磷酸二酯酶1
PDE1有3種同功酶：PDE1A、1B和1C，分別由不同的基因編碼。PDE1的催化活性是通過兩個CaM結合區域來調控的，然而每種同功酶都有其被激活的獨特Ca閾值。PDE1C可同等地水解cAMP和cGMP，能下調葡萄糖刺激的胰島素分泌。PDE1A和PDE1B主要水解cGMP。3種PDE1的分布均有其確定的組織和細胞定位。PDE1B主要在腦和淋巴細胞表達，有絲分裂刺激后，其表達增加。目前已知的 PDE1抑制劑有Vinpoeetin、Phenothiazine、SCH51866等，但它們缺乏特異性。鑒于PDE1基因的多樣性及其可能在Ca 和核苷酸信號通路發揮交互聯系的作用，提示其在治療中樞神經系統、心血管和免疫系統紊亂中有一定意義。
磷酸二酯酶2
3種cGMP刺激的髓碴s POE2A1、A2和A3都是一個基因的產物，但由于各外顯子連接的不同，它們的氨基酸存在差異。PDE2顯示出不同的組織和亞細胞分布。膜結合的酶存在于腦和心臟．而可溶性的酶則存在于肝臟和血小板。PDE2亦分布于T細胞．當抗原受體結合后，胸腺細胞PDE2活性下調。在胸腺細胞，依細胞內cGMP的濃度的不同．對cAMP代謝的控制可使PDE4轉換為PDE2。與此相似，在血小板，PDE2的作用有賴于環核苷酸的濃度：低cAMP濃度時，PDE2的活性依賴于cGMP；高cAMP濃度時，無論cGMP存在與否，PDE2水解cAMP。在心臟，cAMP和cGMP的濃度相互依賴，提示PDE2和PDE3抑制劑可在治療心絞痛、高血壓和心衰中發揮作用。EHNA[erythro-9一(2-hydroxy一3-nonyt j adenine)為中等效能的PDE2選擇性抑制劑；也是腺苷脫氨酶的強抑制劑，因此可致腺苷聚集，并經由受體調控cAMP水平。cGMP和腺苷的協同作用也有利于心律失常的治療 。
磷酸二酯酶3
人類PDE3的兩種同功酶PDE3A 和PDE3B是分別位于染色體1 2和11上的不同基因的產物。PDE3A和PDE3B的催化區域均包含一互不相同的44個氮基酸插入段。這44個氨基酸的不同不僅使PDE3A 和PDE3B相互區分，亦使PDE3的催化部位有別于其它類型的PDEs。PDE3A 和PDE3B的mRNA 分布于不同的組織和細胞：在血小板、心臟和血管平滑肌富含PDE3A，而PDE3B 主要分布在脂肪細胞和T 淋巴細胞 “許多PDE3抑制劑被視作強效血管擴張劑和兼有抗血小板活性的藥物而用于治療心衰，然而，前瞻性的隨機的Milrinone生存評估測試顯示：反復口服給予PDE3抑制劑Milrlnone會增加心衰病人的死亡率。故僅少數PDE3抑制劑如Milrinone、Aminone、Enoximone可以急性、短期靜脈給藥治療心衰，同時須密切監測病人是否會出現室性心律失常增加的情況。PDE3B抑制劑可調節T淋巴細胞功能，人類T 細胞以PDE3和PDE4占優勢，PDE3和PDE4抑制劑相互協同，能強有力地抑制T細胞受體介導的細胞因子的產生和有絲分裂的擴增 。
磷酸二酯酶4
人類PDE4的同功酶具多樣性，分4種亞型：PDE4A、4B、4C和4D。PDE4與多種炎性細胞的cAMP水解有關，因此，抑制PDE4可抑制免疫和炎癥細胞。而且，cAMP介導氣道平滑肌松弛。與口腎上腺素受體激動劑相比，PDE4抑制劑擴張支氣管的作用較弱。PDE4 抑制劑Rolipram、Denbufylline、CDP840、CP80633、Ro20 1724等可能成為新型抗炎藥物 。CDP840用于哮喘的治療．CP80633能減少特異反應性的病人的皮膚病變部位的炎癥。選擇性PDE4亞型抑制劑的開發將有可能增強療效而減少不良反應。新型、強效PDE4抑制劑1-pyridy|naph—thalene的一系刊衍生物顯示出良好的抗哮喘作用且少有嘔吐及心血管方面的不良反應 。
磷酸二酯酶5
與PDE1和PDE2不同，PDE5絕對專一地水解cGMP，且無同功酶。PDE5包含兩個立體異構的cGMP結合位點，串聯地排列于蛋白質的氨基端 cGMP與此兩位點的結合并不直接影響酶的催化活性，但影響酶被PKA磷酸化的能力 。PDE5抑制劑有Zaprinast，Viagm CSilaenaft1)，E4021等。cGMP中介NO介導的內皮松弛和ANF介導的利尿作用。通過抑制PDE5而使胞內cGMP升高將有利于高血壓、充血性心力衰竭、冠狀動脈疾病和心絞痛的治療，且PDE5抑制劑尚有拭血小板和抗血栓活性。此外，PDE5抑制劑能降低肺動脈壓力并對心率影響極少，有望成為新型的選擇性的肺動脈擴張劑。E-4010是一種選擇性的PDE5抑制劑，能夠緩解缺氧所致的大鼠肺動脈高壓。長期使用E-4010能降低monoer~aline所引發的肺動脈高壓大鼠的死亡率“ FDA 已批準Viagra用于治療男性陽痿和勃起功能障礙。人海綿體上主要分布有PDE5，還有PDE2和PDE3l2 。用PGE1和Forskolin研究結果提示陰莖平滑肌也可通過cAMP介導松弛 。因此，Viagra尚有可能通過cGMP中介的PDE3抑制而升高cAMP 發揮作用。在Viagra的Ⅰ期試驗中，有3 的病人出現視覺徽染藍綠色，可能是由于視網膜功能的短暫的、可逆性的改變而造成。這主要是因為Viagra，E-4021等對PDE5和PDE6選擇性不高所造成。研制第三代PDE5抑制劑將對PDE5絕對專一性作用為方向。
磷酸二酯酶6
PDE6是光感受器細胞進行光轉換級聯反應過程中重要的酶。它的活性受異三聚體G蛋白的調控。視桿細胞PDE6全酶是一個四聚體蛋白質，它包括α、β兩個大催化亞基和兩個具有PDE6抑制作用的小γ亞基。在暗反應光感受器，γ亞基有低水平的PDE6活性。遇光后，視色素視紫紅質激活視網膜G蛋白(即轉導子)，使γ亞基發揮抑制PDE6的活性。而且，除了水解cGMP的活性部位，α、β兩個催化亞基有高親和力的非催化cGMP的結臺位點，這些非催化位點不直接調控在活性位點的cGMP的催化，而是調控γ亞基對催化亞基的親和 。
磷酸二酯酶7
PDE7A1和PDE7A2是同一基因在表達上不同接合的變型，二者的mRNA均在多種組織中普遍表達。然而蛋白質的表達則有嚴格限制，提示PDE7的功能角色使其蛋白質的翻譯受到高度調控。在T淋巴細胞中已發現PDE7A1活性和蛋白質。抑制PDE7可能有利于治療某些免疫功能紊亂。
8 其他磷酸二酯酶
目前，還認定了PDE8、PDE9、PDE10和PDE11。PDESA是一種cAMP選擇性酶，對非選擇性PDE 抑制劑1BMX 不敏感，但可被Dipyridimole所抑制。PDE9A是一種高度親和性的cGMP專一的PDE，可被Zaprinast輕度抑制。PDE9缺乏與PDE2、5、6相似的cGMP結合的立體異構區域。PDEgA的mRNA 在腎臟高度表達 Ⅲ 。PDE10A 水解cAMP和cGMP，其RNA 在睪丸和腦組織中高度表達 。