剛從mRNA序列翻譯過來的蛋白質都是未折疊或無規卷曲的多肽,沒有任何的三維結構。氨基酸彼此相互作用使得多肽從無規卷曲折疊成其特征性和功能性三維結構。氨基酸序列決定l了蛋白質的三維結構,且正確的三維結構對于功能至關重要,盡管功能蛋白的某些部分可能仍未展開。伴侶蛋白的酶有助于新形成的蛋白質獲得折疊,成為它發揮作用需要的三維結構。輔助蛋白質折疊是真核生物內質網的主要作用之一。