全基因組測序提高罕見病診斷率

每4300人中就有1人患有線粒體疾病，并會導致進行性的不治之癥。這種疾病是最常見的遺傳疾病之一，但對臨床醫生來說很難診斷，這是因為它們可以影響許多不同的器官，并與許多其他疾病相似。而其中40%的患者未能被目前的基因檢測制度診斷。

近日，英國研究人員的一項新研究為尚不能被確診的患者帶來了希望。該研究發現，單次血液檢測的全基因組測序檢測出的罕見遺傳疾病病例比標準檢測多31%，并支持英國建立一個基于全基因組測序的國家診斷計劃，以更快地診斷更多疾病。相關研究結果發表于11月4日《英國醫學雜志》。

雖然之前基于小范圍、高選擇性隊列的研究表明，WGS可以識別線粒體疾病，但這是第一次在國家醫療保健系統中檢驗其有效性。

該研究涉及319個疑似線粒體疾病的家庭，總共345名參與者，年齡范圍為0~92歲，平均年齡為25歲，均進行了全基因組測序。通過不同的分析，研究人員發現他們可以對98個家庭(31%)做出明確或可能的遺傳診斷。98個家庭中有2%的家庭被診斷為6種可能的疾病。總共涉及到95個不同的基因。

令人驚訝的是，62.5%的診斷結果實際上是非線粒體疾病，這是因為許多不同的疾病都類似于線粒體疾病，使得人們很難分清。

英國醫學研究委員會線粒體生物研究組和劍橋大學臨床神經科學系教授Patrick Chinnery教授說：“我們建議，在肌肉活檢等侵入性檢查之前，應該盡早提供全基因組測序。”

研究人員的診斷結果中，有37.5%是由已知的線粒體疾病基因引起的。這些診斷幾乎都是特定家庭成員獨有的，反映了疾病的遺傳多樣性。

線粒體功能受損往往會影響高能量需求的組織，如大腦、周圍神經、心臟等。然而，該團隊的大多數診斷(62.5%)是非線粒體疾病，其特征類似線粒體疾病。如果只是通過肌肉活檢和/或特定的線粒體基因板對參與者進行線粒體疾病調查，這些疾病就會被忽略。

Chinnery說:“這些病人被轉診是因為疑似線粒體疾病，而傳統的診斷測試是專門針對線粒體疾病的。除非你考慮到其他的可能性，否則你不會診斷它們。全基因組測序不受這種偏見的限制。”

Chinnery表示，英國的診斷服務支離破碎，分布不均，這給罕見疾病患者及其家人帶來了重大挑戰。通過實施基于全基因組方法的國家規劃，可以向每個人提供同等水平的服務。