微量的DNA往往以潛在的形式存在于案件現場的物證中，比如，衣物、磚塊等，雖然針對微量DNA物證的DNA檢驗成功率較低，但是，一旦成功獲得分型，就能夠成為破案的直接證據，因此，對于潛在的DNA物證，檢材的提取是DNA檢驗成功與否的關鍵。
DNA物證的提取和其他物證的提取有所不同，為了便于下一步的DNA的提取和純化，一般都需要將檢材進行轉移。檢材DNA的提取大致分為兩種：
1直接剪取
2其他提取工具
直接剪取
對于微量DNA物證的提取來說，直接剪取應該是最佳的提取方式，避免轉移過程中DNA的損失，但需要對檢材進行仔細分析，突出重點部位，可借助多波段光源及血痕發現儀尋找DNA附著的位置，定點提取，從而提高DNA的提取成功率。
其他提工具
對于不可剪取的檢材，我們需要進行提取方法的優化，以最大程度的提高DNA的提取效率，避免DNA損失造成的檢測失敗。
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擦拭法
目前常用的擦拭提取方法是兩步法，即先用浸濕的棉簽反復擦拭后，再用干棉簽擦拭至表面載體干燥，然后將兩個棉簽用于DNA的提取。部分客戶用Copan植絨拭子替代常規的棉簽，由于植絨拭子采用的是尼龍纖維填充技術，將尼龍纖維垂直于基底植于載體上，可以最大限度的提高DNA采集和洗脫效率，配合專用的提籃，經實驗室驗證對核酸提取效率可提高60%，特別適合微量DNA物證的提取。
2
真空吸附法
真空吸附法分為干、濕兩種，干式吸附法是直接吸取檢材表面的DNA物證，收集起來用于DNA的檢測；濕式吸附法的原理是在一定壓力下先將無菌的清洗液噴灑在檢材表面，再利用真空吸附的作用，將攜帶DNA物證的液體收集，并將液體和DNA物證分開，獲得檢材中潛在的DNA物證。由于濕式吸附利用了液體的穿透和溶解作用，DNA的提取效率要由于干式吸附法，尤其對于多孔、紡織品類檢材提取效果更佳。
超微量DNA物證提取儀
適用于常規方法提取失敗的檢材
特別適用于多孔類的檢材，比如衣物、磚塊等
可實現大面積檢材一次提取
提取效率可達常規方法的數倍至數十倍。
微量DNA檢驗的影響因素很多，稍有不慎會導致檢驗結果不理想。因此，要提高微量DNA檢驗的成功率，不僅需要在檢材的科學提取上下功夫，還需要及時送檢、選擇合適的檢驗策略與方案等各個方面努力。