1.所采集的檢驗樣品一定要具有代表性，采樣時應首先對該批食品原料、加工、運輸、貯藏方法條件、周圍環境衛生狀況等進行詳細調查，檢查是否有污染源存在。
2.根據食品的種類及數量，采樣數量及方法應按標準檢驗方法的要求進行。
3.采樣應注意無菌操作，容器必須滅菌，避免環境中微生物污染，容器不得使用煤酚皂溶液，用新潔爾滅、酒精等消毒藥物滅菌，更不能含有此類消毒藥物或抗生素類藥物，以避免殺死樣品中的微生物，所用剪、刀、匙用具也需滅菌方可應用。
4.樣品采集后應立即送往檢驗室進行檢驗，送檢過程中一般不超過3h，如，路程較遠，可保存在1~5℃環境中，如需冷凍者，則在凍存狀態下送檢
5.檢驗室收到樣品后，進行登記（樣品名稱、送檢單位、數量、日期、編號等），觀察樣品的外觀，如果發現有下列情況之一者，可拒絕檢驗：
(1)樣品經過特殊高壓、煮沸或其他方法殺菌者，失去代表原食品檢驗意義者；
(2)瓶、袋裝食品已啟開者，熟肉及其制品、熟禽等食品已折碎不完整者，即失去原食品形狀者（食物中毒樣品除外）；
(3)按規定采樣數量不足者；
對送檢符合要求的樣品，檢驗室收到后，應立即進行檢驗，如果條件不具備，應置4℃冰箱存放，及時準備創造條件，然后進行檢驗。
6.樣品檢驗時，根據其不同性狀，進行適當處理。
(1)液體樣品接種時，應充分混合均勻，按量吸取進行接種。
(2)固體樣品，用滅菌刀、剪取其不同部位共25g，置于225mL滅菌生理鹽水或其他溶液中，用均質器攪碎混勻后，按量吸取接種。
(3)瓶、袋裝食品應用滅菌操作啟開，根據性狀選擇上述方法處理后接種。