注重實踐經驗！Urimarker2020線上會前培訓率先登場

發布時間：2020-05-15 15:30 原文鏈接：注重實踐經驗！Urimarker2020線上會前培訓率先登場

　　分析測試百科網訊 2020年5月15日-17日，第二屆尿液生物標志物網絡研討會（Urimarker 2020）線上直播召開。Urimarker 2020由北京師范大學與分析測試百科網聯合主辦，基因工程藥物及生物技術北京市重點實驗室、中國醫學科學院基礎醫學研究所協辦，北京師范大學生命科學學院承辦。

　　會議邀請對臨床生物標志物研究有興趣的臨床醫師、檢驗科醫生、科研院所和高校研究人員，蛋白質組/代謝組 /microRNA 等組學分析領域的專家，生物樣本庫專家，臨床大數據專家，科學出版領域和風險投資領域的專家，共同討論尿液生物標志物研究的進展和臨床應用前景，促進各個領域專家的合作，建立一個平等、自由、高效的學術交流與合作的平臺，展示各領域的研究成果、研究能力和合作意愿，探索新的契機，推進尿液生物標志物研究各領域深入發展和成果的臨床轉化

　　15日率先召開Urimarker 2020會前技術培訓，針對尿液相關研究和應用中所涉及到的問題，相關團隊介紹了其研究經驗，包括樣品尿液收集、貯存、質譜分析、數據分析等。

　　青島市市立醫院秦偉偉帶來題為《尿液樣品收集和貯存》的精彩報告。

　　報告首先介紹了利用膜（硝酸纖維素膜/尼龍膜）吸附尿液中生物成分（蛋白質/RNA），干燥后存儲在真空袋中。該方法實現了尿液的室溫保存，解決了尿液樣本貯存和運輸的問題。

　　對于從嬰幼兒采集尿液困難的問題，報告介紹了一種利用紙尿片收集尿蛋白的方法。用絨毛尿作為吸收體收集尿液，將尿蛋白洗脫并吸附在膜上，將蛋白結合膜干燥后存放在真空袋中，可室溫保存。

　　為實現在居家環境中對尿液的收集和保存，報告介紹了一種濾器聯合注射器的家用套裝：包含一個可換膜濾器和一個注射器等。注射器提供壓力，使尿液依次通過濾器中的隔離膜和吸附膜，將蛋白結合膜干燥并保存在真空袋中，可室溫保存7-10天。

　　報告還介紹了一種干燥法的保存淚液的方式：Schirmers試紙條收集淚液，干燥后儲存在真空袋中，可室溫保存2周。

　　中國醫學科學院基礎醫學研究所湯曉悅帶來題為《尿液樣本制備》的報告。

　　完整的尿液蛋白質組學分析流程包括樣本的收集與保存，尿液樣本的前處理，液質分析和數據處理幾個環節。

　　報告共介紹了7種尿液樣本的前處理方法: In-solution、FASP、96 FASP/q96 FASP、Mstern Blotting、Strap、iST、C4 tip。分別對每種方法的工作流程，處理時間，通量，方法優缺點及相應的應用分析進行了介紹。最后報告對In-solution、S-trap、iST和Mstern Blotting4種方法進行了比較分析。

　　中國醫學科學院基礎醫學研究所郭正光帶來題為《質譜采集方法和優化》的報告。

　　質譜儀是高通量蛋白質組分析的有力工具。報告介紹了蛋白質組學各種定量分析策略。首先介紹了發現蛋白質組學的定量技術，如TMT/iTRAQ技術、Label-free，DIA等。

　　標記定量技術的優點有方法簡單、易操作；蛋白通量高,覆蓋度高；MS2定量,準確性好；樣本混合上樣,平行性好；實驗室內、實驗室間重現性好。缺點有每次分析個數有限；標記試劑成本高；信號壓縮等。

　　Label-free技術的優點包括無需標記,操作簡單,成本低；通量高；無樣本數限制。然而Label-free技術需要保證很好的色譜重現性。

　　最新的數據非依賴采集DIA技術，該技術結合DDA和SRM技術的優點，不丟失任何信息，數據可回溯。接下來報告介紹了靶向蛋白質組學的定量技術，包括PRM和MRM技術的原理和主要的技術策略。

　　報告還簡介了各種定量蛋白質組學的方法在尿液蛋白質組學研究中的應用案例。

　　上海易算生物科技有限公司沈誠頻帶來題為《基于iomicsCloud的在線分析流程》的精彩報告。

　　Omics Cloud平臺整合了組學數據分析中所有常用的統計分析工具以及高級功能分析工具，如．主成分分析（PCA）、偏最小二乘法判別分析（PLS-DA）、基于正交信號校正的偏最小二乘判別分析（OPLS-DA）、層聚類分析（HCA）、 MFUZZ分析、假設檢驗、 P值校正、 STRING蛋白互作網路圖繪制、 GO和KEGG富集分析等，真正做到蛋白組和代謝組的 ”一站式” 數據分析。

　　Omics Cloud的所有工具中都預設了推薦的統計／功能分析參數，用戶可以使用默認的參數進行分析，快速查看數據質量等信息，也可逐一調節參數，進行自定義分析．而用戶對參數所作的一切調整都會在右邊的分析結果呈現界面實時展現，在某些分析中您甚至可以一邊拖動參數條，一邊查看圖表的變化，找出最滿意的參數。

　　中國醫學科學院基礎醫學研究所楊嘯林帶來題為《FAIR準則與生物醫學數據建設標準》的精彩報告。

　　報告介紹了數據庫構建的FAIR準則、生物醫學數據標準和生物醫學本體應用。FAIR準則為可發現、可訪問、可重用、可互操作這四項。生物醫學數據標準涉及格式標準、最小信息標準、術語標準等。

　　報告還介紹了生物醫學本體及其應用，如：OBO Foundry及其本體資源、基因本體GO、GO注釋、GO富集分析、人類表型本體、疾病與表型的本體及FAIRsharing、Ontoportal Alliance等相關數據平臺。