定量蛋白質組學的技術發展
以質譜為基礎的定向蛋白質組學研究領域的發展歷程并不短，早在上個世紀70年，三重四極桿質譜儀就已經出現，并在80年代首次在發表的文章中，證明可以被用來檢測肽段。 過去幾年間，更廣泛的范圍內定向質譜技術的應用迅速攀升，而且新方法，新工具，新資源和新一代方法，也令更多研究領域的科學家們能利用到這項技術。另外一篇文章：“Targeted proteomics”介紹了質譜為基礎的定向蛋白質組學技術在生物學實驗室中的重要性。......閱讀全文
方案10－定量蛋白質組學的體內蛋白質同位素標記實驗
實驗材料釀酒酵母試劑、試劑盒丙酮乙腈NH4HCO3細胞生長培養基干冰冰水2-巰基乙醇甲醇鐵氰化鉀蛋白提取試劑組合蛋白酶抑制劑硫代硫酸鈉儀器、耗材離心蒸發儀離心管血細胞計數器孵育器MALDI- TOF 質譜儀和 LC-MS MS 系統超聲波破碎儀分光光度計實驗步驟一、培養細胞二、提取蛋白的細胞準備三、
蛋白質組，蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然，不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
蛋白質組，蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然，不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
蛋白質組學的研究內容
主要有兩方面，一是結構蛋白質組學，二是功能蛋白質組學。其研究前沿大致分為三個方面： ①針對有關基因組或轉錄組數據庫的生物體或組織細胞，建立其蛋白質組或亞蛋白質組及其蛋白質組連鎖群，即組成性蛋白質組學。 ②以重要生命過程或人類重大疾病為對象，進行重要生理病理體系或過程的局部蛋白質組或比較蛋白質組學
蛋白質組學的樣品制備
想要研究蛋白質，首先要得到高度純化且具有生物活性的目的物質，因此，蛋白樣品的制備是重要前提。蛋白提取的質量和效果對后續的研究分析有重要影響。不同種類的樣本在制備過程中，存在一些差異，要根據樣本特征調整實驗方案和操作細節。基本原則樣品處理盡量簡單，減少蛋白損失；盡量避免蛋白的降解；盡可能提高樣品蛋白的
蛋白質組學+AI技術
人們在吞咽的時候，頸部有個器官會隨著吞咽動作上下活動，它就是甲狀腺。西湖歐米有望實現臨床轉化的第一個項目，就是基于蛋白質標志物的甲狀腺結節的良惡性診斷。甲狀腺很小，但它影響到五臟六腑。數據顯示，每5個成年人中就可能有1人患有甲狀腺結節。其中，約60%的甲狀腺結節都是良性的。但有10%的結節是惡性的，
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的，它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前，在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的，它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前，在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
什么是蛋白質組學
(Marc Wilkins（1994))A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.The study of protein
蛋白質組學研究技術
可以說，蛋白質組學的發展既是技術所推動的也是受技術限制的。蛋白質組學研究成功與否，很大程度上取決于其技術方法水平的高低。蛋白質研究技術遠比基因技術復雜和困難。不僅氨基酸殘基種類遠多于核苷酸殘基（20/ 4）， 而且蛋白質有著復雜的翻譯后修飾，如磷酸化和糖基化等，給分離和分析蛋白質帶來很多困難。此外，
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的，它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前，在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
大連化物所定量蛋白質組學新技術新方法研究取得進展
近日，中科院大連化學物理研究所生物分離分析新材料與新技術研究組(1809組)鄒漢法、葉明亮研究員等人在定量蛋白質組學新技術新方法研究方面取得新進展。相關研究成果發表在最新一期的Angew. Chem. Int. Ed.上(2013年52卷，9205-9209頁)。 該項研究工作利用胰蛋
蛋白質組學技術的功能介紹
“讀”，在字典里的意思是識取、讀取，放在蛋白研究中可以理解為對生物樣本中未知單一蛋白或復雜蛋白的篩選、鑒定或者定量檢測。 自2003年4月14日人類基因組計劃（HGP）宣告完成以來，基因組研究取得了舉世矚目的成就。基因組學雖然在基因活性和疾病的相關性方面為人類提供了有力證據，但實際上絕大
蛋白質組學技術的功能介紹
“讀”，在字典里的意思是識取、讀取，放在蛋白研究中可以理解為對生物樣本中未知單一蛋白或復雜蛋白的篩選、鑒定或者定量檢測。自2003年4月14日人類基因組計劃（HGP）宣告完成以來，基因組研究取得了舉世矚目的成就。基因組學雖然在基因活性和疾病的相關性方面為人類提供了有力證據，但實際上絕大多數疾病并不是
蛋白質組學鑒定技術流程
蛋白質組（Proteome）的概念，蕞早由澳大利亞Macquarie大學的Wilkins和Williams于1994年首先提出的，是指一個基因組（Genome），或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。蛋白質組學（Proteomics）以細胞、組織或生物體全體蛋白質為研究對象，通過高通量的色譜質譜聯用技術
蛋白質組學入門問題FAQ
常見問題———?HPLC 篇?1 ． HPLC 靈敏度不夠的主要原因及解決辦法?樣品量不足：解決辦法為增加樣品量?樣品未從柱子中流出：可根據樣品的化學性質改變流動相或柱子?樣品與檢測器不匹配：根據樣品化學性質調整波長或改換檢測器?檢測器衰減太多：調整衰減即可。?檢測器時間常數太大：解決辦法為降低時間
蛋白質組學質譜分析
Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la
蛋白質組學入門問題集錦
1 ． HPLC 靈敏度不夠的主要原因及解決辦法 樣品量不足：解決辦法為增加樣品量 樣品未從柱子中流出：可根據樣品的化學性質改變流動相或柱子 樣品與檢測器不匹配：根據樣品化學性質調整波長或改換檢測器 檢測器衰減太多：調整衰減即可。 檢測器時間常數太大：解決
蛋白質組學實驗技術大全
每一個領域的發展都是基于技術的進步和革新，蛋白質組學亦然。蛋白質的可變性和多樣性等特殊性質導致了蛋白質研究技術遠遠比核酸技術要復雜和困難得多，但正是這些特性參與和影響著整個生命過程。在開始實驗之前，先看看這篇技術簡介吧。一?蛋白質與DNA相互作用在許多的細胞生命活動中，例如DNA復制、mRNA轉錄與
不同標記與非標記蛋白質組學定量準確性分析研究
通過質譜法進行定量蛋白質組分析為生物醫學探索研究提供非常重要的途徑。 然而，了解生物樣品中的定量限制對于準確判斷結果非常重要。通過使用加入已知濃度的蛋白質標準品的復雜樣本，科學家們研究了無標記（label free）和基于標記（TMT和iTRAQ）的肽定量的定量限制，包括前體混合的評估及其對同重
首個水稻全景定量蛋白質組圖譜發布
中國農業科學院生物技術研究所近日聯合國內多家單位，共同繪制了水稻全景定量蛋白質組圖譜，為水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白質表達量資源，也為基因組學、蛋白質組學等多組學數據支撐作物智能設計育種提供了新思路。相關研究成果發表在國際期刊《自然植物》上。植物的所有組織、器官中都富含蛋白質，它是構成細胞和生
首個水稻全景定量蛋白質組圖譜發布
中國農業科學院生物技術研究所近日聯合國內多家單位，共同繪制了水稻全景定量蛋白質組圖譜，為水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白質表達量資源，也為基因組學、蛋白質組學等多組學數據支撐作物智能設計育種提供了新思路。相關研究成果發表在國際期刊《自然植物》上。 植物的所有組織、器官中都富含蛋白質，它是構成
測序技術發展過快？基因組學千萬大獎告吹
X獎基金會近日決定取消了獎金高達1000萬美元的基因組學Archon X獎(Archon Genomics X Prize)，因為基因組測序成本的直線下降已使得競爭毫無意義。 X獎基金會的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了關閉競賽的決定。他表示，這是因為如今
蛋白質組學不能被基因組和轉錄組取代
基因和蛋白并不存在嚴格的線性關系ORF并不預示一定存在相應的功能性基因mRNA水平并非與蛋白質的表達水平對應翻譯后修飾及同工蛋白質（isforms)等現象在基因水平無從表現
iTRAQ定量蛋白質組學技術分析抗菌肽F1的抗菌機制研究
本研究利用iTRAQ定量蛋白質組學分析技術，對抗菌肽F1處理的大腸桿菌及空白對照在不同時間段菌體的生長速率以及其產生的蛋白質進行了分析與鑒定，通過比較實驗組與對照組蛋白質表達水平差異，以期了解抗菌肽F1的抗菌機制。 抗菌肽在農業和食品工業中受到越來越多的關注，因為它們具有控制病原體的潛力。然而
定量蛋白質組學方法獲得了泛素化分布和動態變化信息的介紹
泛素化是真核生物特有的翻譯后修飾，在哺乳動物細胞中，泛素化靶向～100,000?個位點，并由約640種泛素化酶和約90種去泛素化酶可逆調控。盡管目前泛素化已被廣泛關注和研究，但對蛋白質特定位點的泛素化比例（占有率）進行量化的研究卻很少。因此本文主要通過定量蛋白質組學方法，量化了人類細胞中蛋白質組范圍
Aebersold研究組發布用于全蛋白質組的高通量定量方法
瑞士蘇黎世聯邦理工學院的研究人員領導的一個研究小組，已制定了一個質譜工作流，用于對整個蛋白質組進行高通量的絕對定量。 據ETH的研究者、該研究的領頭人Ruedi Aebersold說，對于多種形態，該技術實現了目標蛋白質組的重現性定量，提供用于
《Nature》：新方法提高單細胞蛋白質組學質譜定量準確度
單細胞蛋白質組學在蛋白豐度檢測、轉錄修飾和翻譯后修飾方面填補了單細胞轉錄組學的空白。單細胞蛋白質組學質譜（SCoPE-MS）是近年來興起的一種定量分析多功能單細胞蛋白質組的方法，這種方法采用同位素標記和載體蛋白質組學來分析單個細胞【1】。同位素標記具有相同質量的化學標簽，其中包含了獨特的質量條碼
蛋白質組學的主要功能
蛋白質組學集中于動態描述基因調節，對基因表達的蛋白質水平進行定量的測定，鑒定疾病、藥物對生命過程的影響，以及解釋基因表達調控的機制.作為一門科學，蛋白質組研究并非從零開始，它是已有20多年歷史的蛋白質(多肽)譜和基因產物圖譜技術的一種延伸.多肽圖譜依靠雙向電泳(Two-dimensionalgele
蛋白質組學幫你找到衰老的秘密
最近，研究人員發現，正常的和病理性的多肽組學變化，可能會增進我們對于衰老分子機制的理解。蛋白質組學分析與治療相結合，可能會影響病理性衰老。 這是第一次有研究人員成功地在分子水平上展示了正常衰老和病理性衰老之間的差異。在一項最大的蛋白質組衰老研究中，德國Leibniz衰老研究所 ——Fritz