泛素結合酶E2可以被進一步分為四個類:有些僅僅有UBC結構域組成E2為第Ⅰ類,他們需要E3來進行底物識別;除了核心結構域之外,C末端具有延伸部分的屬于第Ⅱ類;N末端具有延伸部分的屬于第Ⅲ類;C末端和N末端都有延伸區域的歸為第Ⅳ類 。