異染色質分為結構異染色質和功能異染色質兩種類型。結構異染色質是指各類細胞在整個細胞周期內處于凝集狀態的染色質，多定位于著絲粒區、端粒區，含有大量高度重復順序的脫氧核糖核酸（DNA），稱為衛星DNA（satellite DNA）。功能異染色質只在一定細胞類型或在生物一定發育階段凝集，如雌性哺乳動物含一對X染色體，其中一條始終是常染色質，但另一條在胚胎發育的第16～18天變為凝集狀態的異染色質，該條凝集的X染色體在間期形成染色深的顆粒，稱為巴氏小體（Barr body）。
