2019年3月13日,美國希望之城貝克曼研究所陳建軍,芝加哥大學何川,中山大學楊建華及辛辛那提兒童醫院黃剛共同通訊在Nature在線發表題為“Histone H3 trimethylation at lysine 36 guides m6A RNA modification co-transcriptionally”的研究論文,該研究揭示了Lys36(H3K36me3)的組蛋白H3三甲基化【轉錄延伸的標記】,指導m6A的沉積過程。
有趣的是,該研究顯示m6A修飾在H3K36me3峰附近富集,并且當細胞H3K36me3耗盡時,m6A在整體上減少。在機制上上,H3K36me3被METTL14直接識別和結合,METTL14是m6A甲基轉移酶復合物(MTC)的關鍵組分,后者又促進m6A MTC與鄰近RNA聚合酶II的結合,從而將m6A MTC遞送至活躍轉錄的新生RNA。在小鼠胚胎干細胞中,H3K36me3耗盡也顯著降低m6A轉錄豐度組范圍,導致細胞干活性增加。
總之,該研究揭示了H3K36me3和METTL14在確定mRNA中m6A的特異性和動態沉積中的重要作用,并揭示了涉及組蛋白修飾和RNA甲基化之間交流的另一層基因表達調控。
轉錄組范圍的m6A作圖揭示了人和小鼠轉錄組中大約7,000個mRNA中m6A修飾的存在,并揭示了共有基序RRACH(其中R表示G或A; H表示A,C或U),其中A被轉化為m6A。 盡管METTL3-METTL14甲基轉移酶復合物在體外識別了RRACH基序,但這些基序中只有一部分在體內被甲基化,這種修飾通常發生在編碼序列(CDS)和3'-非翻譯區(UTR)。 如何選擇單個轉錄物和特定位點以正確沉積m6A修飾仍不清楚。
H3K36me3組蛋白修飾影響從頭m6A RNA甲基化
該研究報告Lys36(H3K36me3)的組蛋白H3三甲基化【轉錄延伸的標記】,指導m6A的沉積過程。有趣的是,該研究顯示m6A修飾在H3K36me3峰附近富集,并且當細胞H3K36me3耗盡時,m6A在整體上減少。
H3K36me3和MTC在m6A調節中的轉錄組互作
在機制上上,H3K36me3被METTL14直接識別和結合,METTL14是m6A甲基轉移酶復合物(MTC)的關鍵組分,后者又促進m6A MTC與鄰近RNA聚合酶II的結合,從而將m6A MTC遞送至活躍轉錄的新生RNA。在小鼠胚胎干細胞中,H3K36me3耗盡也顯著降低m6A轉錄豐度組范圍,導致細胞干活性增加。
H3K36me3被METTL14識別并指導共轉錄的m6A修飾
總之,該研究揭示了H3K36me3和METTL14在確定mRNA中m6A的特異性和動態沉積中的重要作用,并揭示了涉及組蛋白修飾和RNA甲基化之間交流的另一層基因表達調控。
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https://www.nature.com/articles/s41586-019-1016-7
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