雙劍合璧|sumo化與磷酸化修飾聯合分析贏高分文章
隨著質譜技術的不斷進步，大規模修飾組學的方法也越來越成熟，PTM作為生物體內非常重要的生理現象也逐步被揭示出參與各項生命活動。今天我們就一起來學習一篇運用質譜技術對磷酸化修飾和類泛素化修飾鑒定，找出兩種修飾聯合作用對在DNA復制損傷壓力時的響應。該篇文獻來自哥本哈根大學的研究人員于2017年10月發表在“cell report”雜志上的 Proteomics Reveals Global Regulation of Protein SUMOylation by ATMand ATR Kinases during Replication Stress文獻， 目的是通過質譜技術分析sumo化修飾和磷酸化修飾在細胞面對DNA復制壓力時的信號傳遞、相互影響和關聯的機制。 IF 8.282 課題背景 真核生物DNA復制是耗時且非常具有挑戰性的過程，DNA復制的正常進行是維持正常細胞活動的基礎，所以需要精......閱讀全文
蛋白質SUMO化修飾精細調控植物次生細胞壁增厚新機制
1月18日，PLOS Genetics 雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所李來庚研究組題目為SUMO modification of LBD30 by SIZ1 regulates secondary cell wall formation in Arabido
浙大張龍教授連發兩篇Cell子刊－發現關鍵信號通路新機制
浙江大學生命科學研究院教授張龍主要從事細胞信號轉導及腫瘤細胞轉移方向的跨學科研究，近期其研究組接連在Molecular Cell和Cell Host & Microbe上發表文章，發現了YAP/TAZ激活新機制，以及調節固有免疫自激活的重要分子機制。 在第一文章中，研究人員揭示了去泛素化酶OT
如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關...(四)
3. 多組學聯合運用找靶點：轉錄組測序甲基化測序，雙劍合璧?多個表達譜數據取交集找到靶基因（DOI: 10.1002/hep.29683）?甲基化數據同表達譜數據取交集（http://dx.doi.org/10.1016/j.ccell.2017.02.01）1）云序生物推薦MeRIP-seq測序技
磷酸化多肽及其修飾方法
蛋白質磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一種蛋白質翻譯后修飾，20世紀50年代以來一直被生物學家看作是一種動態的生物調節過程。在細胞中，大概有1/3的的蛋白質被認為是通過磷酸化修飾的。蛋白質的磷酸化修飾與多種生物學過程密切相關，如DNA損傷修復、轉錄調節、信號傳導、細胞凋亡的調節等。磷酸化蛋白質
磷酸化多肽及其修飾方法
蛋白質磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一種蛋白質翻譯后修飾，20世紀50年代以來一直被生物學家看作是一種動態的生物調節過程。在細胞中，大概有1/3的的蛋白質被認為是通過磷酸化修飾的。蛋白質的磷酸化修飾與多種生物學過程密切相關，如DNA損傷修復、轉錄調節、信號傳導、細胞凋亡的調節等。磷酸化蛋白質及多
磷酸化多肽及其修飾方法
蛋白質磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一種蛋白質翻譯后修飾，20世紀50年代以來一直被生物學家看作是一種動態的生物調節過程。在細胞中，大概有1/3的的蛋白質被認為是通過磷酸化修飾的。蛋白質的磷酸化修飾與多種生物學過程密切相關，如DNA損傷修復、轉錄調節、信號傳導、細胞凋亡的調節等。磷酸化蛋白質
我所基于納米離子通道器件開發出檢測SUMO1蛋白的新方法
原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202307/t20230721_6814330.html 近日，我所生物技術研究部生物分離與界面分子機制研究組（1824組）卿光焱研究員團隊和生物分子高效分離與表征研究組（1810組）張麗華研究員團隊合作，在蛋白質SUM
2019年云序RNA甲基化修飾領域文章匯總
感恩有你，一路同行！2019年末，云序生物攜全體員工對一直以來關心和支持公司發展的廣大新老客戶致以最誠摯的問候！光陰如梭，一年轉瞬又將成為歷史，新的一年意味著新的起點、新的機遇、新的挑戰，決心再接再厲，更上一層樓。回首即將過去的2019，云序生物不斷創新，碩果累累；展望2020，任重道遠卻信心倍
最新高分文章套路－|－強強聯合（脂質組+DIA），IF>10
脂質組學技術 相比其他組學技術，脂質組學技術發展較晚，新穎性高，僅僅只是純數據分析也可以發表在不錯的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂質功能或者往上游的蛋白或基因出發研究脂代謝調控機制。 【純組學數據分析發文】 PNAS | 脂質組學揭示病毒感染引起的脂代謝異常及
最新高分文章套路－|－強強聯合（脂質組+DIA），IF>10
脂質組學技術 相比其他組學技術，脂質組學技術發展較晚，新穎性高，僅僅只是純數據分析也可以發表在不錯的期刊上。如果希望研究得更高深入，可以往下游脂質功能或者往上游的蛋白或基因出發研究脂代謝調控機制。 【純組學數據分析發文】 PNAS | 脂質組學揭示病毒感染引起的脂代謝異常及
Sumo化蛋白定量試劑盒—小泛素化研究
眾所周知，泛素（ubiquitin, Ub）是一類高度保守的小蛋白, 可與靶蛋白的賴氨酸殘基共價連接, 形成多聚泛素鏈行使指導蛋白質降解的功能。類似于泛素化修飾過程, 小泛素相關修飾物(small ubiquitin related modifier, SUMO）也可以共價修飾靶蛋白的賴
云序RNA修飾技術在華南農大余義勛課題組植物m1A修飾...2
2. m6A甲基轉移酶METTL3的泛素化調節其功能??發表期刊：Nucleic Acids Research影響因子：11.147發表日期：2018.06.01實驗方法：?m6A-seq，RNA-seq，MeRIP-PCR，RIP等（云序提供）??上海交通大學醫學院余健秀組在著名期刊《核酸研究》發
多肽磷酸化修飾及檢測方法
磷酸化影響著細胞生命的方方面面。在細胞中，大概有1/3的的蛋白質被認為是通過磷酸化修飾的。蛋白質的磷酸化修飾與多種生物學過程密切相關，如DNA損傷修復、轉錄調節、信號傳導、細胞凋亡的調節等。磷酸化蛋白質及多肽的研究可以幫助人們闡述上述過程的機理，進一步認識生命活動的本質。肽谷生物依據自身原料優勢和技
蛋白質PEG化修飾與純化
聚乙二醇具有較廣的分子量分布，隨著平均分子量的不同，性質也產生差異，當分子量小于1000Da時，聚乙二醇是無色無臭粘稠的液體，高分子量的聚乙二醇則是蠟狀白色固體，固體聚乙二醇的熔點正比于分子量，逐漸接近67℃的極限。毒性隨分子量的增加而減少，小于400Da的 PEG在體內會經乙醇脫氫酶降解成有毒的代
上海巴斯德所揭示調控流感病毒存活的新機制
7月24日，中國科學院上海巴斯德研究所分子病毒課題組的研究論文Sumoylation of Influenza A Virus Nucleoprotein Is Essential for Intracellular Trafficking and Virus Growth（《A型流感病毒NP
中藥配方顆粒——附子黃芩配伍分析
用Q Exactive 高分辨質譜對附子單煎組、黃芪單煎組、附子黃芪合煎組、附子黃芪混合的化學成分進行系統分析，以期為黃芪對附子的解毒機理提供物質基礎。 利用Compound Discoverer 軟件，結合標準中藥數據庫，共鑒定179 種可能的中藥成分，主要為氨基酸、生物堿、黃芪皂苷、黃酮類
RNA修飾技術在華南農大余義勛組植物m1A－調控機制的運用
RNA甲基化修飾在調控生物生長發育的過程中起重要作用，m6A和m5C在植物體內的產生機制和生物學功能已有較多研究論文發表，然而RNA m1A（N1-甲基腺嘌呤）修飾在植物中的研究還非常少。 近日，Plant Physiology 在線發表了華南農業大學余義勛課題組題為“The N1-met
NLRP3磷酸化修飾與炎癥小體通路激活的調控機制
9月21日，Molecular Cell在線發表了國家生物醫學分析中心李濤研究員和周濤研究員合作的題為“NLRP3 phosphorylation is an essential priming event for inflammasome activation”的最新研究成果。該文報道了磷
解析糖基化修飾及位點分析
經常聽到糖基化修飾，今天帶大家一探究竟。什么是糖基化修飾呢？糖基化是在糖基轉移酶的控制下，蛋白質或脂質附加上糖類的過程，發生于內質網和高爾基體。糖基化修飾是一類非常重要的翻譯后修飾，大部分膜蛋白和分泌蛋白均為糖蛋白，糖基化修飾不僅影響蛋白質的空間構象、活性、運輸和定位，同時在信號轉導、分子識別，
百人博士最新Nature子刊文章：泛素化修飾的特殊因子
細胞內蛋白泛素化經由泛素-蛋白酶體途徑實現。在這個過程中，一系列酶（E1、E2和E3）調控泛素鏈組合體，而且當正確的泛素化發生之后，一個冗余的或受損的蛋白就會被蛋白酶體破壞掉，關于泛素鏈形成的機制尚不是十分清楚。 來自中國科學院動物研究所，美國國立衛生研究院的研究人員近期發現在蛋白質泛素化修飾
云序RNA修飾技術余義勛課題組植物m1A修飾調控機制的運用
導讀 RNA甲基化修飾在調控生物生長發育的過程中起重要作用，m6A和m5C在植物體內的產生機制和生物學功能已有較多研究論文發表，然而RNA m1A（N1-甲基腺嘌呤）修飾在植物中的研究還非常少。 近日，Plant Physiology 在線發表了華南農業大學余義勛課題組題為“The
云序高分文章利器：?ctDNA（羥）甲基化測序案例分享
新型腫瘤標志物篩選利器-----ctDNA（羥）甲基化測序 cfDNA（Cell free DNA）是人體組織排放到血液、尿液或腦脊液等循環體系中降解的DNA小片段，是一種新型的分子標記物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指來源于腫瘤細胞的cfDNA，是液體活檢主
云序高分文章利器：?ctDNA（羥）甲基化測序案例分享
新型腫瘤標志物篩選利器-----ctDNA（羥）甲基化測序 cfDNA（Cell free DNA）是人體組織排放到血液、尿液或腦脊液等循環體系中降解的DNA小片段，是一種新型的分子標記物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指來源于腫瘤細胞的cfDNA，是液體活檢主
羅元明副研究員：生物質譜與蛋白翻譯后修飾研究方法學
2013年12月8日，由首都醫科大學附屬北京朝陽醫院、AB SCIEX公司主辦的第四十期質譜沙龍活動在北京朝陽醫院順利舉辦，來自北京師范大學、北京朝陽醫院、中科院微生物所、空軍總醫院的百余名專家學者齊聚一堂共同參加了此次沙龍活動，分析測試百科
使用Azurespot分析軟件定量非磷酸化與磷酸化蛋白
在上期我們回顧了使用多重來成像磷酸化蛋白的技巧，在這部分中，我們將介紹使用Azurespot分析軟件進行定量。 背景去除 背景扣除對于有效定量是必不可少的。 例如，AzureSpot有五個自動后臺選項和三個手動選項。 > 如果背景不均勻，請使用 Rolling Bal
使用Azurespot分析軟件定量非磷酸化與磷酸化蛋白
??背景去除背景扣除對于有效定量是必不可少的。?例如，AzureSpot有五個自動后臺選項和三個手動選項。>?如果背景不均勻，請使用?Rolling Ball。 類似指定半徑的圓盤在泳道輪廓下“滾動”，對信號求平均，從而產生平滑小的變化。 半徑越大，滾動越平滑。>?如果輪廓的末端與輪廓的其余部分沒有
NSMB：科學家發現調節基因組復制的代碼信號
三年前，來自西班牙國家癌癥研究中心的研究者首次對干預細胞重要過程的特殊蛋白進行了描述，該細胞過程即細胞分裂期間遺傳物質的復制過程，當時研究者發現，DNA復制的關鍵基因組區域充滿著特殊蛋白的修飾，即為小分子泛素樣修飾蛋白（Small ubiquitin-like modifier， SU
首次發現類泛素蛋白SUMO修飾在ZGA過程中有潛在重要功能
6月21日，北京大學分子醫學研究所汪陽明研究組與胡新立以及清華大學那潔實驗室合作在PLOS Biology在線發表最新研究成果“DPPA2/4 and SUMO E3 ligase PIAS4 opposingly regulate zygotic transcriptional program
廈門大學博導發文：糖異生抑制癌癥的新機制
近年來很多研究集中在闡明糖酵解對腫瘤的調控作用。然而，與糖酵解相對應的并主要在肝臟中進行的糖異生過程與腫瘤的相關性卻少有報道。近期來自廈門大學生科院的研究人員揭示了核受體Nur77通過抑制糖異生通路中的限速酶磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1（PEPCK1）的SUMO化修飾，從而穩定其蛋白水平，最終促進糖
廈門大學博導發文Nature子刊：糖異生抑制癌癥的新機制
近年來很多研究集中在闡明糖酵解對腫瘤的調控作用。然而，與糖酵解相對應的并主要在肝臟中進行的糖異生過程與腫瘤的相關性卻少有報道。近期來自廈門大學生科院的研究人員揭示了核受體Nur77通過抑制糖異生通路中的限速酶磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1（PEPCK1）的SUMO化修飾，從而穩定其蛋白水平，最終促進糖