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  • 發布時間:2019-03-28 11:16 原文鏈接: PCR產物的TA克隆

    TA克隆 系統可以用于快速地、一步到位地把PCR 產物直接插入到質粒載體的多克隆 位點(MCS)中。

    實驗方法原理

    PCR產物克隆大致分為兩類,即平頭連接和粘頭連接。


    平頭連接是將制備好的平頭載體和補平或削平的PCR 產物直接進行連接。載體可用EcoR V或Sma I切成平頭;PCR 產物純化后,可以在22℃用DNA聚合酶I作用30min(利用該酶所具有的3’→5’外切酶活性和5’→3’的聚合酶活性)。如果要求不高,PCR 產物也可不加處理。如果使用Stratagene公司的pfu DNA聚合酶或New England Biolabs公司的Vent DNA聚合酶,這兩種酶有5’→3’校對能力,擴增出來的PCR 產物已經是平頭,可以不作平端處理。平端連接的一個顯而易見的缺陷是連接效率低下,即使使用很高單位的連接酶,或在反應體系中加入PEG 8000,也只能很有限地提高效率。


    粘頭連接也可以大致分為兩類,一類粘頭連接是用某種方法,在載體和PCR 產物上產生長的可互補的粘性末端。最普遍的方法是在引物的5’端加入一段某種限制酶的識別序列。如果兩個引物選用不同的限制性內切酶識別序列,就可以做到定向連接。另一類利用部分PCR 產物3’端帶有一個凸出的dAMP的特性,構建3’端帶有凸出的dTMP的載體。一般采用的方法是先把載體用某種限制性內切酶消化成平頭,在70℃或72℃下在只加入一種dNTP、即dTTP的反應體系中用Taq DNA聚合酶處理半小時(也有人報道處理1~2小時能提高克隆 效率,這樣加T反應會更徹底)。也可以用末端轉移酶來完成加T反應。載體自連、PCR 產物串連可以忽略。如果使用ddTTP,效果會更好。這種方法一般稱為加T/A法克隆 ,比平頭連接效率高50~100倍。

    實驗材料

    PCR產物

    試劑、試劑盒

    T4 DNA連接酶ddH2O 

    儀器、耗材

    離心機水浴鍋

    實驗步驟

    1、連接反應一般在滅菌的0.5ml離心管中進行。


    2、10μl體積反應體系如下:


    (1)取T載體1μl (50ng),加入等摩爾數PCR 產物 。


    (2)加入含ATP的10×Buffer 1μl,T4 DNA連接酶合適單位,用ddH2O補足至10μl 。


    (3)稍加離心,通常為14-16℃水浴連接8-14hr,或4℃過夜。


    (4)轉染,藍白斑篩選同前。

    收起 
    注意事項

    1.要獲得目的基因的TA克隆 ,PCR 產物的特異性要好。


    2.PCR 產物在TA克隆 前要通過純化。


    3.在PCR 產物回收、純化過程中防止外來DNA污染。


    其他

    平端連接的一個顯而易見的缺陷是連接效率低下,即使使用很高單位的連接酶,或在反應體系中加入PEG 8000,也只能很有限地提高效率。


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