轉錄因子的結合位點（transcription factor binding site，TFBS）是轉錄因子調節基因表達時，與基因模板鏈結合的區域。按照常識，轉錄因子（transcription factor）的結合位點一般應該分布在基因的前端，但是，新的研究發現，人21和22號染色體上，只有22%的轉錄因子結合位點分布在蛋白編碼基因的5'端。
