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  • 蛋白質測序

    一、概念當前,所謂蛋白質測序,主要指的是蛋白質的一級結構的測定。蛋白質的一級結構(Primary structure)包括組成蛋白質的多肽鏈數目。很多場合多肽和蛋白質可以等同使用。多肽鏈的氨基酸順序,它是蛋白質生物功能的基礎。 蛋白質氨基酸順序的測定是蛋白質化學研究的基礎。自從1953年F.Sanger測定了胰島素的一級結構以來,現在已經知道約十萬個不同蛋白質的一級結構。二、測定步驟1 多肽鏈的拆分。由多條多肽鏈組成的蛋白質分子,必須先進行拆分。幾條多肽鏈借助非共價鍵連接在一起,稱為寡聚蛋白質,如,血紅蛋白為四聚體,烯醇化酶為二聚體;可用8mol/L尿素或6mol/L鹽酸胍處理,即可分開多肽鏈(亞基).2 測定蛋白質分子中多肽鏈的數目。通過測定末端氨基酸殘基的摩爾數與蛋白質分子量之間的關系,即可確定多肽鏈的數目。3 二硫鍵的斷裂。幾條多肽鏈通過二硫鍵交聯在一起,可在8mol/L尿素或6mol/L鹽酸胍存在下,用過量的β-巰基乙......閱讀全文

    蛋白質質譜測序技術和儀器國產化

      2015年10月17日,第二屆全國質譜分析學術報告會在浙江大學紫荊港校區體育館盛大開幕,在5位院士的精彩報告后,多位學者做了高水平的大會報告。   復旦大學楊芃原教授:蛋白質質譜測序技術和儀器國產化  復旦大學教授楊芃原教授做題為《蛋白質質譜測序技術和儀器國產化》的報告。蛋白質質譜測

    蛋白質自動測序儀的日常維護

      流動相的選擇采用與檢測器相匹配且黏度小的“HPLC”級溶劑,經過蒸餾和0.45μm的過濾去除纖維毛和未溶解的機械顆粒等,經過0.2μm的過濾可除去有紫外吸收的雜質對試樣有適宜的溶解度。避免使用會引起柱效損失或保留特性變化的溶劑[1]。  水的等級需用純化水,因為不純物的存在會增加去離子的吸光率,

    蛋白質自動測序儀的工作原理

      蛋白質測序儀主要檢測的是蛋白質一級結構(氨基酸序列),其基本原理沿用艾德蒙(Edman)化學降解法,這也是經典的蛋白質測序方法。利用 Edman化學降解法測定蛋白質或多肽N末端序列,在測定過程中,氨基酸殘基依次與異硫氰酸苯酯(PITC)作用,從蛋白質N末端依次切割下來,形成穩定的PTH氨基酸后進

    蛋白質自動測序儀的發展歷史

      1953年,瑞典化學家Edman采用異硫氰酸苯酯法測定蛋白質的N端序列,為氨基酸自動測序奠定了基礎。  1967年,Edman和Begg根據異硫氰酸苯酯法測定原理設計了第一臺蛋白質自動測序儀(旋轉杯蛋白質測序儀),為蛋白質自動測序以及蛋白質自動測序儀的商品化生產提供了理論支持和樣機。  1971

    蛋白質自動測序儀的基本結構

      蛋白質自動測序儀結構非常復雜,基本組成構件包括反應器、轉換器、進樣器、氨基酸分析系統和信息軟件處理系統[1]。  反應器反應器中進行 Edman化學降解反應中偶聯反應和環化裂解反應。在偶聯反應之前有一個樣品固定過程,即將蛋白質樣品固定在纖維板上或將轉印有蛋白質斑點的聚偏二氟乙烯膜(FVDF)放置

    我國或將實現蛋白質測序儀器和試劑國產化

      基因測序技術飛速發展,使得幾十個甚至上百個基因的測序能夠在幾天之內完成,近日,“蛋白質測序儀器和試劑國產化”項目實施工作會議在北京大學順利落幕,會議得到了北京大學前沿交叉學科研究院方競院長的大力支持。  90年代人類基因組計劃,中國科學家承擔了1%的任務;而2010年代的人類蛋白組計劃,則是由中

    新一代蛋白質測序方法誕生-|-Nature-Biotechnology論文推薦

    德克薩斯大學奧斯汀分校(The University of Texas at Austin)的一個研究小組展示了一種比現有技術更靈敏的蛋白質測序新方法,能夠識別單個蛋白質分子,而不再一次需要數百萬個分子。這一進展可能對生物醫學研究產生重大影響,使得開發用于癌癥和其他疾病診斷的新的生物標志物更加容易,

    新一代蛋白質測序方法誕生-|-Nature-Biotechnology論文推薦

      德克薩斯大學奧斯汀分校研究人員發明了一種新技術,希望將蛋白質測序變得像 DNA 測序一樣靈敏、快捷。  德克薩斯大學奧斯汀分校(The University of Texas at Austin)的一個研究小組展示了一種比現有技術更靈敏的蛋白質測序新方法,能夠識別單個蛋白質分子,而不再一次需要數

    DNA測序PCR測序反應

      1. 取0.2 ml的PCR管,用記號筆編號,將管插在顆粒冰中,按下表加試劑:  所加試劑 測定模板管 標準對照管  BigDye Mix 1 μl 1 μl  待測的質粒DNA 1 μl -  pGEM-3Zf (+) 雙鏈DNA - 1 μl  待測DNA的正向引物 1 μl -  M13(

    DNA測序的測序技術

    高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術(Next-generation sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等,主要有以

    DNA測序的測序原理

    DNA測序的測序原理是:利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測定由一套四個單獨的反應構成,每個反應含有所有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基團,使延長的寡聚核苷酸

    直接分辨單個氨基酸分子小小納米孔破解蛋白質測序難題

    蛋白質是生命活動的主要承擔者。測量組成蛋白質的氨基酸的排列順序被稱為蛋白質測序。由于缺乏普適、高效的測序技術,人類對蛋白質的了解還極其有限,生命世界的諸多奧秘仍待破解。近日,浙江大學化學系馮建東團隊提出了基于固體納米孔的氨基酸識別方法。他們構建了直徑為1納米左右的人工納米孔,可進行單個氨基酸分子的精

    直接RNA測序、串聯質譜法揭示新冠轉錄組和蛋白質組特征

    此前,南開大學高山、阮吉壽等在中國預印本ChinaXiv網站發表論文,稱新冠病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位點。近日,發表在預印本網站bioRxiv上的一篇論文使用直接RNA測序和串聯質譜法表明了SARS-CoV-2的轉錄組和蛋白質組的特征,揭示了細胞通道在去除了疑似Furin 蛋白酶切位點的

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    蛋白質測序技術為臨床診斷和治療的常規應用打開大門

      雖然DNA提供了生物形態和功能的遺傳食譜,但身體蛋白質的工作是執行DNA遺傳密碼所要求的復雜命令。  斯圖爾特·林賽(Stuart Lindsay)是亞利桑那州立大學生物設計研究所(Biodesign Institute at ASU)的一名研究員,他一直走在改進DNA快速測序的前沿,最近他將自

    二代測序的焦磷酸測序,合成法測序,連接法測序和離子半導體測序原理

      不同的二代測序平臺的區別主要體現在測序反應的技術上,這些差別可以分為4類:  焦磷酸測序,合成法測序,連接法測序和離子半導體測序。焦磷酸測序  在焦磷酸測序中,測序反應通過每個核苷酸結合過程中釋放的焦磷酸來調控。釋放的焦磷酸參與了一系列化學反應從而導致鏈光的產生。發出的光由記錄基因蔟相應序列的相

    DNA測序技術的測序規律

    生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點,但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。由于DNA上的每一個堿基出現在可變終止端的機會均等,因此上述每一組產物都是一些寡核苷酸混合物,這些寡核苷酸的長度由某一種特定堿基在原DNA全片段上的位置所決定。在可以區分長度僅差一個核苷酸

    簡述DNA測序的測序規律

      生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點,但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。  由于DNA上的每一個堿基出現在可變終止端的機會均等,因此上述每一組產物都是一些寡核苷酸混合物,這些寡核苷酸的長度由某一種特定堿基在原DNA全片段上的位置所決定。  在可以區分長度僅

    DNA測序儀pcr測序反應

      pcr測序反應  (1) 取0.2ml的pcr管,用記號筆編號,將管插在顆粒冰中,按下表加試劑:  所加試劑 測定模板管 標準對照管  bigdye mix 1μl 1μl  待測的質粒dna 1μl -  pgem-3zf (+) 雙鏈dna - 1μl  待測dna的正向引物 1μl -  

    DNA測序技術的測序原理

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    DNA測序的測序原理介紹

      化學修飾法測序原理  化學試劑處理末段DNA片段,造成堿基的特異性切割,產生一組具有各種不同長度的DNA鏈的反應混合物,經凝膠電泳分離。化學切割反應:包括堿基的修飾,修飾的堿基從其糖環上轉移出去在失去堿基的糖環處DNA斷裂。  Sanger法測序的原理  就是利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定

    DNA測序的測序目的

    確定重組DNA的方向與結構,對突變進行定位、鑒定和比較研究。

    DNA測序——自動測序法

    DNA測序可用于:(1)測定未知序列;(2)確定重組DNA的方向與結構;(3)對突變進行定位和鑒定比較研究。實驗方法原理ABI ?PRISM 310型基因分析儀(即DNA測序儀),采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳,應用該公司ZL的四色熒光染料標記的ddNTP(標記終止物法),因此通過單

    DNA測序儀:454測序儀

    454測序儀的出現極大促進了測序業務的開展,科研人員已經將測序技術作為解決科研工作中許多常見 問題的利器。這是因為454測序儀在以下幾個方面取得了質的突破:首先是解決了高通量測序問題;其次它簡 化了樣品準備步驟,將以往轉化大腸桿菌擴增質粒的繁瑣過程全部用簡單的體外PCR擴增法替代了;最后, 它縮小了

    Isoseq全長轉錄組測序助力擬南芥蛋白質異構體的發現

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    解碼“基因組學之父”桑格:測序,測序,測序

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    DNA測序技術的測序的規律

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    測序技術及測序儀器的比較

    自sanger測序技術發明以來,經人類基因組計劃的促進,測序技術有了跨越式的發展,以實驗方法與實驗儀器的改進為標志,測序技術經歷了三代的發展,同時測序技術向著高通量測序,單分子測序,低價格測序的方向發展,目前測序技術已成為分子生物學實驗中的重要的實驗手段。本文主要簡單回溯了測序技術的發展歷史,介紹了

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