脂質組學技術
相比其他組學技術,脂質組學技術發展較晚,新穎性高,僅僅只是純數據分析也可以發表在不錯的期刊上。如果希望研究得更高深入,可以往下游脂質功能或者往上游的蛋白或基因出發研究脂代謝調控機制。
DIA技術新一代、革命性的蛋白質組技術DIA,相比傳統的蛋白質組技術(shotgun,Label free、iTRAQ或TMT等)以及4D 蛋白質組學,具有覆蓋度高、重現性高、定量準確性高(可以達到與MRM/PRM相近的水平)等優勢,被美國癌癥登月計劃、瑞士蘇黎世癌癥地圖計劃、澳大利亞ProCan項目等國家級精準醫療項目采用,并且在出現在越來越多的高水平研究中。
脂質組+ DIA強強聯合,會擦出什么樣的火花呢。今天跟小編一起來看一篇最新發表在Biological Psychiatry IF= 11.982的文章吧!這篇文章利用脂質組+DIA揭示了精神病經歷患者的早期脂代謝特征及與相關蛋白的相互作用關系。
Integrated Lipidomics and Proteomics Point to Early Blood-Based Changes in Childhood Preceding Later Development of Psychotic Experiences: Evidence From the Avon Longitudinal Study of Parents and Children
2019 Biological Psychiatry IF= 11.982
研究材料:115名參與者12歲時的血漿樣本
技術:脂質組+蛋白DIA
精神疾病(包括精神疾病和情感疾病)的早期診斷和治療可以顯著改善他們的臨床結果。過去15年的研究表明,一般人群中8%到17%的兒童和青少年、7%的成年人有精神病經歷,其中早期存在亞臨床癥狀的個體有更高患精神病或其他疾病的風險。對精神疾病的生物特征識別有助于這些疾病的病理生理學研究,以及篩選具有早期檢測和診斷潛力的生物標志物。
1.>>>研究隊列<<<
通過多年的隨訪,本次研究選擇了115名參與者,其中實驗組PEs 48名(12歲時無精神病經歷,而在18歲時有確切的精神病經歷),對照組Control 67名(12歲時無精神病經歷,而在18歲時有有確切的精神病經歷)。兩組在性別、BMI以及社會地位上無明顯差異。與對照組相比,PEs組有9例達到抑郁標準,正常對照組無一例。
2.>>>脂質組學分析結果<<<
對115名參與者12歲時的血漿樣本進行脂質組學分析,一共檢測到61種PC脂質分子和11種LPC脂質分子。通過單變量統計分析,一共篩選到34種脂質分子。FDR校正后,16種脂質分子仍然在PEs組含量上調。比較有趣的是,單變量分析與多變量分析的結果具有一致性。
3.>>>蛋白組分析結果<<<
前期的研究結果表明精神障礙癥患者兒童時期凝血途徑異常,因此此次研究對115名參與者12歲時的血漿樣本,采用DIA技術檢測凝血途徑中的22個蛋白。通過單變量統計分析,一共篩選到3種凝血蛋白。FDR校正后,只有1種蛋白(PLG)仍然在PEs組含量上調。
4.>>>脂質組+蛋白組<<<
凝血和補體途徑蛋白在功能上密切相關。由于這個原因,作者將能夠獲取的補體途徑中的蛋白也納入了聯合分析。相關性分析結果表明17種脂質分子與6種蛋白正相關,其中凝血途徑的PLG,heparin cofactor 2以及補體途徑中的vitronectin具有很強的相關性。