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  • 發布時間:2020-09-07 11:58 原文鏈接: cDNA的篩選1

    (一)λgt11 cDNA文庫鋪平板
    宿主細菌制備
    1.用一個E.coli宿主菌株單菌落分別接種2×5ml LB培養基(Y1088用于噬菌斑雜交,Y1090用于免疫篩選),于37℃振蕩培養過夜。
    2.將過夜培養物以3000×g離心5min。
    3.分別用2ml λ-dil(10 mmol/L tris-Cl,pH7.5; 10 mmol /L MgSO4; 高壓滅菌)重懸細胞沉淀。
    4.細胞懸液可用于4℃貯存至一周。

    預制噬菌體懸液鋪平板
    以已知滴度(如,已知每ml噬菌體顆粒數)的cDNA文庫或其他噬菌體懸液開始,用λ-dil稀釋以達到所需每平板噬菌體數。每個90mm直徑平皿5×103個噬菌體/100μl開始篩選。

    鋪平板
    1.將所需數量的LB平板置 42℃溫箱預熱。
    2.LB頂層瓊脂(每平板最少2.5ml)用微波爐熔化,然后置49℃水浴中。
    3.為溫箱內的每一個平板準備一個 12ml帶螺旋蓋試管,于室溫,放在合適的架子上。
    4.用移液器每管加100μlλ-dil稀釋的宿主細胞懸液。
    5.每管加 100μl稀釋的噬菌體懸液與細菌于漩渦器上簡短混合。
    6.含細菌和噬菌體(感染混合物)的試管于37℃溫育25min,然后室溫放置。
    7. 用一支消毒的10ml 玻璃移液管在本生燈火焰上稍稍預熱,取2.5ml保存在49℃的熔化頂層瓊脂加到一支含感染混合物的試管內。
    8.立即在手掌之間滾動混合管內混合物,然后均勻地倒入一個預熱的LB平板上。
    9.倒好的平板于室溫置水平面上直至頂層瓊脂凝固(至少5min)。
    10. 重復步驟7至9,直至所有的細菌和噬菌體混合物都鋪平板。
    11. 平板置42℃溫箱(對λgt11)直至噬菌斑長出。

    (二)雜交篩選——cDNA序列作為探針

    4. 膜剝離:首先,用軟鉛筆在干的硝酸纖維素濾膜上給準備影印的平板編號。其次,從平板的中央開始向邊緣小心將濾膜鋪在菌臺上。當濾膜完全變濕后(顏色變灰),再等30s。同時,用針頭在平板上標出濾膜的3個不對稱位置。小心將濾膜從平板上剝離,接觸面向上放在一張干凈的Whatman 3MM濾紙上。在進行下一步驟之前,所有的平板重復步驟4。
    5.將濾膜接觸面向上漂浮在變性液(0.5 mol/L NaOH; 1.5 mol /L NaCl)中5min。
    6.中和5min。
    7.用2×SSC洗滌5min。
    8.將濾膜放在一張新的 Whatman 3MM濾紙上,用鉛箔將濾膜和濾紙一起包住。
    9.在真空爐中80℃烘烤2h。
    10. 用6×SSC預先短暫地濕潤濾膜,然后用預洗液(50 mmol/L Tris-Cl pH8.0; 1mol/L NaCl; 1mmol/L EDTA; 0.1% SDS)于 68℃預洗滌至少1h。用一個盤子放在水浴搖床上。
    11. 將25張濾膜轉移到一個裝有 50ml雜交液(5×SSPE;1×Denhardt’s液;100μg/ml cT-DNA;0.1%SDS)的貯存罐內(直徑至少90mm),68℃ 預雜交2h。
    12. 對于每ml雜交液,2倍的105至1×106cpm的雙鏈探針經沸水浴變性10min后,迅速放冰上冷卻。
    13. 變性探針立即加到預雜交混合液中。
    14. 在封口的貯存罐內于68℃雜交過夜,不斷地晃動以防濾膜粘在一起。
    15. 雜交結束后,濾膜用2×SSC,0.01%SDS于室溫洗滌3次約1h。
    16. 將潮濕(防止干燥)的硝酸纖維素濾膜放在一張硬紙或X光片上,用放射性墨水在針頭標簽上作標記。
    17. 濾膜用塑料包裝袋(如Saran)包住,然后加上增感屏在X光片上于-70℃曝光過夜。


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