UUU. 怎樣才能把膠跑的非常漂亮,泳道和band都能很直,是不是上樣的量很重要,罐膠有什么技巧嗎?想跑漂亮,是不是應該先小電壓,再高電壓,總體上電壓小些會跑的好些?還有前面有人說電泳液平玻璃板會使電泳條帶漂亮些?
解答:影響跑膠跑的質量,有以下幾個因素:1、電壓,小的電壓會使膠的分子篩效應得到充分發揮。電壓越小,條帶越漂亮,濃縮膠80v,分離膠100v就能跑得很好。2、膠的均勻度,膠越均勻,條帶越窄,分離越均勻。倒膠之前,一定要充分混勻,玻璃板一定要干凈,雙蒸水隔離時,一定要比較輕地加上去,避免稀釋上層的分離膠,使膠不均勻。
VVV. 為什么提高大分子量蛋白的轉移的時候,小分子量蛋白會丟失一些哪?什么原因?
解答:小分子的蛋白在轉移過程中,會透過膜去,所以大分子的上去以后,有一部分小分子的就透過去了。
WWW. 上次轉染了1.6*106細胞,收集,收集到了400微升體積,加6*loading buffer,
95度煮5分鐘,-20度,交替3次,離心,上樣,7%分離膠,先80v跑進分離膠,在100v電泳至溴酚蘭出膠,biorad半干轉PDVF膜,15v轉30分鐘,預染marker全部進膜,轉移后的膠考馬斯亮蘭染,可見殘留的蛋白帶,大分子量多些.blot時,封閉用5%奶粉TTBS
1小時,抗體稀釋液TTBS,一抗(1:10,單抗上清,2000年制備)1小時,二抗(1:2000)1小時,均在室溫.結果,50kd的小分子顯色,160kd大分子未顯色。
原因分析及準備改進:轉染大容量的質粒(融合蛋白的質粒)的效率會相對較低,大分子量表達也會相對較低,加上大分子量蛋白的轉移不完全,可能是我沒有拿到大分子量條帶結果的原因。另外背景稍微有一些臟(背景整體均勻一致),估計是二抗的濃度高了些,準備降至1:5000,另外抗體稀釋液準備改用5%奶粉TTBS,封閉改為室溫2小時。這個過程有沒有問題?
解答:首先分析你的整個實驗步驟。我發現了兩個比較大的毛病:
1、一抗用TBST稀釋。按照我的理解,一抗最好用5%的TBST脫脂牛奶稀釋,和你的封閉液相一致,這樣可以降低背景。
2、“biorad半干轉PDVF膜,15v轉30分鐘”,你是這么做的嗎?因為我大部分時間是做的恒流轉移,用的是0.1mA/膜,100kd--200kd轉2小時。到最后電壓會升到20v左右。你用恒壓法,我不是很肯定你轉30分鐘能將大分子(160kd)的抗原轉上去。我建議你最好能將時間延長,如果是恒流,可按我的做法;如果是恒壓,可摸索一下,適當延長時間。有時候你的marker也有可能欺騙你,因為marker的量比較大,是很容易轉上去的,實際上目標蛋白的量遠遠少于marker量。
我對你的結果分析如下:
1、你的結果很好,估計離目標不遠了,很快就可以成功。
2、 沒有160kd的帶是因為你的轉移時間過短,適當延長轉移時間(我懷疑這是主要的問題)。
3、你的一抗用1:10,2抗可以降到1:5000,背景會低一點。
10. 方法的介紹
XXX. 我想將hbx轉到hepg2 細胞里 通過檢測hbx蛋白的水平來 檢驗轉染的效率 不知道可不可行?
解答:Western Blot檢測HBX蛋白的表達來檢測轉染效率不是一個好辦法,建議還是:
1、最好是帶有熒光標簽的HBX轉染來看轉染效率,最可靠
2、其次,HBX和熒光載體共轉染,相對說明問題
3、熒光載體單獨轉染,主要是看細胞好不好轉了呵呵
轉染效率高低熒光顯微鏡下一目了然了。有的細胞熒光強,有的細胞熒光弱,有的沒有。所以HBX表達強很可能是少數細胞熒光強的結果,不代表轉染效率。
YYY. 半干法轉移與膠的面積和蛋白分子兩大小好像都有關系,那么濕法轉移是不是所有的轉移條件都一樣呢?一般的條件是怎樣的?
解答:半干轉的電流大小是按照面積來算的,時間是根據蛋白分子大小定的;而濕轉的話電流是恒定的,時間也是根據分子量而定。
ZZZ. 轉膜時何為濕法,何為半干法?
解答:半干法和濕法轉移是兩種不同的轉移裝置下的轉移系統,將膜,膠,濾紙整個浸泡在buffer的Tank里轉移的,叫濕法;用濾紙吸buffer來做轉移體系的叫半干法。
AAAA. 為什么濃縮膠和分離膠的電壓不一致?同樣的電壓可以嗎?
解答:濃縮膠的目的使得loading 的樣品能夠在同一條水平線上進入分離膠
,如果電壓太大前端的蛋白容易在后面的蛋白趕上來前進入分離膠。而在分離是理論上(實際上也是)小電壓長時間分離的效果會更好,但是在操作過程中沒有必要等那么長的時間,所以就用大電壓快點跑。
BBBB. 如果目的蛋白比較小,21和38kd,轉膜時(Biorad的濕轉儀)時間是否能縮短些?100伏電壓,甲醇的量是否也可以相應增加?
解答:如果是小蛋白可以用小電壓28V-36V,4-6hours,(4度)。甲醇10%-20%就可以了。