1.原發感染癥狀：耳源性小腦膿腫常伴有慢性中耳炎和乳突炎，特別是耳部長期流膿突然停止而出現小腦癥狀。血源性小腦膿腫常伴有胸腔感染性疾患、腹部或盆腔炎癥、細菌性心內膜炎、皮膚感染、骨髓炎等癥狀。外傷性小腦膿腫常伴有中顱凹及后顱凹骨折、傷口感染等。
2.全身感染癥狀：急性感染期病人可出現發冷發熱、惡心嘔吐和頭痛，白細胞計數有輕度或中度增高，血沉增快。此類癥狀一般在數日或兩三周內消失。膿腫進入限局階段，臨床上可出現一個潛伏期，此期可延續數周甚至數月，潛伏期內病人仍有頭痛、消瘦、疲乏。有些病人潛狀期長，癥狀較少或無癥狀，直到出現嚴重的顱內壓增高病灶癥狀時才確診。
3.顱內壓增高癥狀：表現為頭痛、嘔吐、視乳頭水腫，出現早期意識遲鈍或昏迷，外展神經麻痹等。
4.病灶癥狀：急性小腦膿腫周圍腦組織的炎癥和水腫都較嚴重，病灶癥狀也較明顯并出現較早。慢性小腦膿腫包膜形成良好，周圍腦組織的炎癥和水腫較輕，病灶癥狀亦較輕。急性小腦膿腫多合并硬腦膜外膿腫，慢性小腦膿腫常合并迷路炎，出現小腦病灶體征，如眼球震顫、步態蹣跚、共濟運動失調、肌張力減退、腱反射減弱和強迫頭位，晚期可出現后組顱神經癥狀和腦干癥狀。一旦發生枕骨大孔疝，病人可突然呼吸停止而死亡。
5.腦膜刺激癥狀：小腦膿腫病人因炎癥刺激脊神經根，常出現腦膜刺激征和頸項強直。