華人學者全面解讀癌癥中的ceRNA

　　過去幾年人們逐漸發現，競爭性內源RNA（ceRNA）是一類重要的轉錄后調控子。這些RNA通過miRNA介導的機制改變基因表達，進而影響細胞的功能。

　　德州大學MD安德森癌癥中心的研究人員最近在Cell旗下的Trends in Genetics雜志上發表文章，全面介紹了癌癥ceRNA研究的新進展，探討了這類分子發揮的功能和機制。文章通訊作者是德州大學MD安德森癌癥中心的Yiwen Chen博士。Chen博士早年畢業于復旦大學，后來在北卡羅來納大學取得博士學位。

　　包括癌癥在內的復雜疾病往往與轉錄水平和非轉錄水平的異常基因表達有關。最近的實體瘤和血液系統惡性腫瘤研究顯示，ceRNA在癌癥發病機理中起到了重要的作用，影響了關鍵致癌基因或抑癌基因的表達。這意味著ceRNA可以成為癌癥治療的潛在靶標。

　　文章指出，將計算機分析與生物學實驗結合起來有助于鑒定癌癥相關的ceRNA，探索它們的功能和機制。這樣的研究能增進我們對癌癥發病機制的理解，還有助于開發以RNA為基礎的新癌癥治療策略。

　　假基因（Pseudogenes）一直被視為基因組的“垃圾”。貝斯以色列女執事醫療中心（BIDMC）的研究人員發現，假基因BRAF起到了ceRNA的作用，會誘導一種侵襲性的淋巴瘤樣疾病。這一研究表明假基因有可能在各種疾病中發揮了重要的作用。（更多詳細信息參見：癌癥研究大師Cell驚人發現：致癌的假基因）

　　寧波大學醫學院的研究人員對胃癌中與長鏈非編碼RNA（lncRNAs）有關的競爭性內源RNA展開了調查，并將研究結果發布在《Scientific Reports》雜志上。他們基于胃癌lncRNA微陣列數據、生物信息學算法miRcode以及miRNA靶標數據庫TarBase，首次構建出了一個lncRNA-miRNA-mRNA網絡。隨后，利用頭頸部鱗癌、前列腺癌、甲狀腺乳頭狀癌、垂體促性腺激素腫瘤、卵巢癌、慢性淋巴細胞白血病6種癌癥類型的數據對這一網絡進行了驗證。研究結果顯示出了一個明確的癌相關ceRNA網絡。

　　非編碼RNA主要包括長非編碼RNA（lncRNA）和microRNAs（miRNA），它們可以調節轉錄因子的表達、指導染色質的重組和修飾、減少mRNA的翻譯對基因表達進行控制。非編碼RNA對維持細胞內穩態非常關鍵，在疾病特別是癌癥中起到了重要的作用。Science Signaling雜志通過專題“Noncoding RNAs in cancer”，介紹了這類分子的生理和病理學功能。