RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止?
近日,南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化(polyadenylation)的轉錄本在內的多種轉錄終止過程中的RNA中間產物(圖1)。結果顯示,擬南芥不同基因的轉錄終止范圍分布很廣,從50 nt到超過1000 nt。研究團隊應用此方法檢測atxrn3和fpa,以及DNA甲基轉移酶met1等一系列突變體,發現在atxrn3中轉錄終止距離變長,fpa中有出現多基因嵌合轉錄本, met1中基因區CG甲基化的丟失對轉錄終止沒有明顯影響。相關成果以“Landscape of transcription termination in Arabidopsis revealed by single-molecule nascent R......閱讀全文
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止?
近日,南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化(polyadenylation)的轉錄本在
全基因組及轉錄組測序案例分析
案例:應用全基因組測序和 RNA 測序來描繪常見的變異型免疫缺陷綜合癥(CVIDs)的基因圖譜 背景:常見的變異型免疫缺陷綜合癥(CVIDs)是機體免疫應答反應中不能產生抗體的最主要原因。CVIDs 變異度很高,大概 5% 的病人是由基因改變引起的。 目的:利用 Illumina HiSeq25
抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗
實驗方法原理 一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。實驗材料 N-表達質粒E.coil N567 感受態細菌試劑、試劑盒 儲存液緩沖液儀器、耗材 蛋白胨培養基蛋白胨平板N-表達質粒組合文庫培養板實驗步驟 ―、材料與設備1. 通過比較 β-半乳糖苷酶表達
抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。 實驗材料 N-表達質粒 E.coi
抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗
一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。實驗材料N-表達質粒E.coil N567 感受態細菌試劑、試劑盒儲
RNA聚合酶轉錄終止子
中文名終止子外文名terminator T定義終止子(terminator T)是給予RNA聚合酶轉錄終止信號的DNA序列。在一個操縱元中至少在結構基因群最后一個基因的后面有一個終止子。作????用轉錄終止信號
全轉錄組測序文章
研究背景? ? ?? 長鏈非編碼RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍被認為是一類不能編碼蛋白的長鏈RNA。由于其序列較長,所以可以有較大的潛力形成多種復雜構象,從而通過不同生物學途徑發揮其作用。此外,由于其不具備蛋白編碼能力,因此此類RNA也主要由其堿基序列形成的高級
我國科學家對桃進行全基因組重測序 繪制進化路線
我們平時吃的桃是如何進化而來的?近日,一項針對桃的全基因組重測序研究揭開了這一謎底。該研究對84份桃種質進行重測序,在全基因組水平上繪制了從光核桃到普通桃的進化路線,并鑒定了與人工選擇相關的候選基因,揭示了桃的進化歷史及人類活動對果樹的影響。 這項研究由中國農業科學院鄭州果樹研究所王力榮研究團
Nature子刊發布重磅測序技術:基因組和轉錄組平行測序
四月二十七日的Nature Methods雜志上發布了一項引人注目的測序技術,G&T-seq(Genome and Transcriptome Sequencing)。該技術能夠實現大規模的DNA和RNA平行測序,同時展現單個細胞的基因組序列和基因活性。 研究人員用G&T-seq對220個小鼠
Nature公布新興測序技術繪制的人類組織RNA多樣性
由紐約基因組中心和布羅德研究所的科學家完成了一項對人類組織中RNA多樣性的研究,最近發表在Nature雜志上。當遺傳密碼轉錄成RNA時,一個基因通常會產生幾種不同形式的RNA分子,或具有不同功能的轉錄本。雖然這一現象幾十年來一直為人所知,但人類轉錄本的目錄仍然不完整。“我們配備了最新的測序技術,能夠