組分的分離平衡會受到色譜柱與流動相的溫度的影響，使用柱溫箱有如下好處。
1.溫度低的時候，由于流動相黏度增加而延長了檢測時間，同時使泵的磨損增加了，對設備的使用壽命產生了影響。
2.當溫度比較低的時候，還由于溶解度相對下降而有緩沖鹽結晶出現，導致泵進樣閥、管道、色譜柱被堵塞。
3.當溫度比較低的時候，還由于降低了溶解度，而在填料上吸附了雜質，洗脫困難，從而對色譜柱的使用壽命產生影響。到目前為止，暫時還沒有比較好的方法來對流動相溫度進行控制。就算在整個室內使用空調，保持流動相的溫度相同也比較困難，所以，到目前為止，控制柱溫是Z常被采用的方法。使用柱溫箱有著比較低的能耗以及比較高的控溫精度，為液相色譜儀必備的輔助設備,藥品標準中,有不少品種對柱溫也有明確要求。
4.能夠保持保留時間的相對恒定，能夠使需要進行的定性鑒的可信度得以提高。
5.定量的進行是基于保留時間的相對恒定，如果保留時間不一樣，不但不可以對其成分的一致性進行判斷，與此同時，因為不一樣的保留時間，也會改變峰面積，使得檢測結果的可信度降低。
6.當存在比較大的溫度差的時候，由于保留時間不穩定，將會使得檢測工作的麻煩增加。