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  • 發布時間:2019-11-05 13:50 原文鏈接: NatCommun:一種鑒別惡性腫瘤的新型診斷技術

      日前,一項刊登在國際雜志Nature Communications上的研究報告中,來自瑞典卡羅琳學院等機構的科學家們通過研究開發了一種新型廉價的方法來識別趨于惡性的高度異質性腫瘤,這類腫瘤或許需要進行積極性地治療和應對。

    圖片來源:CC0 Public Domain

      癌細胞的常見特性就是染色體或基因組中基因拷貝數的改變(CNAs,copy number alterations),在相同腫瘤中,屬于腫瘤不同構造部位的細胞攜帶著不同的CNAs,攜帶較多CNAs的腫瘤往往更具侵襲性,即使患者進行了嚴格的治療,這類腫瘤也會死灰復燃。這項研究中,研究人員開發了一種名為CUTseq的新型基因組手段,其能以比現有技術更低的成本對相同腫瘤不同部位中的CNAs的水平和類型進行評估分析。

      研究者Nicola Crosetto表示,我希望CUTseq技術能幫助尋找到癌癥診斷領域更多有用的方向或思路,目前多區域的腫瘤測序將會越來越多地應用于癌癥診斷上,從而識別出攜帶高度異質性腫瘤的患者,進而便于患者及時就診治療,本文中研究者所開發的新技術或能有效用于這一目的。

      該技術能對多個活組織中提取的DNA進行分析,甚至對組織切片中的微量成分進行分析,通過利用特殊的分子條形碼對相同腫瘤樣本的不同區域所提取的DNA進行標記,研究者就能在單一的測序實驗中對腫瘤CNAs的異質性進行全方位的分析和圖譜繪制;CUTseq技術的應用不僅限于癌癥診斷;比如,CUTseq技術還能用作細胞系鑒別的平臺,同時還能監測大型細胞系儲存庫和生物銀行中基因組的穩定性。

      最后研究者表示,如果該技術能應用于生態學研究領域,其或能代替其它基因組測序方法,比如RAD-seq,以較低的成本對生物多樣性進行有效評估。

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