PerkinElmer高內涵系統的3D方案不僅僅局限于3D微組織，包括模式生物、細胞偽足等立體結構都可以通過高內涵系統完成全面的檢測和分析：
珀金埃爾默的單細胞ICP-MS技術，基于業界較快的的細胞脈沖信號讀取速度(可達100000點每秒)，能定量單個細胞中低至阿克級別的金屬和納米顆粒含量，測定細胞群中金屬質量分布和含金屬細胞的數量，從而評估與量化細胞群的異質程度。適用于人體、動物、植物等各種組織器官細胞的深入研究。
例如，含金屬藥物和納米顆粒越來越廣泛的應用于癌癥的治療和檢測，單細胞ICP-MS可進行精細跟蹤，掌握病變組織在細胞層面上對藥物的吸收和代謝，有助于了解癌癥機理和提升治療水平。
兩株卵巢癌細胞系A2780( 順鉑敏感型)和A2780/CP70 (順鉑耐藥型)隨時間變化順鉑攝入量
生物體中的銅含量通過非常有效而復雜的穩態機制得以嚴格調控，該機制可控制元素的吸收、分布和排出。目前數據得到的細胞銅穩態模型只是一個“骨架” ，用SC-ICP-MS來測量外周血單核細胞(PBMC)中的銅(Cu)含量，對了解穩態機制的失調或失衡可能導致生物體功能異常，并可能與某些疾病(例如炎癥、哮喘、衰老過程、癌癥等)方面提供了進一步研究的有效手段。
外周血單核細胞(PBMC)中銅的含量
應用領域舉例：
3D微組織類器官目前的應用主要集中在腫瘤研究(藥篩模型、藥篩、腫瘤免疫、個體化醫療)、干細胞和發育生物學、體外模型研究(感染模型、毒性評價)、材料及給藥研究等方面：
腫瘤研究
2019年6月17日，Cell
Death and Disease雜志在線發表了錢其軍研究組的研究成果Modified CAR T cells targeting
membrane proximal epitope of mesothelin enhances the antitumor function
against large solid tumor。該工作致力于優化腫瘤CAR T免疫療法。
MSLN(Mesothelin，間皮素)是嵌合抗原受體(CAR)T治療的誘人抗原，MSLN中的表位選擇至關重要。在這項研究中，作者使用修飾的piggyBac轉座子構建了兩種針對MSLN的I區(meso1 CAR，也稱為膜遠端區域)或MSLN的III區(meso3 CAR，也稱為膜近端區域)的兩種類型的CAR系統。其中，meso3 CAR T細胞在激活后表達更高水平的CD107α，并在體外針對表達多種MSLN的癌細胞產生更高水平的白介素2，TNF-α和IFN-γ。
之后，作者構建了胃癌和卵巢癌3D腫瘤細胞模型，并用該模型來測試這兩種CAR T系統，通過PerkinElmer Opera Phenix高內涵系統完成3D腫瘤 CART殺傷系統的成像和分析，終證明在3D細胞水平，meso3 CAR T細胞比meso1 CAR T細胞具有更高的殺傷作用。