1，用于顯微切割的組織切片可以是冰凍切片、石蠟包埋的組織切片或細胞涂片。切片的厚度可為4~10µm，冰凍切片需經甲醛或乙醇固定。
2，用于顯微切割的組織切片還必須染色，以便于進行目標細胞群或單一細胞的定位。染色可以用普通方法，如1%~2%的甲基綠、0.1%的核固紅、3.6%的瑞氏染液或2%的蘇木素等，也可用免疫組織化學染色，如要切割霍奇金淋巴瘤組織切片上的R－S細胞時，可用CD15或CD30單克隆抗體染色進行靶細胞示蹤。
3，顯微切割的方法有手工操作法和激光捕獲顯微切割(laser capture microdissection ,LCM)技術，后者的基本原理是：將組織切片放在倒置顯微鏡的載物臺上，并在切片表面覆蓋一層乙烯乙酸乙烯酯(ethylene vinyl acetate ,EVA)薄膜。激光束從切片的上方垂直射下來，使其光路與顯微鏡聚光器的光路共軸，光斑正好落在顯微鏡視野中心，即要切割的區域。該區的EVA膜揭起來，與之相連的細胞也隨之被完好地從切片上切割下來；將帶有細胞的EVA膜放入試管內經蛋白酶消化使細胞與膜分開，同時也將細胞裂解，獲得待提物質，如DNA，RNA或蛋白質等。