科學家構建涵蓋五大植物類群的150+物種參考代謝組及數據庫
11月11日，中國科學院分子植物科學卓越創新中心李軒團隊在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上，在線發表了題為RefMetaPlant: reference metabolome database for plants across five major phyla的研究成果。該研究闡述了植物“參考代謝組”概念，發展了參考代謝組圖譜的組裝方法，完成構建了五大植物類群——苔蘚植物、石松植物、蕨類植物、裸子植物和被子植物等類群的150多個植物物種的參考代謝組圖譜。同時，該研究開發了一系列與基因組分析工具（如BLAST）相似的代謝組分析工具（如RefMetaBlast），為探討植物代謝組多樣性和代謝物功能，提供了數據共享和分析平臺。 植物“參考代謝組”是指一個植物物種所有代謝物的總和。一個植物物種“參考代謝組”與代謝物之間的關系，類似于植物物種“參考基因組”與基因之間的關系。在億萬年進化過程中，植物發展......閱讀全文
如何看待代謝組學的前景
是不錯的，但是代謝組本身還是一個發展中的新型學科，一些關鍵性技術還有待突破，如果你只想使用代謝組學而不去深入的研究它的話就應該沒問題，如果想要進一步研究代謝組學方法就需要有相當的分析化學知識。現在世界前十的藥廠都在使用代謝組學進行藥學研究，所以它在里面的前景肯定是不會差的。隨著技術的發展肯定會越來越
進入前景光明的代謝組學
內容概要： 一、代謝組學在藥物研發中的應用 二、SiDMAP技術在疾病診斷中的應用 三、儀器公司的研究開發：ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研發分析代謝物的更為靈敏的檢測方法，而Bio-Rad公司正在發展用Holly Grail作
代謝組學樣本收集答疑解惑
樣本收集是代謝組學研究的第一步，是保障代謝組學研究結果可靠性的最重要的環節之一。根據不同的研究目的該選取何種生物樣本？不同種類的生物樣本的規范收集流程是什么？有哪些注意事項（抗凝劑、凍融、抑菌劑等使用細節）？如何保存生物樣本？可保存多久等等？這些都是代謝組學實驗中小伙伴經常咨詢的問題，本文將針對
定量代謝組學案列：用小分子代謝產物診斷腸癌
近年來，醫學領域的基礎研究日趨系統化和多學科交叉，系統生物學的迅猛發展翻開了臨床實踐、藥物研發的新篇章。作為國內較早涉足系統生物學研究的賈偉教授研究團隊，近年來應用代謝組學技術對各種臨床疾病的早期預測、診斷和預后的生物標志物進行了廣泛的研究，現以結直腸癌的系列研究為例介紹我們的研究進展。研究團隊首先
定量代謝組學案列：用小分子代謝產物診斷腸癌
近年來，醫學領域的基礎研究日趨系統化和多學科交叉，系統生物學的迅猛發展翻開了臨床實踐、藥物研發的新篇章。作為國內較早涉足系統生物學研究的賈偉教授研究團隊，近年來應用代謝組學技術對各種臨床疾病的早期預測、診斷和預后的生物標志物進行了廣泛的研究，現以結直腸癌的系列研究為例介紹我們的研究進展。
非靶向代謝組學中鑒定代謝產物適宜選用哪些分析方法
據相關科技要聞解讀表明非靶向代謝組學已逐步成為研究生命活動的重要基礎。它可高清呈現代謝產物的變化規律以及代謝種類，特別是那些評價高的非靶向代謝組學更是揭開了研究集體生命活動發生和發展的本質，現在就非靶向代謝組學中鑒定代謝產物更適宜選用哪些分析方法作簡要闡述：1.主成分分析（PCA）非靶向代謝組學中鑒
J－Proteome－Res:－代謝組學應用于微囊藻毒素代謝研究
微囊藻毒素(MCLR)，作為一種肝毒素，正在威脅著人類的公共衛生安全。在體內，肝臟是MCLR主要攻擊的器官，然而具體代謝變化目前任然未知。近日，中國科學院水生生物研究所謝平等研究人員在與上海敏芯信息科技公司的合作下，通過對灌服MCLR的大鼠模型進行代謝組學的研究，向我們揭示了MCLR擾亂肝臟代謝
實質等同性（代謝組學）實驗
實驗材料：SIMCA - P 多變量統計軟件 ?? 試劑、試劑盒：[ 1H ] - NMR 抽提劑 ? ? ?儀器、耗材：Eppendorf 聚丙稀管 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?NMR 管 ? ?
實質等同性（代謝組學）實驗
實驗材料SIMCA - P 多變量統計軟件試劑、試劑盒[ 1H ] - NMR 抽提劑儀器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波譜儀實驗步驟本章描述的方法最適合于分析小麥精白面，但改進后也適用于全面粉、麥麩或其他組織，如葉和根。在開展實質等同性代謝組學實驗前，如其他任何田間試驗或溫室
臨床代謝組學研究常見問題
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。Q：如何設置驗證集和測試集？A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這幾個數據集概念，通常
實質等同性（代謝組學）實驗
實驗材料 SIMCA - P 多變量統計軟件試劑、試劑盒 [ 1H ] - NMR 抽提劑儀器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波譜儀實驗步驟 本章描述的方法最適合于分析小麥精白面，但改進后也適用于全面粉、麥麩或其他組織，如葉和根。在開展實質等同性代謝組學實驗前，如其他任何田間試
合作成果丨靶向代謝組學
?????本文內容非商業廣告，僅供專業人士參考。關于島津? ? ? 島津企業管理（中國）有限公司是（株）島津制作所于1999年100%出資，在中國設立的現地法人公司，在中國全境擁有13個分公司，事業規模不斷擴大。其下設有北京、上海、廣州、沈陽、成都分析中心，并擁有覆蓋全國30個省的銷售代理 ????
代謝組學全流程解決方案
賽默飛基于其超高分辨的靜電場軌道阱（Orbitrap）質譜平臺結合其功能強大的軟件平臺，提供代謝組學全流程解決方案。該方案不僅覆蓋從極性代謝物到非極性代謝物的全面檢測、峰提取與定量、統計學分析與可視化作圖、代謝產物的全面鑒定、代謝通路分析等全流程的要求，而且還整合了從非靶標生物標記物發現到靶標生物標
鐵代謝是如何代謝的？
（一）鐵的來源1.來自食物，正常人每天從食物中吸收的鐵量1.0～1.5mg、孕婦2～4mg.2.內源性鐵主要來自衰老和破壞的紅細胞，每天制造紅細胞所需鐵20～25mg.（二）鐵的吸收動物食品鐵吸收率高（可達20%），植物食品鐵吸收率低（1%～7%）。食物中鐵以三價鐵為主，必須在酸性環境中或有還原劑如
膽紅素的代謝：肝內代謝
肝內代謝：肝臟對膽紅素有攝取、轉化、排泄的功能。1）攝取：膽紅素隨血運輸到肝后，在膜上與白蛋白解離，并被肝細胞攝取。肝細胞內有Y蛋白和Z蛋白的兩種色素受體蛋白。Y蛋白是肝細胞主要的膽紅素轉運蛋白，Z蛋白對長鏈脂肪酸具有很強的親和力。Y、Z蛋白與進入胞質的膽紅素結合，并將它運至內質網。2）轉化：肝細胞
代謝組學：一項艱巨的任務
學生化的孩子真是傷不起。糖代謝、脂代謝、核酸代謝，一系列代謝通路，一大堆代謝產物，簡直讓人頭暈眼花。然而，這又不能跳過。畢竟，DNA編碼蛋白質，而蛋白質在小分子上發揮其魔力。但很多時候，科學界對這些分子一無所知。 “如果你測定一滴血中的小分子，大約60% 所檢測到的峰都無法與任何代謝物相匹配，
臨床代謝組學研究常見問題（一）
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。 Q：如何設置驗證集和測試集？ A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這
AFADESI空間代謝組學高級研修班
為做好AFADESI空間代謝組學技術服務工作，由中國科學院高能物理研究所測試中心和中國科學院-香港大學金屬組學與健康和環境聯合實驗室共同承辦的“AFADESI空間代謝組學高級研修班”將于2023年4月26日-4月27日在京召開。在這里，我們將竭誠為您提供豐富的前沿應用信息和與專家零距離交流的平臺
臨床代謝組學研究常見問題（一）
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。 Q：如何設置驗證集和測試集？ A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這
綜述：代謝組學在疾病中的應用
代謝組學經歷了迅猛的技術演化在過去二十年。尤其是廣泛靶向代謝組學技術的新起，實現一次性檢測堅定上千種物質，同時能夠定量。整合了非靶向和靶向代謝物檢測技術的優點，創造性實現了高通量、高靈敏度靶向代謝物檢測，為定性、定量檢測大批量、低豐度代謝物提供了高效的方法。 應用代謝組學的定義事件的預測生
原位代謝組學分析方法與應用進展
2015年10月17日，第二屆全國質譜分析學術報告會在浙江大學紫荊港校區體育館盛大開幕，在5位院士的精彩報告后，多位學者做了高水平的大會報告。 中國醫學科學院/北京協和醫學院藥物研究所、中央民族大學再帕爾·阿不力孜教授：原位代謝組學分析方法與應用進展 中國醫學科學院/北京協和醫學院藥物研
代謝組學常使用的數據庫
代謝組主要是對小分子代謝物（一般50-1500 Da）進行高通量定性和定量分析，代謝組分析產生了大量的生物信息數據。代謝組數據庫的開發對于歸納總結這些大數據，方便后續的代謝組學數據分析，揭示隱藏在大數據背后的生物學機理具有十分重要的作用。 目前常用的代謝組學數據庫有HMDB、NIST、LMSD
代謝組學在中藥動態代謝和相互作用過程研究中的應用
賈偉教授團隊近年來建立了基于代謝組學策略的藥物動力學新方法，在分子水平上刻畫包括復方中藥和天然產物在內的多成分藥物（Multi-component Agents）在體內的整體、動態的代謝和相互作用過程。最近該團隊與上海中醫藥大學劉平教授團隊合作，采用高通量代謝組學平臺以及所建立的多組分藥物生物
代謝組學在中藥動態代謝和相互作用過程研究中的應用
賈偉教授團隊近年來建立了基于代謝組學策略的藥物動力學新方法，在分子水平上刻畫包括復方中藥和天然產物在內的多成分藥物（Multi-component Agents）在體內的整體、動態的代謝和相互作用過程。最近該團隊與上海中醫藥大學劉平教授團隊合作，采用高通量代謝組學平臺以及所建立的多組分藥物生
代謝組學在中藥動態代謝和相互作用過程研究中的應用
賈偉教授團隊近年來建立了基于代謝組學策略的藥物動力學新方法，在分子水平上刻畫包括復方中藥和天然產物在內的多成分藥物（Multi-component Agents）在體內的整體、動態的代謝和相互作用過程。最近該團隊與上海中醫藥大學劉平教授團隊合作，采用高通量代謝組學平臺以及所建立的多組分藥物生物
膽紅素代謝中的肝內代謝
肝內代謝：肝臟對膽紅素有攝取、轉化、排泄的功能。1）攝取：膽紅素隨血運輸到肝后，在膜上與白蛋白解離，并被肝細胞攝取。肝細胞內有Y蛋白和Z蛋白的兩種色素受體蛋白。Y蛋白是肝細胞主要的膽紅素轉運蛋白，Z蛋白對長鏈脂肪酸具有很強的親和力。Y、Z蛋白與進入胞質的膽紅素結合，并將它運至內質網。2）轉化：肝細胞
膽紅素代謝中的肝內代謝
肝內代謝：肝臟對膽紅素有攝取、轉化、排泄的功能。 1）攝取： 膽紅素隨血運輸到肝后，在膜上與白蛋白解離，并被肝細胞攝取。 肝細胞內有Y蛋白和Z蛋白的兩種色素受體蛋白。Y蛋白是肝細胞主要的膽紅素轉運蛋白，Z蛋白對長鏈脂肪酸具有很強的親和力。Y、Z蛋白與進入胞質的膽紅素結合，并將它運至內質網。
肝臟的代謝：蛋白質代謝
蛋白質代謝：（1）合成自身結構蛋白并合成多種血漿蛋白質，其中合成量最多的是白蛋白。（2）肝臟合成的許多凝血因子和纖維蛋白原等，在血液凝固功能上起重要作用。（3）有豐富的氨基酸代謝酶，轉化和分解氨基酸。（4）經鳥氨酸循環合成尿素（尿素是血中非蛋白含氮物質主要成分）。
α酮酸代謝的代謝過程
氨基酸脫氨后生成的 α-酮酸可進一步代謝。主要有以下三方面：1．經氨基化生成非必需氨基酸實驗證明人體不能合成賴、異亮、苯丙、亮、色、纈、蘇、蛋等8種氨基酸相對應的α-酮酸，因而這些氨基酸不能在體內合成，必須從食物攝取，稱為營養必需氨基酸。其它十二種氨基酸則稱為營養非必需氨基酸，所謂非必需氨基酸并不是
酮體代謝
由脂肪酸的β-氧化及其他代謝所產生的乙酰CoA，在一般的細胞中可進入三羧酸循環進行氧化分解，但在動物的肝臟、腎臟、腦、等組織中，尤其在饑餓、禁食。糖尿病等情形下，乙酰CoA還有另一條代謝去路。最終生成乙酸乙酯、β-羥基丁酸和丙酮，這三種產物統稱為酮體。 酮體是人體利用脂肪的正現象，對于不能利用脂