CASMS分論壇：Topdown蛋白質組學和原位質譜新進展

　　分析測試百科網訊 美國東部時間2021年8月9日-13日，首屆美國華人質譜學會（CASMS）學術研討會暨展覽會在Gather.Town隆重舉行。在12日“New Advances in Top-down Proteomics and Native Mass Spectrometry”分論壇中，加州大學-洛杉磯分校Joseph A. Loo博士、俄克拉何馬大學Si Wu博士、杜蘭大學Xiaowen Liu博士、中山大學Huilin Li博士、密歇根州立大學蘭辛分校Liangliang Sun博士、威斯康星大學麥迪遜分校Ying Ge博士帶來精彩報告。分析測試百科網作為大會支持媒體，為您帶來全程跟蹤報道。

　　報告人：加州大學-洛杉磯分校Joseph A. Loo博士

　　報告題目：Towards Illuminating the Dark Matter of Mass Spectrometry for a Top-Down View of Native Protein Structures

　　原位描述電離事件之前溶液中分析細胞的生物學狀態，蛋白質相互作用可以保留下來用于MSM測量，提供配體結合特性（化學計量比、結合親和力）。

　　為了從上到下了解天然蛋白質的結構，Joseph A. Loo博士正在努力照亮質譜中的暗物質。報告介紹了結合Top-down 質譜 和原位質譜中多種有效的解離方法，經過磷酸化位點的ECD-MS/MS鑒定，發現ECD-MS/MS法定位配體結合位點，配體間的相互作用對電收縮/轉移離解是穩定的，且配體結合位置一致。報告指出暗物質占宇宙物質的85%，是ca的主要來源，很難被探測到。串聯質譜中的暗物質=未分配峰值，包括內部碎片離子。

　　報告人：俄克拉何馬大學Si Wu博士

　　報告題目：High-throughput Quantitative Top-Down Proteomics

　　Top-down蛋白質組學可以更好地定性和定量描述完整的蛋白質組。高通量定量Top-down蛋白質組學目前的挑戰表現在一個樣本中有數十萬種蛋白質，可用樣品的有限尺寸（單電池TDP），疾病標志物的可靠定量表征。RPLC分離為復雜蛋白質樣品提供高分離分辨率

　　報告介紹了二維RP/RPLC在線自動分離，第一個在線2D RPLC自上而下蛋白質組學在復雜生物樣品上，如細胞裂解物。結果得到了良好的分離峰容量，在線2D提供與離線2D相當的結果，樣本量減少100倍。

　　報告人：杜蘭大學Xiaowen Liu博士

　　報告題目：EnvCNN: A Convolutional Neural Network Model for Evaluating Isotopic Envelopes in Top-Down Mass-spectral Deconvolution

　　報告介紹了Top-down質譜反褶積中用于同位素包絡評估的ENVCNN、模型訓練和測試以及與Ms-deconv評分函數的比較。

　　通過結合ENVCNN和數據庫搜索，實現光譜數據應用：具有Ms deconv分數的TOPFD，TOPFD與ENVCNN。利用TOPPICT檢索蛋白質組數據庫，Tese可以增加蛋白質組鑒定。

　　報告指出評價同位素包絡的CNN模型，ENVCNN優于Ms deconv評分函數，且使用ENVCN比Ms deconv分數進行更多光譜識別。

　　報告人：中山大學Huilin Li博士

　　報告題目：Understanding the Structural Basis of Allosteric Regulations of Glycogen Phosphorylase Complex Using Integrative Structural Mass Spectrometry

　　自然界中包含了許多用于控制細胞過程的通用策略，研究需要理解變構規則的方法。蛋白質結構中很難看到變構信號機制，這強調了需要開發方法來回答這些問題。

　　報告介紹了MS在結構生物學中的多樣性和擴展性作用，磷酸化誘導的GP變構調節等。

　　報告人：密歇根州立大學蘭辛分校Liangliang Sun博士

　　報告題目：Capillary Isoelectric Focusing-Mass Spectrometry for Denaturing and Native Top-Down Proteomics

　　毛細管等電聚焦（cIEF）具有功能超高分辨率蛋白質分離（Apl:0.001）、同時濃縮和分離分析物、高樣本裝載能力（UL）、蛋白質組的精確pl信息。

　　報告介紹了完整蛋白質的cLEF-MS分析、電動泵鞘層流CE-MS接口、大腸桿菌TDP的自動cLEF-MS/MS分析、斑馬魚雄性和雌性大腦的定量TDP等。

　　報告指出cLEF MS是表征單克隆抗體電荷變體的有力工具，高分辨率分離、自動化操作比傳統使用的cLEF UV更好地識別電荷變體。未來需要進一步提高穩定性和分離分辨率。

　　報告人：威斯康星大學麥迪遜分校Ying Ge博士

　　報告題目：New Strategies in Top-Down Proteomics for Precision Medicine

　　組學技術是精確醫學的促成力量，用高分辨率Top-down質譜揭示蛋白質組的復雜性，在翻譯后修飾（PTM）中具有優勢。報告介紹了一種用于Top-down蛋白質組學的光解表面活性劑（Azo），Azo作為Top-down和Bottom-up蛋白質組學的一體式Ms兼容表面活性劑。報告還介紹了偶氮激活的細胞外基質（ECM）蛋白質組學、完整單克隆抗體的在線HIC-MS/MS分析、完整單克隆抗體的在線ECD-FTICR-MS/MS表征等。

　　實驗表明納米蛋白質組學使精確醫學的全面分析成為可能。

　　關于New Advances in Top-down Proteomics and Native Mass Spectrometry的演講人介紹，請見：http://www.casms.org/?action=content&id=54