790萬元成交！這家公司中標北京神外所質譜儀采購項目
北京市神經外科研究所神外所4D高通量高深度蛋白質組學平臺建設項目-3質譜儀采購項目公開招標，預算金額790萬元，現北京融京科技發展有限公司中標，詳細內容如下：公告信息：采購項目名稱神外所4D高通量高深度蛋白質組學平臺建設項目-3質譜儀采購項目品目貨物/專用設備/醫療設備/其他醫療設備采購單位北京市神經外科研究所行政區域北京市公告時間2023年09月22日 11:20預算金額￥790.000000萬元（人民幣）聯系人及聯系方式：項目聯系人臧妍、梁瀟項目聯系電話010-85343428采購單位北京市神經外科研究所采購單位地址北京市豐臺區南四環西路119號采購單位聯系方式李老師 010-59976728代理機構名稱北京國際貿易有限公司代理機構地址北京市朝陽區建國門外大街甲3號代理機構聯系方式臧妍、梁瀟 010-85343428 一、項目信息 采購人：北京市神經外科研究所 項目名稱：神外所4D高通量高深度蛋白質組學平臺建設項目-3......閱讀全文
蛋白質組學之逆襲，深度注釋基因組
申請課題缺創新點？撰寫論文沒思路？急著畢業時間緊？別怕，對于吉凱，一切都是套路！更有甚者，對于宇宙終極難題：“屌絲如何逆襲白富美？”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。 從前，在生物學研究領域，有一個白富美叫基因組學（Genomics），她有一項強大的技能：DNA測序，憑借這項技能，她完
張玉奎院士：蛋白質組學深度覆蓋
分析測試百科網訊 2016年9月23日-26日，由中國儀器儀表學會原子光譜專業委員會主辦，武漢大學化學與分子科學學院承辦的第四屆全國原子光譜及相關技術學術會議在武漢大學召開。中科院大連化物所的張玉奎院士在閉幕當天的大會報告上作題為《蛋白質組學深度覆蓋》的精彩報告。中科院大連化物所 張玉奎院士
790萬！神外所4D高通量高深度蛋白質組學平臺采購公告
項目概況 神外所4D高通量高深度蛋白質組學平臺建設項目-3質譜儀采購項目 招標項目的潛在投標人應在北京市政府采購電子交易平臺 網址：http://zbcg-bjzc.zhongcy.com/bjczj-portal-site/index.html#/home獲取招標文件，并于2023-08-11
蛋白質組學之逆襲：深度注釋基因組（三）
人類尚未充分認識復雜的癌癥基因組是如何轉化為導致復發和死亡的驅動生物學的，將蛋白質組學與基因組學結合在一起能夠讓我們獲得對癌癥的新認識，同時提供一種有價值的資源以便科學界能夠用來提出關于這些疾病的新假設，以及治療它的手段。蛋白質基因組學終有一天會被證明是一種強大的臨床工具，使得人類能夠橫跨癌癥基因組
蛋白質組學之逆襲：深度注釋基因組（一）
申請課題缺創新點？撰寫論文沒思路？急著畢業時間緊？別怕，對于吉凱，一切都是套路！更有甚者，對于宇宙終極難題：“屌絲如何逆襲白富美？”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。從前，在生物學研究領域，有一個白富美叫基因組學（Genomics），她有一項強大的技能：DNA測序，憑借這項技能，她完成了對多種物
蛋白質組學之逆襲：深度注釋基因組（二）
針對一些乳腺癌亞型和攜帶常見突變如PIK3CA和TP53突變的腫瘤，分析結果揭示出了一些新的蛋白質標記物和信號通路。另外將一些基因中的拷貝數改變與蛋白質水平聯系一起，從而鑒別出了10個新的候選調控因子。其中兩個候選基因SKP1和 CETN3可能與癌基因EGFR有關聯。EGFR是一種特別具有侵
布魯克：利用CCS檢測和深度學習研究4D蛋白質組學
近日，Matthias Mann教授團隊和Fabian Theis教授組*共同在《Nature Communication》上發表開創性成果，標題為“Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from
高友鶴：尿液蛋白質組學－實現更早期的診斷
“早發現、早診斷、早治療”是干預疾病向危重癥發展的關鍵，是醫生和患者的共同心愿。許多慢性疾病的及早治療可以顯著提高患者的生命質量，極大減輕國家、社會和個人的醫療負擔，因此，探索疾病早期生物標志物具有十分重要的意義。 生物標志物是與機體生理及病理狀態相關的可監測到變化的生化指標。蛋白質組學是精準
蛋白質組與蛋白質組學簡介2
3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合，然后將DNA從被修飾的堿基處切割，電泳分離，結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾，不能切斷，可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白
蛋白質組與蛋白質組學簡介1
一、蛋白質組概念：一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表
Nature子刊實驗室洞察：高通量蛋白質組學方法學綜述
????在后基因組時代，蛋白質組學在生物醫學研究中發揮著重要作用。2022年8月，Nature子刊《Laboratory Investigation》發表了一篇高通量蛋白組的mini-review，概述了高通量蛋白質組學技術、統計和算法的進展。????蛋白質組學作為蛋白質組實驗和數據分析的結合，從整
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（六）
圖 9 四級桿 - 飛行時間質譜在兩個不同二級質譜掃描速率下，對同一個二價前體離子 LVGDLDDAQVDVER 二級質譜圖的比較。而 LTQ Velos 離子阱對同一前體離子檢測只用了 80% 的樣品量。結論：在一個復雜的蛋白質組樣品中，高靈敏的檢測和鑒定化合物對于了解和認知動態蛋白質學具有極其重
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（三）
表 3 四級桿 - 飛行時間質譜儀采集參數軟件平臺Proteome Discoverer搜索引擎MASCOT v 2.1數據庫NCBI, April 2008最大漏切數目1前體離子容忍度離子阱數據 : 1.4 Da四級桿飛行時間質譜數據 : 40 ppm碎片容忍度離子阱數據四級桿飛行時間質譜數據 :
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（四）
如圖 4 所示，在不同儀器之間，有很多蛋白會重復出現，即被不同儀器同時鑒定到。在 60 分鐘的分離過程中， LTQ Velos 雙壓離子阱鑒定到了 LTQ XL 得到到蛋白數目的 88% ， LTQ Velos 雙壓離子阱鑒定到了 Q-TOF 得到蛋白數目的 90% ，此外，還有 570 個
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（五）
圖 6 1ug C.elegans 蛋白胰酶酶解物在反相色譜分離的基峰圖，四級桿飛行時間質譜和 LTQ Velos 線性離子阱全掃描動態范圍的比較Q-TOF 掃描速率對靈敏度的影響 如圖 7 所示，將 Q-TOF 掃描速率從 3Hz 升至 6Hz ，導致鑒定到肽段數目減少，這主要是因為隨著 Q-TO
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（一）
Tonya Pekar Second, Justin Blethrow, Jae C. Schwartz, Vlad Zabrouskov, Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA關鍵詞：LTQ Velos 線性離子阱，蛋白質學，蛋白鑒定，肽測序、靈敏度、蛋白質
新型雙壓線性離子阱質譜儀給蛋白質組學帶來革...（二）
實驗 樣品制備 C.elgans 勻漿液的可溶性部分用 pH7.8 的碳酸氫銨稀釋，加入 0.1% 的 RapiGest 表面活性劑，解釋用二硫蘇糖醇在 100 ℃ 還原二硫鍵，并用碘乙酰胺對半胱氨酸烷基化。樣品解釋用對 K/R 特異性酶酶切 4 個小時。酶解物質酸化后存放至 -80 ℃ 。
蛋白質組，蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然，不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
蛋白質組，蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然，不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
組學發展的機遇與挑戰，－－高通量成為組學研究關鍵因素
近年來隨著新技術的不斷涌現，加快了組學研究飛速發展。特別是生命科學領域，隨著基因組學、轉錄組學、蛋白組學、代謝組學以及脂質組學技術的不斷完善與進化，組學向分子水平的各個分支領域不斷進化和完善，研究者更是利用組學研究思路和手段，不斷推進衍生出了食品組學，金屬組學等新型組學研究方向，從而引領大組學研究不
葛瑛：光解表面活性劑助力高通量蛋白質組學
2020年2月25日，繼2019年在Nature Method [1]上發表文章后，威斯康星大學麥迪遜分校的細胞和再生生物學和化學系教授葛瑛(Ying Ge,相關鏈接：葛瑛教授研究團隊)團隊在 Angewandte Chemie Int Ed（2018 影響因子 12.257）上再次發表文章 [
蛋白質組學研究技術
可以說，蛋白質組學的發展既是技術所推動的也是受技術限制的。蛋白質組學研究成功與否，很大程度上取決于其技術方法水平的高低。蛋白質研究技術遠比基因技術復雜和困難。不僅氨基酸殘基種類遠多于核苷酸殘基（20/ 4）， 而且蛋白質有著復雜的翻譯后修飾，如磷酸化和糖基化等，給分離和分析蛋白質帶來很多困難。此外，
蛋白質組學+AI技術
人們在吞咽的時候，頸部有個器官會隨著吞咽動作上下活動，它就是甲狀腺。西湖歐米有望實現臨床轉化的第一個項目，就是基于蛋白質標志物的甲狀腺結節的良惡性診斷。甲狀腺很小，但它影響到五臟六腑。數據顯示，每5個成年人中就可能有1人患有甲狀腺結節。其中，約60%的甲狀腺結節都是良性的。但有10%的結節是惡性的，
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的，它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前，在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
什么是蛋白質組學
(Marc Wilkins（1994))A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.The study of protein
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的，它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前，在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的，它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前，在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
Bruker新型IMPACT－HD質譜儀引起轟動的蛋白質組學研究新成果
布魯克IMPACT HD樹立了蛋白質組鑒別的新基準，實現超過8000個全蛋白分析，具備破紀錄的復雜生物樣品中痕量物質鑒定的分析能力 2013年6月10日——在Minneapolis會議中心召開的第61屆ASMS會議上，布魯克推出蛋白質組學和生物標志物研究中令人振奮的全新高精度質譜儀。ZL低噪聲
Aebersold研究組發布用于全蛋白質組的高通量定量方法
瑞士蘇黎世聯邦理工學院的研究人員領導的一個研究小組，已制定了一個質譜工作流，用于對整個蛋白質組進行高通量的絕對定量。 據ETH的研究者、該研究的領頭人Ruedi Aebersold說，對于多種形態，該技術實現了目標蛋白質組的重現性定量，提供用于
PlantScreen高通量表型組學平臺研究葉片衰老
韓國大邱基礎科學研究所Jeongsik Kim、Pyung Ok Lim等，利用PlantScreen大型高通量表型組學研究平臺，對植物葉片衰老進行了系列研究（參見論文：Jae IL Lyu etc. 2017. High-throughput and computational study