新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（五）
圖 6 1ug C.elegans 蛋白胰酶酶解物在反相色譜分離的基峰圖，四級桿飛行時間質譜和 LTQ Velos 線性離子阱全掃描動態范圍的比較Q-TOF 掃描速率對靈敏度的影響 如圖 7 所示，將 Q-TOF 掃描速率從 3Hz 升至 6Hz ，導致鑒定到肽段數目減少，這主要是因為隨著 Q-TOF 質譜儀的掃描速率提高，一級質譜圖特別是二級質譜圖質量下降。增加的掃描速度減少了離子的傳輸時間，由于較少的離子被檢測到和平均化，因此降低了譜圖的信噪比。如圖 8 所示，將 Q-TOF 掃描速率從 3Hz 升至 8Hz ，損失了 66% 的 Q-TOF 信號，在二級質譜圖可檢測到的特征離子數目減少了。增加的 MS/MS 采集的掃描速率，降低了二級質譜圖的質量和信噪比，而且 Mascot 鑒定到的肽段的得分也受影響，如圖 9 所示，二級質譜圖掃描幾乎來源于色譜峰的頂點。在高質量 Q-TOF3Hz 譜圖下， Mascot 得分......閱讀全文
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（五）
圖 6 1ug C.elegans 蛋白胰酶酶解物在反相色譜分離的基峰圖，四級桿飛行時間質譜和 LTQ Velos 線性離子阱全掃描動態范圍的比較Q-TOF 掃描速率對靈敏度的影響 如圖 7 所示，將 Q-TOF 掃描速率從 3Hz 升至 6Hz ，導致鑒定到肽段數目減少，這主要是因為隨著 Q-TO
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（二）
實驗 樣品制備 C.elgans 勻漿液的可溶性部分用 pH7.8 的碳酸氫銨稀釋，加入 0.1% 的 RapiGest 表面活性劑，解釋用二硫蘇糖醇在 100 ℃ 還原二硫鍵，并用碘乙酰胺對半胱氨酸烷基化。樣品解釋用對 K/R 特異性酶酶切 4 個小時。酶解物質酸化后存放至 -80 ℃ 。
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（三）
表 3 四級桿 - 飛行時間質譜儀采集參數軟件平臺Proteome Discoverer搜索引擎MASCOT v 2.1數據庫NCBI, April 2008最大漏切數目1前體離子容忍度離子阱數據 : 1.4 Da四級桿飛行時間質譜數據 : 40 ppm碎片容忍度離子阱數據四級桿飛行時間質譜數據 :
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（一）
Tonya Pekar Second, Justin Blethrow, Jae C. Schwartz, Vlad Zabrouskov, Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA關鍵詞：LTQ Velos 線性離子阱，蛋白質學，蛋白鑒定，肽測序、靈敏度、蛋白質
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（四）
如圖 4 所示，在不同儀器之間，有很多蛋白會重復出現，即被不同儀器同時鑒定到。在 60 分鐘的分離過程中， LTQ Velos 雙壓離子阱鑒定到了 LTQ XL 得到到蛋白數目的 88% ， LTQ Velos 雙壓離子阱鑒定到了 Q-TOF 得到蛋白數目的 90% ，此外，還有 570 個
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（六）
圖 9 四級桿 - 飛行時間質譜在兩個不同二級質譜掃描速率下，對同一個二價前體離子 LVGDLDDAQVDVER 二級質譜圖的比較。而 LTQ Velos 離子阱對同一前體離子檢測只用了 80% 的樣品量。結論：在一個復雜的蛋白質組樣品中，高靈敏的檢測和鑒定化合物對于了解和認知動態蛋白質學具有極其重
線性離子阱質譜儀的用途
廣泛應用于可預測和不可預測代謝物的檢測，并可以使用同重元素標記法進行肽定量分析。
線性離子阱質譜儀的產品介紹
性能： 1、創新的前置放大器電子元件提升了靈敏度； 2、平行 MS 和 MSn 功能加速了分析； 3、具有阻擋中性離子新型技術的離子光學和先進的檢測系統提升了系統可靠性和定量性能； 4、結合快速掃描的信號處理確保了UHPLC兼容性； 5、多裂解技術（CID、HCD和可選ETD）提供了多功能
線性離子阱質譜儀的產品特點
性能： 1、創新的前置放大器電子元件提升了靈敏度； 2、平行 MS 和 MSn 功能加速了分析； 3、具有阻擋中性離子新型技術的離子光學和先進的檢測系統提升了系統可靠性和定量性能； 4、結合快速掃描的信號處理確保了UHPLC兼容性； 5、多裂解技術（CID、HCD和可選ETD）提供了多功能
線性離子阱質譜儀都有哪些應用
1、應對代謝物鑒定和確證，線性離子阱質譜儀可自動查找到所有可能的代謝物。 2、基于離子/離子化學的電子轉移解離，線性離子阱質譜儀是實現此技術的儀器。ETD與CID互為補充，提高蛋白序列覆蓋率；保護不穩定PTM翻譯后修飾基團，簡化數據分析；單次進樣自動啟動CID和ETD。 3、母離子智能選擇：自動