武漢植物園等長鏈非編碼RNA調控基因轉錄研究獲進展
長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)一般指長度大于200個核苷酸的非編碼RNA,目前已在多種生物中發現了大量lncRNA,然而只有少數lncRNA的精細作用機理被闡明。 中國科學院武漢植物園汪志偉博士在植物種群遺傳學科組王艇研究員支持和中國科學院留學基金資助下,與英國John Innes Centre 的Caroline Dean教授合作,通過突變體的篩選,發現CDKC;2雖為正向轉錄延伸因子P-TEFb復合體的激酶亞基,卻對擬南芥開花時間重要調控基因FLC的轉錄表現為抑制作用。前期研究在FLC位點發現了一組名為COOLAIR的反義轉錄本。受此啟發,本研究闡明CDKC;2直接促進COOLAIR的轉錄。進一步解析表明不含COOLAIR啟動子的FLC轉錄不受CDKC;2的影響。從而揭示出cdkc;2突變下調了COOLAIR的轉錄,進而擾亂了COOLAIR介導的抑制機制,最終導......閱讀全文
rna濃度太低能反轉錄么
要看你的rna濃度有多低,一般20ng/ul。rna濃度太低可能反轉不出來或者反轉不是目的產物,濃度太低建議不做。
原核細胞的RNA轉錄過程
原核細胞的RNA轉錄:原核細胞的RNA聚合酶全酶(a2Bβ'σ)是由4條多肽鏈組成的核心酶加σ因子構成轉錄過程可劃分為開始、延伸和終止三個階段。①開始:σ因子識別DNA分子上的啟動子并與之結合,將DNA雙鏈局部解開,RNA合成開始,σ因子與核心酶分離。②延伸:RNA聚合酶沿模板鏈向前移動,使
體外轉錄合成單鏈RNA探針:體外轉錄法
體外轉錄法l????????體外轉錄合成單鏈RNA探針1.??????用適當的限制酶消化超螺旋質粒DNA制備5 pmol的線性模板DNA。取一小份消化的DNA(100ng)進行瓊脂糖凝膠電泳分析。如有必要,再補加限制性酶進行溫育,直至不再殘存痕量的未消化DNA。2.??????如必須用產生3’突出端
“泛轉錄組”首次用于RNA測序分析
近日發表在《自然·方法》雜志上的一篇新論文中,美國加利福尼亞大學圣克魯斯分校(UCSC)的研究人員介紹了有史以來第一種使用“泛轉錄組”分析全基因組RNA測序數據的方法。 分析一個人的基因表達需要將他的RNA圖譜映射到一個標準參照物,以深入了解基因在多大程度上“開啟”并在體內發揮功能。但當參照物不
體外轉錄合成單鏈RNA探針
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 制備特異性的單鏈 RNA 探針不僅比 DNA 探針更容易,在雜交反應中一般也比具相同比活性的 DNA 探針產生更強的信號,這可能是由于含有 RNA 的雜合鏈固有的更高穩定性的緣故(Casey and Davidson 197
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子轉錄因子分子量(kD)功能TBP30與TATA盒結合TFⅡ-B33介導RNA聚合酶Ⅱ的結合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35穩定TFⅡ-D的結合TFⅡ-I120促進TFⅡ-D的結合
RNA測序解析白血病轉錄組
巴塞羅那基因組調控中心Dr. Roderic Guigó領導研究團隊,對慢性淋巴細胞白血病進行了轉錄組分析,獲得了CLL相關基因和突變的功能圖譜。這項工作發表在Genome Research雜志上。 這一項目是西班牙慢性淋巴細胞白血病基因組聯盟的最新成果,該聯盟曾鑒定了涉及CLL發展的
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子轉錄因子分子量(kD)功能TBP30與TATA盒結合TFⅡ-B33介導RNA聚合酶Ⅱ的結合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35穩定TFⅡ-D的結合TFⅡ-I120促進TFⅡ-D的結合
“泛轉錄組”首次用于RNA測序分析
近日發表在《自然·方法》雜志上的一篇新論文中,美國加利福尼亞大學圣克魯斯分校(UCSC)的研究人員介紹了有史以來第一種使用“泛轉錄組”分析全基因組RNA測序數據的方法。 分析一個人的基因表達需要將他的RNA圖譜映射到一個標準參照物,以深入了解基因在多大程度上“開啟”并在體內發揮功能。但當參照物
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子轉錄因子分子量(kD)功能TBP30與TATA盒結合TFⅡ-B33介導RNA聚合酶Ⅱ的結合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35穩定TFⅡ-D的結合TFⅡ-I120促進TFⅡ-D的結合
體外轉錄合成單鏈RNA探針
實驗方法原理?制備特異性的單鏈 RNA 探針不僅比 DNA 探針更容易,在雜交反應中一般也比具相同比活性的 DNA 探針產生更強的信號,這可能是由于含有 RNA 的雜合鏈固有的更高穩定性的緣故(Casey and Davidson 1977)。雖然 DNA 探針仍普遍地應用于 Norther
RNA聚合酶轉錄終止子
中文名終止子外文名terminator T定義終止子(terminator T)是給予RNA聚合酶轉錄終止信號的DNA序列。在一個操縱元中至少在結構基因群最后一個基因的后面有一個終止子。作????用轉錄終止信號
通過記錄RNA聚合酶觀察早期RNA轉錄動力學
科學家們通過記錄RNA聚合酶在何時何地通過與DNA序列結合啟動轉錄,觀察了早期RNA轉錄動力學。 生命的活動是通過蛋白質的制造而發生的,蛋白質賦予我們的細胞結構和功能。細胞蛋白質從DNA編碼的基因指令中獲得行進順序,他們的序列首先被復制并在一個叫做轉錄的多步驟過程中被制造成RNA。 科羅拉多
新RNA轉錄變體可簡化生物線路
近年來,合成生物學發展迅速,研究人員給微生物設計的功能也越來越復雜,但在細胞行為的可預測性、安全性和高效性方面仍有很多難以解決的問題。據每日科學網站5月30日(北京時間)報道,美國能源部勞倫斯伯克利國家實驗室生物學家創造出一種能放大RNA(核糖核酸)轉錄信號的變體,可大大簡化控制細胞行為的生物線
RNA干擾的體外轉錄的相關介紹
以DNA Oligo為模版,通過體外轉錄合成siRNAs,成本相對化學合成法而言比較低,而且能夠比化學合成法更快的得到siRNAs。不足之處是實驗的規模受到限制,雖然一次體外轉錄合成能提供足夠做數百次轉染的siRNAs,但是反應規模和量始終有一定的限制。而且和化學合成相比,還是需要占用研究人員相
信使RNA的啟動子和轉錄因子
一定義:酶識別、結合、開始轉錄的一段DNA序列。強啟動子2秒鐘啟動一次轉錄,弱啟動子10分鐘一次。 二原核生物:大腸桿菌在起點上游約-10堿基對處有保守序列TATAAT,稱為pribnow box,有助于局部解鏈。在其上游還有TTGACA,稱為-35序列,提供RNA聚合酶識別的信號。 三真核
Nature:針對RNA轉錄和剪接的新觀點!
細胞通常產生區室來控制重要的生物功能。細胞核就是一個很好的例子;它被核膜包圍著,容納著基因組。然而,細胞還含有未被膜包圍的較為短暫存在的封閉室,就像水中的油滴。在過去兩年中,這些稱為液滴狀“凝聚物(condensates)”的封閉室已越來越多地被認為是控制基因的主要參與者。如今,在一項新的研究中
信使RNA反轉錄的生物學意義
1.對分子生物學的中心法則進行了修正和補充,修正后的中心法則表示為: 2.在致癌病毒的研究中發現了癌基因,在人類一些癌細胞如膀胱癌、小細胞肺癌等細胞中,也分離出與病毒癌基因相同的堿基序列,稱為細胞癌基因或原癌基因。癌基因的發現為腫瘤發病機理的研究提供了很有前途的線索。 3.在實際工作中有助于
小干擾RNA轉錄后基因沉默的介紹
siRNA誘導的轉錄后基因沉默始于RNA誘導的沉默復合物(RISC)的組裝。該復合物通過切割編碼靶基因的mRNA分子來沉默某些基因表達。為了開始該過程,兩條siRNA鏈中的一條(引導鏈)將被裝載到RISC中,而另一條鏈即過客鏈被降解。某些Dicer酶可能負責將引導鏈加載到RISC中。然后,siR
捕獲早期RNA轉錄動力學的關鍵
生命的活動是通過蛋白質的制造而發生的,蛋白質賦予我們的細胞結構和功能。細胞蛋白質從DNA編碼的基因指令中獲得行進順序,他們的序列首先被復制并在一個叫做轉錄的多步驟過程中被制造成RNA。 科羅拉多州立大學的一個研究合作項目專門研究高分辨率熒光顯微鏡和計算模型,以實時、精細地可視化和描述這類生命過
外源性RNA的轉錄反應預測RNA病毒的廣譜抗病毒藥
所有RNA病毒都通過與正常運輸細胞RNA轉錄本不同的過程將其基因組傳遞到目標宿主細胞中。來自正常的細胞RNA轉錄的運輸。病毒RNA的傳遞最多。進入大多數細胞的病毒DNA的運輸因此觸發了先天的抗病毒防御機制,將病毒RNA識別為異物。反過來,病毒已經進化出了破壞這些防御的機制,讓它們在其中茁壯成長。
北京生科院提出環形RNA全長轉錄本解析技術
4月12日,中國科學院北京生命科學研究院趙方慶團隊在《自然-實驗手冊》(Nature Protocols)上,發表了題為Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究論文,建立了環形RNA全長
科研家提出環形RNA全長轉錄本解析技術
近日,中國科學院北京生命科學研究院趙方慶團隊在《自然-實驗手冊》(Nature Protocols)上,發表了題為Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究論文,建立了環形RNA全長轉錄本解析
Thogoto病毒的RNA轉錄和復制機制獲揭示
近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員熊曉犁團隊與廣州國家實驗室研究員陳新文團隊合作,在國家重點研發計劃、國家自然科學基金等項目的資助下,研究揭示了正黏病毒科Thogoto病毒的RNA轉錄和復制機制。相關成果發表于《自然-通訊》。THOV 聚合酶在RNA合成過程中呈現不同的構象。研究團隊供圖
Thogoto病毒的RNA轉錄和復制機制獲揭示
近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員熊曉犁團隊與廣州國家實驗室研究員陳新文團隊合作,在國家重點研發計劃、國家自然科學基金等項目的資助下,研究揭示了正黏病毒科Thogoto病毒的RNA轉錄和復制機制。相關成果發表于《自然-通訊》。 RNA的轉錄和復制是RNA病毒生命周期中至關重要的步驟
提取RNA-和反轉錄的操作注意事項
你按照買的反轉錄試劑盒來做就行.(1)、從細胞中提取細胞總RNA用GIBCO公司的Trizol試劑提取細胞總RNA.按試劑使用說明操作:離心收集細胞,傾去細胞液,向沉淀中加1 ml Trizo1(每106-107細胞),混勻至室溫5分鐘,用1 ml加樣器反復吹打,直至細胞完全裂解成均一溶液,不粘稠時
體外轉錄rna后用dnaase消化多少時間
v如果從細胞或者組織提取RNA,有可能看不見pellet。但是體外轉錄的RNA看不見pellet,著實奇怪。你入等體積的異丙醇/1ul Glycoblue,或者3倍體積的無水乙醇/0.1體積醋酸鈉/1ul Glycoblue,-80C沉淀過夜。次日高速離心30min,吸取液體時小小心。
Nat-Catalysis:RNA是如何保證被準確轉錄的?
生命的信息通過信使RNA的轉錄和蛋白質的翻譯在我們的基因組DNA中編碼以執行細胞功能。為了確保準確的轉錄, RNA聚合酶II將合成并校正信使RNA以去除任何不匹配的錯誤。 雖然已知RNA聚合酶II對于確保轉錄的準確性至關重要,但對于這種酶如何完成這項艱巨的任務而言,這是一個長期存在的難題。科學
上海生科院揭示反向剪接RNA成環與RNA轉錄的偶聯機制
4月19日,國際學術期刊Cell Reports 發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組與計算生物學研究所楊力研究組最新合作研究論文。此工作深入研究了環形RNA生成與RNA轉錄的偶聯機制,揭示了環形RNA在神經分化過程中表達上調原理。 環形RNA是一類通過反向
抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗
實驗方法原理 一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。實驗材料 N-表達質粒E.coil N567 感受態細菌試劑、試劑盒 儲存液緩沖液儀器、耗材 蛋白胨培養基蛋白胨平板N-表達質粒組合文庫培養板實驗步驟 ―、材料與設備1. 通過比較 β-半乳糖苷酶表達