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  • 人類組織中m6A修飾的動態變化和進化

    文章導讀 m6A是mRNA中普遍存在的一種內部修飾,通過多種機制,比如調控mRNA的剪接、表達、降解、翻譯等對mRNA的命運產生不同影響。為了探究m6A修飾在不同組織之間、不同發育階段的差異,m6A位點在轉錄本上的位置分布,以及這些分布差異可能對基因調控的進化產生怎樣的影響,近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)雜志上發表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通過對9種人類組織的m6A測序,分析了m6A甲基化位點在不同組織中的分布特點、潛在調控機制和進化。 Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human 發表期刊:Nucleic Acids Research 影響因子:11.147 發表時間: 202......閱讀全文

    極端高溫,影響人類進化?

    ·據世界銀行估計,到2050年,氣候變化將導致1.4億人遷移,目前生活在非洲撒哈拉以南地區、南亞、拉丁美洲的人遷移的可能性尤其高。 ·大規模遷移的后果之一,是生物學界所謂的“基因流動”,即由種群之間基因混合引發的進化。 極端高溫,無疑是今年夏天全球各地的一大關鍵詞。 上海高溫追平1

    m6A修飾的長鏈非編碼RNA調控神經元的發育及機制

      近日,Cell Reports在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心(生物化學與細胞生物學研究所)鮑嵐研究組的最新研究進展(m6A-modified lincRNA Dubr is required for neuronal development by stabilizing YTHDF

    北京氣候、植被景觀與人類生存環境動態變化研究獲進展

      北京是世界歷史文化名城,其人類活動歷史可從今天一直追溯至史前時代,是研究東方人類進化、文明發展和人類與環境相互作用的熱點地區。全新世(距今約11700年至今)是新石器時代和農業活動的開端,也是人類社會形成與發展的關鍵時段。因此,全新世的植被演替和氣候變化毫無疑問影響了北京地區人類的生存和發展。然

    研究人員揭示了T細胞中m6A修飾的基本功能

    由LMU和Helmholtz Munich免疫學家Vigo Heissmeyer和Taku Ito-Kureha組成的研究小組揭示了T細胞中m6A修飾的基本功能。甲基化是核酸的化學修飾,不僅存在于DNA上,也存在于RNA上。這種甲基化對某些類型的細胞是否重要,以及它對體內細胞的相互作用有什么影響,根

    揭秘m6A修飾新功能----調控染色質狀態和轉錄活性

      文章導讀   m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。   2020年1月17日,美國芝加哥大學何川,中科院

    上海生科院發現RNA-m6A修飾和果蠅性別決定新因子

      3月19日,中國科學院上海生命科學研究院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所嚴冬研究組,與美國哈佛大學Norbert Perrimon研究組合作,以Xio is a component of the Drosophila sex determination pathway and RNA

    揭秘m6A修飾新功能----調控染色質狀態和轉錄活性

      m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。   2020年1月17日,美國芝加哥大學何川,中科院北京基因組研究所

    生物鐘調控代謝新方式揭示

       人體內有一個很酷的時鐘——生物鐘。然而,生物鐘調控生理、代謝和行為等生命活動的機制十分復雜,仍需要進一步深入探究。記者15日從南京農業大學獲悉,該校王恬教授團隊與芝加哥大學合作在《細胞通訊》上刊發研究成果,揭示了生物鐘調控代謝的新方式。  生物鐘由基因和蛋白質打造,是生物進化的禮物。生物鐘掌控

    生物鐘調控代謝新方式揭示

       人體內有一個很酷的時鐘——生物鐘。然而,生物鐘調控生理、代謝和行為等生命活動的機制十分復雜,仍需要進一步深入探究。記者15日從南京農業大學獲悉,該校王恬教授團隊與芝加哥大學合作在《細胞通訊》上刊發研究成果,揭示了生物鐘調控代謝的新方式。  生物鐘由基因和蛋白質打造,是生物進化的禮物。生物鐘掌控

    我國學者發現果蠅性別決定新因子

      中科院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所嚴冬研究組和美國哈佛大學Norbert Perrimon研究組合作研究,發現并鑒定了RNA m6A甲基轉移酶復合物的新成員Xio,并且該基因也是果蠅性別決定信號途徑新的組分。相關研究成果近日在線發表于美國《國家科學院院刊》。  N6-methyl

    全套病毒RNA-m6A甲基化修飾研究工具的使用(一)

    ? ? ? ?如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行對我們有任何啟發的話,那么要數對RNA修飾的研究了,此時研究病毒RNA以及其甲基化修飾等功能,顯得比以往任何時候都更加重要。 而這是否意味著要研究病毒RNA本身不同的各種突變體或者表觀遺傳變化如何使這些病毒更靈活和感染力?還是研究從細胞和

    揭示RNA-m6A修飾調控抗腫瘤免疫機制

      免疫治療是對抗腫瘤的前沿陣地,其治療成功的關鍵是引發針對腫瘤抗原的自發性T細胞反應。許多病人的免疫系統無法有效識別腫瘤抗原,難以引發持續性的T細胞應答并清除腫瘤。研究免疫系統識別腫瘤抗原的分子機制有望發現新型藥物靶點,提高免疫治療效果。  中國科學院北京基因組研究所韓大力團隊與清華大學徐萌團隊、

    華人學者Nature-Methods揭示RNA甲基化的復雜性

      在分子生物學的中心法則中,遺傳信息從DNA、RNA流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學修飾,這些修飾可以調控基因的表達,并由此決定細胞的狀態,影響細胞的分化和發育。近年來人們發現,mRNA和其他RNA上也存在類似的調控機制。  N6-methyladenosine(m6A)是真

    人類如何引導其它物種進化

      烏鴉會銜著木棍在小洞中戳來戳去來獲取食物,而在人類進化史冊的絕大部分篇章中,我們做的還不如烏鴉漂亮。當然慢慢地我們學會了燧木取火,開始打造石制工具,時至今日,熱兵器,殺蟲劑和抗生素赫然在我們的工具序列中。通過使用工具,我們幫助那些對我們有用的物種生存了下來,這其中包括釀酒用的小麥、酵母,提供肉食

    口里藏著人類進化史?

      古語云“病從口入”,但除了飲食衛生,口里的小小“原住民”也不應忽視。它們不僅與健康息息相關,甚至還是人類進化史的“記錄官”。科學家已經知道了70%的口腔細菌基因組。圖片來源:Jessica Mark Welch和Gary Borisy細小牙垢可以揭示人類及其寄居微生物過去相互作用。圖片來源:馬普

    云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇

      RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點,也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature,cell級別高分文章領域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼,之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究(詳細見云序課堂之前往期回顧)。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN

    中國科學家9月參與發表多篇Nature文章

      9月中國學者參與的多項研究在Nature雜志及其重要子刊上發表,其中包括首次揭示m6A甲基化修飾的新作用,表觀遺傳調控核心復合物PRC2招募到基因組上重要位點的分子機制,以及蘭花基因關鍵演化機制。  來自中科院動物研究所,北京基因組研究所的研究人員通過m6A測序技術(m6A-Seq),首次揭示m

    概述T細胞亞群的動態變化

      目的研究兒童傳染性單核細胞增多癥(IM)不同時期外周血T細胞亞群CD3^+、CD4^+、CD8^+細胞的改變及其變化規律。方法在病程不同時期采集30例IM患兒的外周血,肝素抗凝,采用流式細胞術方法分別檢測了30例IM患兒急性期、病程1月、病程3月、病程6月及正常對照組外周血淋巴細胞CD3^+、C

    RNA-m6A甲基化修飾研究相關研究的應用

    如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行對我們有任何啟發的話,那么要數對RNA修飾的研究了,此時研究病毒RNA以及其甲基化修飾等功能,顯得比以往任何時候都更加重要。 而這是否意味著要研究病毒RNA本身不同的各種突變體或者表觀遺傳變化如何使這些病毒更靈活和感染力?還是研究從細胞和組織中收集的R

    云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇

      RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點,也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature,cell級別高分文章領域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼,之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究(詳細見云序課堂之前往期回顧)。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN

    植物所解析RNA甲基化調控果實成熟的作用機制

      DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)是兩種重要的核酸修飾,在基因表達調控中發揮重要作用并參與諸多生物學過程。然而,這兩種核酸修飾之間是否存在內在關聯性卻不清楚。近日,中國科學院植物研究所秦國政研究組和田世平研究組合作,揭示了DNA甲基化可通過調節m6A去甲基化酶基因表達的方式影響番茄果

    m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇

    RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點,也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature,cell級別高分文章領域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼,之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究(詳細見云序課堂之前往期回顧)。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RNA在

    m6A(N6甲基腺嘌呤)修飾在動脈粥樣硬化中的作用

    動脈粥樣硬化(atherosclerosis)是心血管系統最常見的疾病之一,對人類健康有嚴重危害。內皮細胞炎癥反應作為動脈粥樣硬化的第一步,會導致內皮細胞的通透性增加、屏障功能受損以及粘附分子的表達,促使單核細胞遷移并粘附于血管內皮表面,進而引發動脈粥樣硬化的發生和發展。?N6-甲基腺嘌呤(m6A)

    混種交配:改變人類基因-影響人類進化

       關于人類的進化史,一直謎霧重重。科學家最新研究認為,當現代人第一次離開非洲大陸后,他們曾經與尼安德特人進行混種交配,這一定程度上改變了人類基因,并提高了人類的免疫力。正是由于混種交配,人類才成功進化存活至今,而人類的文化也才得以發展進步。然而,由于目前尚無法對遠古時代人類的基因進行分析,因此很

    上海藥物所小分子調控核酸去甲基化研究取得階段進展

      中科院上海藥物研究所楊財廣課題組與蔣華良課題組合作,基于mRNA中N6位甲基化修飾的腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)去甲基化酶FTO結構開展小分子調控研究,首次獲得了對核酸去甲基化酶,例如FTO具有酶活和細胞活性的小分子抑制劑。論文于10月11日在線發表于《美國化學會

    可解釋人類進化的關鍵基因現身

      據物理學家組織網27日報道,加拿大研究人員發現,以前被認為在不同生物體中具有相似作用的20多種基因,實際上對人類有獨特作用,這些基因屬于C2H2鋅指轉錄因子,該發現有助于解釋人類是如何存在以及進化的。  這些基因編碼名為“轉錄因子”(TF,控制基因活性)的蛋白質。TF識別名為“基序”(motif

    進化的未來:人類將會什么樣?

      隨著科學家對化石的研究和基因科學的進展,人類過去的進化進程正逐漸被揭示出來。但這種進化的未來又將向何處去呢?目前有豐富的跡象表明,人類仍在進化之中。但是人類是否會沿著許多科幻作品中所描述的那樣進化下去卻是令人懷疑的。   許多科幻作品都曾認為,未來人類頭部會變得很大,以容納增大的大腦。“但這種

    病毒或是人類進化的最強推手

      病毒聽起來很嚇人,但實際上,病毒與人類之間的協同進化,從人類起源開始,一直是緊密相連的。  病毒與人類宿主之間的持久斗爭是人類演化的關鍵推動力,甚至于可以說,沒有病毒,就不會有人類!  在大約6600萬年前生命史上的第五次生物大滅絕中,恐龍以及許多物種都滅絕了。  但是有一類長得跟現在的鼩鼱差不

    研究發現FTO是抗AML藥物作用的潛在靶點

      4月15日,中國科學院上海藥物研究所楊財廣課題組與美國陳建軍課題組和錢志堅課題組合作研究,在化學干預RNA甲基化(m6A)修飾方向上取得新進展。研究成果“Small-molecule Targeting of Oncogenic RNA Demethylase FTO in Acute Myel

    云序超微量MeRIP測序技術在m6A甲基化文章發表的應用1

    m6A甲基化是近年來一大熱門研究方向,種種研究表明m6A修飾在各種真核生物、各類組織細胞中普遍存在,并對多種生物學功能、疾病腫瘤的發生發展具有極大影響。m6A甲基化位點的檢測依賴于MeRIP-seq,其中的抗體免疫共沉淀(IP)環節要求樣品RNA起始量相較普通轉錄組測序要高,曾經令許多難以大量獲取的

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