研究需要,保證結構的相應完整性;2,盡
方法二:細菌基因組DNA的微量提取法
本方法通過SDS裂解細胞,蛋白酶降解蛋白,CTAB去除多糖成分一:儀器:同方法一?二:試劑:TE、TAE緩沖液;10%SDS;5MNaCL;20mg/ml蛋白酶K;CTAB/NaCL溶液(10% CTAB,0.7M NaCL? 4.1gNaCL 溶于80ml水中,緩慢加入10gCTAB,加熱溶解);
細菌基因組DNA提取試劑使用說明(二)
三.組織或液體樣品中細菌DNA提取該方案適合于從各種組織、血液、分泌液等液體樣品中提取基因組DNA和寄生的細菌DNA。純化的DNA可直接用于各種細菌的檢測。若需從糞便樣品中提取細菌DNA,我們推薦使用DePure Stool DNA Kit,若需要從土壤樣品中提取細菌DNA,推薦使用DePure
基因組DNA的提取
基因組DNA的提取概 述? 基因組DNA的提取通常用于構建基因組文庫、Southern雜交(包括RFLP)及PCR分離基因等。利用基因組DNA較長的特性,可以將其與細胞器或質粒等小分子DNA分離。加入一定量的異丙醇或乙醇,基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中, 可用玻棒將其取出,而小分
基因組DNA的提取
第一節 概 述DNA的提取通常用于構建文庫、Southern雜交(包括RFLP)及PCR分離基因等。利用DNA較長的特性,可以將其與細胞器或質粒等小分子DNA分離。加入一定量的異丙醇或乙醇,的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中,可用玻棒將其取出,而小分子DNA則只形成顆粒狀沉淀附于壁上及底部,
血基因組DNA提取實驗——血基因組DNA-試劑盒提取法
血基因組DNA提取可用于:(1)從凍全血、血漿、血清、骨髓、其他體液、淋巴細胞、培養細胞、病毒和線粒體中提取DNA;(2)用于后續測序、遺傳信息學等研究。實驗方法原理采用特殊的細胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)從抗凝全血中得到基因組DNA。實驗材料抗凝全血試劑、試劑盒血基因組DNA 試劑盒儀
細菌基因組DNA提取實驗
細菌基因組DNA提取可應用于:(1)獲得細菌基因組DNA;(2)作為PCR模板;(3)用于測序、遺傳信息分析等。實驗方法原理本試劑盒采用獨特的細胞裂解和相分離技術,結合DNA 制備膜選擇性地吸附DNA 的方法達到純化基因組DNA 的目的。適合于從1.0x109?細菌中獲得多至20 ug 的基因組DN
血基因組DNA提取實驗
實驗方法原理 本試劑盒采用特殊的細胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)從抗凝全血中得到基因組DNA。適用于從凍全血、血漿、血清、骨髓、其他體液、淋巴細胞、培養細胞、病毒和線粒體中提取DNA。實驗材料 抗凝全血試劑、試劑盒 血基因組DNA 試劑盒儀器、耗材 96孔深孔板96圓孔板96孔DNA制備板
血基因組DNA提取實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 采用特殊的細胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)從抗凝全血中得到基因組DNA。 實驗材料 抗凝全血
細菌基因組DNA提取實驗
實驗方法原理 本試劑盒采用獨特的細胞裂解和相分離技術,結合DNA 制備膜選擇性地吸附DNA 的方法達到純化基因組DNA 的目的。適合于從1.0×109 細菌中獲得多至20 μg 的基因組DNA。用于PCR、Southern 印跡分析、RAPD、RFLD 等分子生物學實驗。實驗材料 細菌培養物
細菌基因組DNA提取實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本試劑盒采用獨特的細胞裂解和相分離技術,結合DNA 制備膜選擇性地吸附DNA 的方法達到純化基因組DNA 的目的。適合于從1.0x109 細菌中獲得多至20 ug 的基因組DNA。用于PCR、Southern 印跡分析、RAPD
關于土壤基因組DNA提取
土壤樣品含有大量的微生物,其中絕大部分的微生物都是無法直接培養進行繁殖和研究。從土壤樣品中提取?DNA?是研究土壤微生物zui為有效的方法。目前從土壤樣品中提取微生物?DNA?的方法主要有直接法和間接法。直接法是指把土壤樣品放在裂解液中,經過有效的破壁方法使微生物的DNA?全部釋放到裂解液中,然后再
擬南芥基因組DNA的提取
實驗概要本實驗介紹了用CTAB法提取擬南芥基因組DNA。主要試劑CTAB提取液(2%CTAB,50mMEDTA,50mM Tris-HCl,PH 8.0,0.84M NaCI,0.05%巰基乙醇),氯仿,無水酒精,70%的酒精主要設備1.5 mL離心管,65℃水浴鍋,高速離心機,研缽實驗材料擬南芥葉
血基因組DNA提取實驗——血基因組DNA大量試劑盒提取法
實驗方法原理本試劑盒采用獨特的兩相分離技術,結合DNA 制備膜選擇性地吸附DNA 的方法達到純化基因組DN的目的。適合從5 ml 的抗凝人或哺乳動物全血,或500 ul 抗凝鳥類或兩棲動物全血中獲得多至250 ug 的基因組DNA。實驗材料抗凝全血試劑、試劑盒血基因組DNA大量試劑盒儀器、耗材DNA
DNA的不同提取方法及比較
DNA的不同提取方法及比較傳統的DNA提取方法傳統的DNA 提取與純化,如 CTAB 法、SDS 法是在裂解細胞的基礎上,多次苯酚氯仿等有機溶劑抽提使蛋白質變性沉淀于有機相,而核酸保留在水相,達到分離核酸的目的;加入RNA 酶除去核酸中的RNA; 然后加入異丙醇、乙醇等沉淀DNA;用70
采用改進的CTAB法提取細菌總DNA
實驗概要通過改進的CTAB法可快速簡便的提取細菌總DNA,通過本實驗可掌握CTAB法從細菌提取DNA的原理和方法。?實驗原理CTAB ?(hexadecyltrimethylammonium ?bromide,十六烷基三甲基溴化銨),是一種陽離子去污劑,具有從低離子強度溶液中沉淀核酸與酸性多聚糖的特
種子DNA提取儀對云南紫蘇的種子DNA提取
云南各地收集到20份紫蘇品種并進行了多年的栽培和經濟性狀評估,發現在紫蘇種內存在 著豐富的遺傳變異,并且已用形態聚類分析的方法對云南境內紫蘇的種下變異進行了探討,將其分為5個變種。由于形態特征是基因型和環境相互作用的產物,紫蘇 的形態聚類分析結果僅從表現型上間接地反映出了云南境內紫蘇的遺傳多樣性。試
從不同動物組織中提取總DNA的方法及步驟(二)
3. 從培養的動物細胞中抽提總DNAa.收集最多不超過500萬的細胞,離心沉淀后重懸于200微升PBS中。PBS需自備。如果使用凍存的細胞沉淀,先把細胞沉淀解凍,并輕輕彈散,然后再加入PBS。對于基因組DNA含量較高的細胞,例如Hela細胞,應使用較少的細胞,例如100-200萬Hela細胞。b.清
質粒dna的提取與基因組dna的提取有何異同
質粒DNA提取一般用沸水浴法和堿裂解法,現在一般都采用堿裂解法,并有試劑盒可用。它主要是將細胞內的環狀質粒提取出來,一般需要用SDS裂解,RNA酶降解,然后過柱,再進行洗脫.過程比較簡單。 而基因組DNA提取則較為復雜,也需要用SDS裂解和RND酶降解,但降解時間較長,同時對有些革蘭氏陽性細菌
昆蟲全基因組DNA的提取
實驗概要利用改進的CTAB 法提取昆蟲全基因組DNA。主要試劑1. 蛋白酶K[美國Merck公司]2. 三羥甲基氨基甲烷(Tris)[美國Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 瓊脂糖及溴化乙錠(EB)[美國Amresco公司生產]5. 乙二胺四乙酸鈉(Na2ED
從動物組織提取基因組DNA
實驗概要本實驗以哺乳動物新鮮組織為材料,學習基因組DNA提取的一般方法。實驗原理基因組DNA的提取通常用于構建基因組文庫、Southern雜交(包括RFLP)及PCR分離基因等。利用基因組DNA較長的特性,可以將其與細胞器或質粒等小分子DNA分離。加入一定量的異丙醇或乙醇,基因組的大分子DNA即沉淀
真核細胞基因組DNA的提取
實驗概要高等動物,高等植物的基因組相當龐大,如人類細胞基因組由30億個堿基對組成,果蠅基因組有1.4×108個堿基對,水稻基因組有1.4×109個堿基對。真核細胞基因組中,約1萬-1.5萬個可表達的結構基因,其它大量存在的是調控序列和內含子序列。可以說某特定物種的基因組,包含了該物種生長,發育,繁殖
細菌基因組DNA提取方法綜述
細菌基因組DNA的提取方法綜述,提供了5種方法。?1 快速微量提取法A.取1.5ml菌體培養物于一滅菌Ep管中,12000rpm離心1min, 丟去上清夜,收集菌體。B.加入400ul裂解液(40mMTris-醋酸,20mM醋酸鈉,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8)混勻,置于37oC水浴1hr
SDS法提取植物基因組DNA
本方法由Dellaporta,Wood和Hicks(1983)的方法修改而成。其基本原理是研磨的組織細胞用熱的SDS裂解后,加入高濃度的KAc,0℃放置以除去蛋白和多糖類雜質,最后用乙醇或異丙醇沉淀。一 材料、試劑和儀器1 材料 新鮮的組織材料或-80℃凍存的材料2 試劑(1)提取緩沖液Tris-H
如何對提取的DNA純化
質粒DNA的提取、純化和電泳檢測摘要本實驗通過堿變性法提取E.coli DH5α(pUC19)的質粒DNA,并且通過一系列的分離純化技術將其質粒DNA與染色體DNA、RNA、蛋白質等雜質分開從而得到純化的質粒DNA分子。通過瓊脂糖凝膠電泳可以通過DNA條帶的位置來大致判斷其分子大小,也可以將實際電泳