(三) DNA連接酶的反應條件
影響連接效率的因素有:
1. 溫度(通常在4-15℃ )
2. ATP的濃度(10μM/L - 1mM/L )
3. 連接酶濃度(一般平末端大約需1~2U,黏性末端僅需0.1U)
4. 反應時間(通常連接過夜)
5. 插入片段和載體片段的摩爾比( 1∶1~5∶1)
(四)T4 DNA連接酶對目的DNA片段和載體連接的一般方案
1.連接反應一般在滅菌的0.5ml離心管中進行。
2.10μl體積反應體系中:取載體50-100ng,加入一定比例的外源DNA 分子(一般線性載體DNA分子與外源DNA分子摩爾數為1∶1~5∶1),補足ddH2O 至8μl。
3.輕輕混勻,稍加離心,56℃水浴5min后,迅速轉入冰浴。
4.加入含ATP的10×Buffer 1μl,T4 DNA連接酶合適單位, 用ddH2O 補至10μl,稍加離心,在適當溫度(一般14-16℃)連接8-14hr。
三、DNA聚合酶及其應用
(一)大腸桿菌DNA聚合酶I
是Kornberg A. 1956年首先從大腸桿菌E。Coli 細胞中分離出來的。它是一種多功能性的酶,包括 3種不同的酶活力:
5′→ 3′聚合酶活性(模板, 帶3′-OH游離基團的引物、4dNTPs、 Mg2+ )。
雙鏈特異性的5'→3'核酸外切酶活性。
3'→5'核酸外切酶活性。
從游離的雙鏈或單鏈DNA的3′端降解。不過對于雙鏈的降解可被5′-3′的多聚活性所抑制。主要是校正作用。
大腸桿菌DNA聚合酶I 的三種用途
1.利用缺口轉移法制備高比活度的DNA探針
利用其5′--3′的外切酶活性及其聚合酶活性。
2.用于DNA連接前的大缺口填充
利用5′--3′的聚合酶活性。
3.用于DNA的序列分析
利用5′--3′的聚合酶活性。
(二)Klenow片段酶
Klenow片段是大腸桿菌聚合酶 I 全酶經枯草桿菌蛋白酶處理后產生的大片段酶分子,分子量為76KD 。
酶催活性:⑴5’ →3’ 的聚合酶活性
⑵3’ →5’ 的核酸外切酶活性
Klenow片段的主要用途(利用5’ →3’ 的聚合酶活性):
⑴修補限制性酶消化DNA形成的3′隱蔽末端
⑵標記DNA片段的末端
底物用[α-32P]-dNTPs
⑶cDNA克隆中第二鏈cDNA的合成
⑷DNA序列的測定