多能干細胞的簡單獲得人類多能性干細胞系的建立有兩個來源，其方法與以往在動物模型中建立的方法相同。
（1） 在Dr. Thomson進行的工作中，他從人類胚胎的囊胚期內細胞群中直接分離多能干細胞。Dr. Thomson從IVF（體外受精）臨床實驗室得到胚胎，這些胚胎是不育癥臨床治療不需要的，用于繁殖，而非研究目的。從捐獻者夫婦處獲得知情同意書后，Dr. Thomson分離了內細胞群，將這些細胞進行培養，產生一個多能性干細胞系。
（2） 與此相反，Dr. Gearheart從終止妊娠的胎兒組織中分離出多能性干細胞。捐獻者自行決定了終止妊娠，從他們那兒獲得了知情同意書后，Dr. Gearheart從原本要發育成睪丸或卵巢的胎兒部位取得細胞。盡管Dr. Thomson 實驗室和Dr. Gearheart實驗室使用的細胞系來源不同，但發育成熟的細胞看起來非常相似。
體細胞核轉移（SCNT）是得到多能性干細胞的另一種途徑。在SCNT的動物研究中，研究者將一個正常的動物卵細胞去除細胞核（含染色體的細胞結構）。存留在卵細胞內的物質含營養成分和對胚胎發育非常重要的能量物質。而后，在非常精細調控的實驗室條件下，將單個體細胞——除卵細胞或精子細胞之外的任一種細胞——與除去核卵細胞放在一起，使兩者相融合。融合細胞以及其子細胞具有發育成一個完整個體的潛能，因此是全能性的。正如圖I所示，這些全能性細胞不久將形成胚囊，從理論上來說，可利用胚囊的內細胞群來建立多能性干細胞系。實際上，任何一種可生成人類胚囊細胞的方法都有可能成為人體多能性干細胞的來源。