掌握一種聚丙烯酰胺凝膠電泳分離蛋白質的方法,并用此法進一步分析血清蛋白的組成。
1、聚丙烯酰胺凝膠
聚丙烯酰胺是由丙烯酰胺(Acr)、NN′-甲叉雙丙烯酰胺(Bis),在催化劑過硫酸銨[ammonium persulfate (NH4)2S2O8 簡稱AP)或核黃素(ribofavin 即vitaminB2,C17H20O6N4)和加速劑N,N, N′,N′-四甲基乙二胺(N,N,N′,N′-ytetramethyl ethyenediamine,簡稱TEMEM)的作用下,聚合而成的三維網狀結構。
a.目前常用的催化體系:
(1) Ap—TEMED:
① TEMED催化Ap生成硫酸自由基:
S2O82-→2SO4-
(過硫酸) (硫酸自由基)
②硫酸自由基的氧原子激活Acr單體,并形成單體長鏈:
③Bis將單體長鏈間連成網狀結構:
從反應式中可看出此凝膠是三維網狀的,帶不活潑的酰胺基側鏈的聚合物,沒有或很少帶有離子側鏈,因而凝膠性能穩定,無電滲作用。在堿性條件下,凝膠易聚合,其聚合的速度與Ap濃度平方根成正比。雜質、某些金屬離子,低溫和氧分子能延長或阻止碳鏈的延長與聚合作用。用此法聚合的凝膠孔徑較小,常用于制備分離膠。
(1) 核黃素-TEMED:
這是光聚合作用。TEMED可加速凝膠的聚合,但不加也可聚合,光聚合作用通常需要痕量氧原子存在才能發生,核黃素在TEMED及光照條件下,還原成無色核黃素,后者被氧再氧化形成自由基,從而引發聚合作用。但過量氧會阻止鏈長的增加,因此應避免過量氧的存在。
b.凝膠的性質
(1) 機械性能與孔徑
T=(a+b)/m×100% T:凝膠總濃度,a:Acr克數,b:Bis克數,m:緩沖液體積(ml)。
C=b/(a+b)×100% C:交聯度
a/b(w/w)與凝膠的機械性密切相關。當a/b<10時凝膠脆而易碎,堅硬呈乳白色;a/b>100時,即使5%的凝膠也呈糊狀,易斷裂。預制備完全透明而又有彈性的凝膠應控制a/b=30左右。不同濃度的單體對凝膠性能影響很大,B.J.Davis的實驗發現Acr<2%,Bis<0.5%,凝膠就不能聚合,當增加Acr濃度時要適當降低Bis的濃度,通常T為2%~5%時,a/b=20左右;T為5%~10%時,a/b=40左右。T為15%~20%時,a/b=125~200左右。在研究核酸大分子時,常用T=2.4%大孔凝膠,此時凝膠太軟不易操作,最好加入0.5%瓊脂糖,有的在3%凝膠中加入20%蔗糖,也可增加其機械強度而不影響其孔徑的大小。一般來說,T濃度大,孔徑小,移動顆粒穿過網孔阻力大;T濃度小,孔徑大,移動顆粒穿過網孔阻力小。
(2)分子量范圍與凝膠濃度關系如下表1-2-9
2、電泳原理
(1)濃縮效應
①凝膠孔徑不連續;樣品膠T=2.5%為大孔膠,分離膠T=7.5%為小孔膠。在電場的作用下,蛋白質顆粒在大孔膠中遇到的阻力小,移動速度快,當進入小孔膠時,蛋白質顆粒泳動受到的阻力大,移動速度減慢,所以在兩層凝膠交界處,由于凝膠孔徑的不連續性,使樣品遷移受阻而壓縮成很窄的區帶。
表1-2-9 分子量范圍與凝膠濃度的關系
②緩沖體系離子成分及pH值的不連續性(電位梯度不連續性)樣品膠和濃縮膠為pH6.7的Tris-HCl,緩沖液,電極緩沖液為pH8.3的Tris-Gly。HCl在任何pH溶液中均易解離出Cl-,而Gly的pI為5.97,所以Gly在樣品膠和濃縮膠中解離度很小,僅有1%~0.1%。而有效遷移率=mα(m為遷移率,α為解離度),所以Cl-的有效遷移率最快成為快離子,而Gly的有效遷移率最慢成為慢離子,在樣品膠和濃縮膠中所選用的pH值必須使有效遷移率滿足下述條件:
快離子>樣品離子>慢離子。因此在快離子后邊形成一個離子濃度低的區域,即:低電導區,又因為E=I/η(E:電位梯度,η:電導率,I:電流)。低電導率將產生一個高電位梯度,因而在高電壓梯度區和低電壓梯度區之間,形成一個迅速移動的界面(如圖1-2-11)。由于樣品的有效遷移率恰好介于快慢離子之間,所以就聚集在這個移動的界面附近,被濃縮成一狹小的樣品薄膜。
圖1-2-11不連續電泳濃縮效應示意圖
(2)分子篩效應:進入分離膠后,分離膠為pH為8.9的Tris-HCl
緩沖液Gly解離度增大,因而它的有效遷移率也增加,此時Gly很快就趕上并超過樣品分子,這樣高電壓梯度就不存在了,使樣品進入一個均一的電位梯度和pH條件的分離膠中。分離膠的孔徑較小,分子量或形狀不同的樣品通過分離膠,所受的摩擦力不同,受阻滯的程度不同,因此表現出不同的遷移率。
(3)電荷效應:進入分離膠后,樣品除了具有分子篩效應外還根據帶電荷不同,遷移率不同進行分離。
[試劑與器材]
試劑:
1、按下表配制貯液和工作液
2、0.1%溴酚藍指示劑
3、染色液 用7%醋酸液配制成1%氨基黑10B染色液。
4、脫色液 7%醋酸溶液
材料:
人、魚等動物血清。
器材:
常壓電泳儀;圓盤電泳槽;玻璃管(內徑約0.5cm~0.7cm,長度約8 cm~10cm);有機玻璃架(或自制木頭架);微量進樣(100μl)器;5ml注射器;長、短注射針頭;長、短頸滴管;日光燈或100w白熾燈;乳膠管;玻璃球(或小段玻璃棒);培養皿;燒杯;洗耳球。
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