本病預后取決于治療早晚，抗生素對原發細菌的控制能力，心臟瓣膜的損傷程度及患者的抵抗能力，金黃色葡萄球菌、溶血性鏈球菌、肺炎雙球菌、革蘭氏陰性桿菌等，由于細菌毒力強，可較快使感染的瓣葉損傷，在抗生素治療過程中若出現心力衰竭或原心力衰竭加重，出現新的雜音或雜音多變，有栓塞現象等，均為感染不能控制的征兆，需考慮更換抗生素。加強支持療法，改善一般情況后，爭取早日手術，延遲過久，病情可能進行性惡化，常喪失手術機會。
